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本系列课程学习的文章是：AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA processing factors. Nat Commun 2016 Nov 8;7:13347. PMID: 27824034 PCR数据证实 小鼠的也是如此 确定可变外显子使用是AKAP95的直接影响， 他们比 …
5分文章难吗？掌握好套路，其实也没那么难。 今天小编就以一篇今年5月23日发表在Cell Death and Disease（IF=5.638）上的一篇文章为例来总结一下5分文章的套路。 先看一下文章标题，完全包含了文章的四要素：分子、表型、机制、疾病。 期刊详情
佛罗里达大学、加州大学Irvine分校等单位的研究人员在一月二十六日的Genome Biology杂志上发表文章，概述了RNA-seq生物信息学分析的现行标准和现有资源，为人们提供了一份带有注释的RNA-seq数据分析指南。这将成为开展RNA-seq研究的宝贵
哪怕是到了2018年，RNA-seq仍然可以不做重复. 先申明，只是说可以，但是并不推荐这样做！. ！. ！. 很多benchmark文章推荐做RNA-seq的时候，每个处理最好是做5个以上的重复，当然，研究者为了节约经费，通常只做3个重复，更有甚者做两个也行。. 但是只做一个 ...
2月9日和12日，中科院上海营养与健康研究所杨力研究组受邀在SCIENCE CHINA Life Sciences和Methods杂志分别发表题为“Fast and Furious: insights of back splicing regulation during nascent RNA synthesis”的综述论文和“CIRCexplorer pipelines for circRNA annotation and quantification from non-polyadenylated RNA-seq datasets”的方法论著文章。
Single cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder. Autoencoder ：机器学习中的自动编码器，这篇文章里面用的是去噪编码器，坊间称之为denoise autoencoder (DAE)，在sc-RNAseq中除去dropout的噪声是非常理想的一种模型。. Therefore，这篇文章已经发表在了NC的18年预印 …
在这不平凡的2020年，生信SCI发文量如何？ 对2020年所有生信文章的发表期刊进行统计，以下列举出接收生信文章量大于30篇的期刊，根据接收量排序如下： J Cell Mol Med …
今天解读的这篇文章出自华南理工大学，是研究纤维弧菌的，作者只做了4个样品的RNA-seq，并且无生物学重复，也发了4.5分。 而这篇文章所有的RNA-seq分析都是在基迪奥做的，那作者究竟是怎么做到的，我 …
发表期刊：Journal of integrative plant biology（IF 4.885） 材料选择：渗透胁迫处理下的桦树BpHOX2过表达株系&野生型株系 文库构建：普通转录组文库、ChIP-Seq文库 主要内容 同源域-亮氨酸zipper（HD-Zip）蛋白在植物发育和环境反应中发挥着重要的作用。
2020年，转录组类文章到底有多难发？. 从这篇文章我们可以看到，文章并没有你想像中的难发，我试着从中提炼以下几点，希望对您有所借鉴。. 1. 实验设计相对合理，层级递进，取样点与植物防卫三级级联反应基本对应，后续分析论述层次较为分明。. 2. 转录组 ...
本系列课程学习的文章是：AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA processing factors. Nat Commun 2016 Nov 8;7:13347. PMID: 27824034 PCR数据证实 小鼠的也是如此 确定可变外显子使用是AKAP95的直接影响， 他们比 …
5分文章难吗？掌握好套路，其实也没那么难。 今天小编就以一篇今年5月23日发表在Cell Death and Disease（IF=5.638）上的一篇文章为例来总结一下5分文章的套路。 先看一下文章标题，完全包含了文章的四要素：分子、表型、机制、疾病。 期刊详情
佛罗里达大学、加州大学Irvine分校等单位的研究人员在一月二十六日的Genome Biology杂志上发表文章，概述了RNA-seq生物信息学分析的现行标准和现有资源，为人们提供了一份带有注释的RNA-seq数据分析指南。这将成为开展RNA-seq研究的宝贵
哪怕是到了2018年，RNA-seq仍然可以不做重复. 先申明，只是说可以，但是并不推荐这样做！. ！. ！. 很多benchmark文章推荐做RNA-seq的时候，每个处理最好是做5个以上的重复，当然，研究者为了节约经费，通常只做3个重复，更有甚者做两个也行。. 但是只做一个 ...
2月9日和12日，中科院上海营养与健康研究所杨力研究组受邀在SCIENCE CHINA Life Sciences和Methods杂志分别发表题为“Fast and Furious: insights of back splicing regulation during nascent RNA synthesis”的综述论文和“CIRCexplorer pipelines for circRNA annotation and quantification from non-polyadenylated RNA-seq datasets”的方法论著文章。
Single cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder. Autoencoder ：机器学习中的自动编码器，这篇文章里面用的是去噪编码器，坊间称之为denoise autoencoder (DAE)，在sc-RNAseq中除去dropout的噪声是非常理想的一种模型。. Therefore，这篇文章已经发表在了NC的18年预印 …
在这不平凡的2020年，生信SCI发文量如何？ 对2020年所有生信文章的发表期刊进行统计，以下列举出接收生信文章量大于30篇的期刊，根据接收量排序如下： J Cell Mol Med …
今天解读的这篇文章出自华南理工大学，是研究纤维弧菌的，作者只做了4个样品的RNA-seq，并且无生物学重复，也发了4.5分。 而这篇文章所有的RNA-seq分析都是在基迪奥做的，那作者究竟是怎么做到的，我 …
发表期刊：Journal of integrative plant biology（IF 4.885） 材料选择：渗透胁迫处理下的桦树BpHOX2过表达株系&野生型株系 文库构建：普通转录组文库、ChIP-Seq文库 主要内容 同源域-亮氨酸zipper（HD-Zip）蛋白在植物发育和环境反应中发挥着重要的作用。
2020年，转录组类文章到底有多难发？. 从这篇文章我们可以看到，文章并没有你想像中的难发，我试着从中提炼以下几点，希望对您有所借鉴。. 1. 实验设计相对合理，层级递进，取样点与植物防卫三级级联反应基本对应，后续分析论述层次较为分明。. 2. 转录组 ...
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