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小分子糖及其类似物与α-葡萄糖苷酶的分子对接[J].食品科学,2020,41(8):139-143. 2 王颖颖,刘巍,孟凡翠,汤立达.盐皮质激素受体拮抗剂的虚拟筛选[J].中国新药杂志,2020(6):655 3 任小利,杨鴻艳,林思园,叶磊,于齐
文献报道过的或者没报道过的分子对接软件有很多，很多最初都是由实验室开发，免费发布。当软件很完善，没有什么缺陷时，可能会被专门的商业软件公司购买，就变成了某个大型软件包中的模块。其实不止分子对接软件，其他还有药效团软件、定量构效关系软件、数据库筛选软件等，都是这样的 ...
侯廷军,章威,徐筱杰. Hydroxamate类抑制剂与MMP-2的分子对接研究[J]. 化学学报, 2001, 59(8): 1184-1189. Hou Tingjun;Zhang Wei;Xu Xiaojie. Molecular docking simulations between hydroxamates and …
4月份Science杂志上发表了一系列人工设计的抑制新冠病毒的药物分子，其中一种α-酮酰胺抑制剂（13b）可能存在比较强的抑制能力。李金金团队随后开展了针对13b以及其他临床药物与新型冠状病毒结合能力机制的研究。病毒蛋白和13b分子对接可视化
一：概述分子对接是指两个或多个分子通过几何匹配和能量匹配相互识别的过程，在药物设计中有十分重要的意义。药物分子在产生药效的过程中，需要与靶酶相互结合，这就要求两个分子要充分接近并采取合适的取向以使二者在必要的部位相互契合，发生相互作用，继而通过适当的构象调整，得到 ...
血管紧张素转换酶抑制剂的分子设计,计算机辅助药物设计;血管紧张素转换酶抑制剂;受体;配体;分子对接,目前,高血压已成为严重危害人类健康的主要疾病之一。在医药市场的药物销售种类中,心血管药物占18%。有调查结果表明,自建国以来,...
Originally posted by zh1987hs at 2011-05-25 09:44:15: 1.AD本身的打分函数未必准确，不一定适合你的体系 2.配体本身的初始结构未必合理，可以以多种初始配体结构进行尝试 3.引用昨天在群里看到的一句话，达到-10的亲和能力都在nmol级别的~-4~-5
13 分子对接的基本方法 （一） 刚性的分子对接方法 这种方法是最初的分子对接的方法，在对接中，小 分子和蛋白质两种都保持刚性。 （1）基于最大团搜索的方法 （Clique-Search Based Approaches） 对接两个刚性分子可以理解为分子在空间的匹配 …
分子对接结果显示，白花蛇舌草和半枝莲药对 25 个活性成分与 38 个靶点部分或全部对接成功。结论 白花蛇舌草和半枝莲药对通过多成分、多靶点、多通路参与宫颈癌细胞凋亡。 宫颈癌主要由感染人乳头瘤病毒（ human papilloma virus ，HPV ）引起 …
蛋白质配体结合位点柔性的系统分析及分子柔性对接方法的发展和应用. 李伟. 【摘要】： 在药物靶标确定和三维结构已知的情况下,基于受体结构的虚拟数据库筛选方法利用分子对接技术自动地匹配受体结合腔穴和化合物数据库中的小分子三维结构,然后利用基于 ...
小分子糖及其类似物与α-葡萄糖苷酶的分子对接[J].食品科学,2020,41(8):139-143. 2 王颖颖,刘巍,孟凡翠,汤立达.盐皮质激素受体拮抗剂的虚拟筛选[J].中国新药杂志,2020(6):655 3 任小利,杨鴻艳,林思园,叶磊,于齐
文献报道过的或者没报道过的分子对接软件有很多，很多最初都是由实验室开发，免费发布。当软件很完善，没有什么缺陷时，可能会被专门的商业软件公司购买，就变成了某个大型软件包中的模块。其实不止分子对接软件，其他还有药效团软件、定量构效关系软件、数据库筛选软件等，都是这样的 ...
侯廷军,章威,徐筱杰. Hydroxamate类抑制剂与MMP-2的分子对接研究[J]. 化学学报, 2001, 59(8): 1184-1189. Hou Tingjun;Zhang Wei;Xu Xiaojie. Molecular docking simulations between hydroxamates and …
4月份Science杂志上发表了一系列人工设计的抑制新冠病毒的药物分子，其中一种α-酮酰胺抑制剂（13b）可能存在比较强的抑制能力。李金金团队随后开展了针对13b以及其他临床药物与新型冠状病毒结合能力机制的研究。病毒蛋白和13b分子对接可视化
一：概述分子对接是指两个或多个分子通过几何匹配和能量匹配相互识别的过程，在药物设计中有十分重要的意义。药物分子在产生药效的过程中，需要与靶酶相互结合，这就要求两个分子要充分接近并采取合适的取向以使二者在必要的部位相互契合，发生相互作用，继而通过适当的构象调整，得到 ...
血管紧张素转换酶抑制剂的分子设计,计算机辅助药物设计;血管紧张素转换酶抑制剂;受体;配体;分子对接,目前,高血压已成为严重危害人类健康的主要疾病之一。在医药市场的药物销售种类中,心血管药物占18%。有调查结果表明,自建国以来,...
Originally posted by zh1987hs at 2011-05-25 09:44:15: 1.AD本身的打分函数未必准确，不一定适合你的体系 2.配体本身的初始结构未必合理，可以以多种初始配体结构进行尝试 3.引用昨天在群里看到的一句话，达到-10的亲和能力都在nmol级别的~-4~-5
13 分子对接的基本方法 （一） 刚性的分子对接方法 这种方法是最初的分子对接的方法，在对接中，小 分子和蛋白质两种都保持刚性。 （1）基于最大团搜索的方法 （Clique-Search Based Approaches） 对接两个刚性分子可以理解为分子在空间的匹配 …
分子对接结果显示，白花蛇舌草和半枝莲药对 25 个活性成分与 38 个靶点部分或全部对接成功。结论 白花蛇舌草和半枝莲药对通过多成分、多靶点、多通路参与宫颈癌细胞凋亡。 宫颈癌主要由感染人乳头瘤病毒（ human papilloma virus ，HPV ）引起 …
蛋白质配体结合位点柔性的系统分析及分子柔性对接方法的发展和应用. 李伟. 【摘要】： 在药物靶标确定和三维结构已知的情况下,基于受体结构的虚拟数据库筛选方法利用分子对接技术自动地匹配受体结合腔穴和化合物数据库中的小分子三维结构,然后利用基于 ...
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