一般认为蛋白质级 结构预测足在蛋白质三级结构预测之前非常重要的一步,但是,一直以来蛋白质二级结构预 测部未能够达到较高的准确率。. 本文主要对蛋白质二级结构预测的新方法进行了探究。. 研究工作的主体思路是:对已知蛋白质的序列和结构进行数据 ...
目的 预测蛋白质二级结构是预测其空间结构的基础,提高蛋白质二级结构的预测率非常重要.方法在本研究中,结合氨基酸的疏水性与含有进化信息的位置特异性得分矩阵(PSSM),构建BP神经网络.本文的数据来源于蛋白质数据集合CB513,在此集合中去除 ...
献给初学者:手把手教你在线预测蛋白质结构. lucky. 最快三周拿到定制抗体,欢迎来咨询:19951390576. 139 人 赞同了该文章. 蛋白质 是生命活动的体现者,其结构决定着功能。. 由线性 氨基酸 组成的蛋白质需要折叠成特定的空间结构才具有相应的生理活性和生物学 ...
基于蛋白质残基统计信息(一肽频数和二肽频数)、物化属性(亲疏水性倾向)、进化信息(特异位置得分矩阵)进行特征表示,使用支持向量机算法构建蛋白质二级结构预测模型。 一、背景 1、蛋白质 (1)蛋白质组成 蛋白质由氨基酸组成。氨基酸序所包含的基本信息
摘要: 本文提出了一个蛋白质二级结构预测结果的综合分析方法, 它综合了常用的几种二级结构预测法(Chou-Fasman方法、Garnier方法, Cohen方法、疏水性分析法), 取各方法之长, 对由每种方法得到的有差别的结果进行综合分析, 经过这样处理, 可使蛋白质二级结构预测精度提高7%左右。
蛋白质结构与功能的预测方法总结和资料汇总 “折叠(fold)”的概念 “折叠(fold)”是近年来蛋白质研究中应用较广的一个概念,它是介与二级和三级结构之间的蛋白质结构层次,它描述的是二级结构元素的混合组合方式。 一. 二级结构的预测方法介绍
【摘要】:理解蛋白质的氨基酸序列与其结构之间的潜在关系是结构生物信息学中的一个基本问题。由于直接从氨基酸序列预测蛋白质的三维结构是极其困难的,因此一个中间但非常有效的步骤是预测蛋白质的8类二级结构。特别地,蛋白质的二级结构预测信息不仅有助于确定蛋白质的三维结构,而且 ...
蛋白质结构相关 相似结构搜索:PDBeFold 二级结构预测:CFSSP, GOR4, PORTER, PsiPred, Jpred 三级结构预测:I-TASSER,SwissModel,D-QUARK, RaptorX 突变结构预测:RosettaBackrub 短肽结构预测:PEP-FOLD 螺旋结构作图:Wheel, 跨膜β 桶
蛋白质二级结构预测采用何种氨基酸编码方式会对预测精度有很大影响。选择具有较好的分类能力的支持向量机进行蛋白质二级结构预测。建立二级结构预测模型,分析比较正交编码、5位编码、Codon编码(基本)、Codon编码(扩展)和Profile编码等5种氨基酸编码方案
一般认为蛋白质级 结构预测足在蛋白质三级结构预测之前非常重要的一步,但是,一直以来蛋白质二级结构预 测部未能够达到较高的准确率。. 本文主要对蛋白质二级结构预测的新方法进行了探究。. 研究工作的主体思路是:对已知蛋白质的序列和结构进行数据 ...
目的 预测蛋白质二级结构是预测其空间结构的基础,提高蛋白质二级结构的预测率非常重要.方法在本研究中,结合氨基酸的疏水性与含有进化信息的位置特异性得分矩阵(PSSM),构建BP神经网络.本文的数据来源于蛋白质数据集合CB513,在此集合中去除 ...
献给初学者:手把手教你在线预测蛋白质结构. lucky. 最快三周拿到定制抗体,欢迎来咨询:19951390576. 139 人 赞同了该文章. 蛋白质 是生命活动的体现者,其结构决定着功能。. 由线性 氨基酸 组成的蛋白质需要折叠成特定的空间结构才具有相应的生理活性和生物学 ...
基于蛋白质残基统计信息(一肽频数和二肽频数)、物化属性(亲疏水性倾向)、进化信息(特异位置得分矩阵)进行特征表示,使用支持向量机算法构建蛋白质二级结构预测模型。 一、背景 1、蛋白质 (1)蛋白质组成 蛋白质由氨基酸组成。氨基酸序所包含的基本信息
摘要: 本文提出了一个蛋白质二级结构预测结果的综合分析方法, 它综合了常用的几种二级结构预测法(Chou-Fasman方法、Garnier方法, Cohen方法、疏水性分析法), 取各方法之长, 对由每种方法得到的有差别的结果进行综合分析, 经过这样处理, 可使蛋白质二级结构预测精度提高7%左右。
蛋白质结构与功能的预测方法总结和资料汇总 “折叠(fold)”的概念 “折叠(fold)”是近年来蛋白质研究中应用较广的一个概念,它是介与二级和三级结构之间的蛋白质结构层次,它描述的是二级结构元素的混合组合方式。 一. 二级结构的预测方法介绍
【摘要】:理解蛋白质的氨基酸序列与其结构之间的潜在关系是结构生物信息学中的一个基本问题。由于直接从氨基酸序列预测蛋白质的三维结构是极其困难的,因此一个中间但非常有效的步骤是预测蛋白质的8类二级结构。特别地,蛋白质的二级结构预测信息不仅有助于确定蛋白质的三维结构,而且 ...
蛋白质结构相关 相似结构搜索:PDBeFold 二级结构预测:CFSSP, GOR4, PORTER, PsiPred, Jpred 三级结构预测:I-TASSER,SwissModel,D-QUARK, RaptorX 突变结构预测:RosettaBackrub 短肽结构预测:PEP-FOLD 螺旋结构作图:Wheel, 跨膜β 桶
蛋白质二级结构预测采用何种氨基酸编码方式会对预测精度有很大影响。选择具有较好的分类能力的支持向量机进行蛋白质二级结构预测。建立二级结构预测模型,分析比较正交编码、5位编码、Codon编码(基本)、Codon编码(扩展)和Profile编码等5种氨基酸编码方案