代谢组学数据分析可分几个步骤:对检测得到的原始数据进行数据预处理、数据质控、代谢物定性定量、通过生信分析挖掘数据。 |数据预处理 通过软件解析色谱和质谱得到的图谱转变为可计算的数据文件,即得到原始数据后,为了消除存在的外在或人为的干扰因素,需要预处理增加数据的稳定性。
也可以使用“Structure-based search”功能通过绘制化合物结构来进行化合物检索。其中,超过一半的数据是从LMSD数据库导入或者使用LIPIDMAPS Tool来生成,覆盖了13个类别的脂质类化合物。由于LipidBlast数据库主要是基于离子阱的CID模式采集的 ...
代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究。代谢组学的研究需要高灵敏度、高通量且稳定性好的方法,所以检测平台的选择也是至关重要,今天小析姐就和大家聊一聊代谢组学和代谢组学的研究检测技术 。
代谢组学是目前关注度颇高的组学方向:其一,大家普遍认可代谢物是反映生物表型、状态的最有效分子;其二,代谢物被认为是功能分子、信号分子,其慢慢与功能组相挂钩;其三,肠道微生物等新兴研究热点的带动。 在…
期刊 发现 社区 招聘老师 当前位置: 首页 > 生物科学 > 代谢组学领域的主要杂志有哪些 呢 代谢组学领域的主要杂志有哪些呢 作者 1006641214 来源: 小木虫 1250 25 举报帖子 +关注 请问最好有top 10 返回小木虫查看更多 分享至: 更多 今日热帖 ...
代谢组学主要是以非靶向(Untargeted metabolomics)和靶向(Targeted metabolomics)代谢组学研究为主。 本期小鹿依然以代谢组学研究为主导,分享代谢组学在动物研究中的应用实例:5篇文章、5本期刊、5种物种、总计影响因子:37分,助力您动物方向代谢组学的研究思路。
本人有一篇关于代谢组学的文章,是针对正常人组和某种心血管疾病组的临床血样的代谢组学研究,分析了biomarkers和相关通路,数据没有太多,不涉及给药组,也没有创新性。先后投了BiomedicalChromatography ...
一、样本量不大且只做代谢组学并直接发文章. 根据实验设计的具体不同以及选用的代谢组学方法的差异,可以发2-5分(也有少数情况大于5分的),案例如下:. 1、Identification and Quantitation of Unique Fatty Acid Oxidation Products in Human …
代谢物的鉴定流程 蛋白组比基因组和转录组落后一档次,代谢组学比蛋白组又落后一档次,仅化合物的鉴定就让人头疼。 流程如下: 化合物精确质量数 数据库检索 一级鉴定(筛选分子量相同的离子)。 解决质量数问
代谢组学数据分析可分几个步骤:对检测得到的原始数据进行数据预处理、数据质控、代谢物定性定量、通过生信分析挖掘数据。 |数据预处理 通过软件解析色谱和质谱得到的图谱转变为可计算的数据文件,即得到原始数据后,为了消除存在的外在或人为的干扰因素,需要预处理增加数据的稳定性。
也可以使用“Structure-based search”功能通过绘制化合物结构来进行化合物检索。其中,超过一半的数据是从LMSD数据库导入或者使用LIPIDMAPS Tool来生成,覆盖了13个类别的脂质类化合物。由于LipidBlast数据库主要是基于离子阱的CID模式采集的 ...
代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究。代谢组学的研究需要高灵敏度、高通量且稳定性好的方法,所以检测平台的选择也是至关重要,今天小析姐就和大家聊一聊代谢组学和代谢组学的研究检测技术 。
代谢组学是目前关注度颇高的组学方向:其一,大家普遍认可代谢物是反映生物表型、状态的最有效分子;其二,代谢物被认为是功能分子、信号分子,其慢慢与功能组相挂钩;其三,肠道微生物等新兴研究热点的带动。 在…
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本人有一篇关于代谢组学的文章,是针对正常人组和某种心血管疾病组的临床血样的代谢组学研究,分析了biomarkers和相关通路,数据没有太多,不涉及给药组,也没有创新性。先后投了BiomedicalChromatography ...
一、样本量不大且只做代谢组学并直接发文章. 根据实验设计的具体不同以及选用的代谢组学方法的差异,可以发2-5分(也有少数情况大于5分的),案例如下:. 1、Identification and Quantitation of Unique Fatty Acid Oxidation Products in Human …
代谢物的鉴定流程 蛋白组比基因组和转录组落后一档次,代谢组学比蛋白组又落后一档次,仅化合物的鉴定就让人头疼。 流程如下: 化合物精确质量数 数据库检索 一级鉴定(筛选分子量相同的离子)。 解决质量数问