1、什么是转录组测序?转录组广义上指在某一生理条件下,细胞内所有转录组产物的集合,包括:mRNA、ncRNA、rRNA等;狭义上指所有mRNA的集合。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主要包括 ...
1.该杂志侧重于生物信息分析,通俗来说就是以表观(DNA甲基化、组蛋白修饰、non-coding RNA,染色质结构等)为主的各种组学,可配合转录组和基因组。湿实验方面,配少量形态学、流式和qPCR验证的小实验即可,不需要生信分析后续的功能验证实验。
关于实验小编也是初来乍到,今天先和大家探讨最常见的转录组测序后的验证方法。转录组的验证方法有点多(如表达量验证、亚细胞定位、RNA结合蛋白、功能获得验证、功能缺失验证等),本篇只先介绍表达量验证、RNA结合蛋白、亚细胞定位,其余的下期见!
各位大侠,我这有一个植物材料,含一个对照,两种处理(各3个样),一共7个样品的转录组测序结果,没有时间进行进一步的验证了,请问可以投什么样的杂志?请推荐周期相对短一些的,收费的也可以,谢谢!只要有用,最少奖励5枚金币,上不封顶!
下面我们来看看不同档次的生信类SCI最喜欢发表的期刊(或者期刊最喜欢生信类文章吧) (1)1~2分的生信SCI期刊 很显然这个档次的工作量不会很大,往往都不需要做任何的湿实验,没有Q-PCR实验、细胞功能实验这些,有的只是:基因的表达差异分析、蛋白互作网络分析、临床资料的回 …
下期关于转录组相关的实验验证如功能获得&缺失、细胞模型&动物模型见!参考文献: Zhang T , Tan P , Wang L , et al. RNALocate: A resource for RNA subcellular localizations[J]. Nucleic Acids Research, 2016, 45(Database issue).
大家做完转录组测序之后,通常都需要用qPCR来验证一下测序结果的准确性。但是我们也偶尔会遇到转录组测序结果和qPCR结果不一致的现象,出现这样的问题总会让研究者“糟心”,不知如何是好...
但是随着组学研究的 普及,从 文章 发表的要求来看,验证已经成为标配。现在 拿到 蛋白组下机 结果,分析出了差异 蛋白,如何针对得到的 蛋白 进行验证?想必大家都 很 苦恼。现在 小编 就为大家总结一下常见的 蛋白组学验证 方法。 一:定性定量 1.
空间转录组联合,恰到好处. 上面的思路,是单细胞最为常见的分析套路。. 做到这一步,根据单细胞层面的数据,大家对于所研究的细胞群体会有初步的认识。. 继续朝下深入的话,一般有两个思路,功能验证和 组学 联合。. 功能验证的思路,以后有机会可以再 ...
相信做转录组学研究都想发个高分SCI文章,那文章中qPCR验证是绝对不可缺少的。 那为什么要做qPCR验证?怎样去筛选基因进行验证呢?今天要讲的是 解读完RNA-Seq报告后面的事情——qPCR验证 。随着基因测序技术的发…
1、什么是转录组测序?转录组广义上指在某一生理条件下,细胞内所有转录组产物的集合,包括:mRNA、ncRNA、rRNA等;狭义上指所有mRNA的集合。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主要包括 ...
1.该杂志侧重于生物信息分析,通俗来说就是以表观(DNA甲基化、组蛋白修饰、non-coding RNA,染色质结构等)为主的各种组学,可配合转录组和基因组。湿实验方面,配少量形态学、流式和qPCR验证的小实验即可,不需要生信分析后续的功能验证实验。
关于实验小编也是初来乍到,今天先和大家探讨最常见的转录组测序后的验证方法。转录组的验证方法有点多(如表达量验证、亚细胞定位、RNA结合蛋白、功能获得验证、功能缺失验证等),本篇只先介绍表达量验证、RNA结合蛋白、亚细胞定位,其余的下期见!
各位大侠,我这有一个植物材料,含一个对照,两种处理(各3个样),一共7个样品的转录组测序结果,没有时间进行进一步的验证了,请问可以投什么样的杂志?请推荐周期相对短一些的,收费的也可以,谢谢!只要有用,最少奖励5枚金币,上不封顶!
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下期关于转录组相关的实验验证如功能获得&缺失、细胞模型&动物模型见!参考文献: Zhang T , Tan P , Wang L , et al. RNALocate: A resource for RNA subcellular localizations[J]. Nucleic Acids Research, 2016, 45(Database issue).
大家做完转录组测序之后,通常都需要用qPCR来验证一下测序结果的准确性。但是我们也偶尔会遇到转录组测序结果和qPCR结果不一致的现象,出现这样的问题总会让研究者“糟心”,不知如何是好...
但是随着组学研究的 普及,从 文章 发表的要求来看,验证已经成为标配。现在 拿到 蛋白组下机 结果,分析出了差异 蛋白,如何针对得到的 蛋白 进行验证?想必大家都 很 苦恼。现在 小编 就为大家总结一下常见的 蛋白组学验证 方法。 一:定性定量 1.
空间转录组联合,恰到好处. 上面的思路,是单细胞最为常见的分析套路。. 做到这一步,根据单细胞层面的数据,大家对于所研究的细胞群体会有初步的认识。. 继续朝下深入的话,一般有两个思路,功能验证和 组学 联合。. 功能验证的思路,以后有机会可以再 ...
相信做转录组学研究都想发个高分SCI文章,那文章中qPCR验证是绝对不可缺少的。 那为什么要做qPCR验证?怎样去筛选基因进行验证呢?今天要讲的是 解读完RNA-Seq报告后面的事情——qPCR验证 。随着基因测序技术的发…