1.该杂志侧重于生物信息分析.通俗来说就是以表观(DNA甲基化.组蛋白修饰.non-coding RNA.染色质结构等)为主的各种组学.可配合转录组和基因组.湿实验方面.配少量形态学.流式和qPCR验证的小实验即可.不需要生信分析后续的功能验证实验.
所以生信分析的构思可从大数据角度总体概括自己课题组的研究方向。 近 5年(2014年至2019年),小编根据数据库“TGCA”为关键词检索了在pubmed中收录的文章: 当中,TGCA数据库中,有5744篇生信类文章被pubmed收录。而在2008年至2013年期刊,只有
生信多组学整合工具的比较研究. 今天给大家要分享是昆士兰科技大学Sathyanarayanan在Briefings in Bioinformatics(IF: 8.990)杂志上发表的论文。. 作者比较了九种不同的多组学数据整合工具,对多阶段整合工具从基因、功能和通路水平进行评估,对元维度整合工具则从 ...
生信分析中,研究者可使用共表达分析的方法,基于转录组测序数据,分析每个基因的表达模式,最终将不同的基因划入各自所在的表达模式网络中,常用的共表达分析方法主要有两种WGCNA与k-means,大样本量下(15组以上的样本)建议使用WGCNA,该
生信宝典和宏基因组,欢迎大家关注公众号《生信宝典》和《宏基因组》。;生信宝典和宏基因组的主页、动态、视频、专栏、频道、收藏、订阅等。哔哩哔哩Bilibili,你感兴趣的视频都在B站。
详细讲述单细胞转录组测序技术的发展历史,技术特点,数据的处理流程、算法原理以及在癌症、发育领域的应用。 高级生信系列课程:单细胞转录组数据分析-学习视频教程-腾讯课堂
网络药理学+转录组AD候选药物筛选纯生信分析套路 今天跟大家分享的是六月份发表在Bioinformatics杂志(IF:5.61)上的一篇通过对疾病相关基因和药物靶标进行网络分析,筛选出潜在药物,并根据其基因表达谱进一步过滤获得有效药物的文章。
一个生信菜鸟的上道经验分享-转录组测序(转录本组装篇) [爆炸好用神器04]-不会R语言的前提下,一网打尽芯片,测序数据分析!附赠高颜值Figure 相见恨晚!有了它,研究转录调控就像吃饭一样容易。
全转录组测序发不了高分?. 这篇7+思路来教您. 最近小编在阅读文献时发现这么一类文章,与我们知道的传统转录组测序不一样,不单单是研究了mRNA的表达水平,还涉及到了非编码RNA(例如lncRNA,miRNA,circRNA),而这些数据仅仅是一次测序就可以全部获得。. 这 ...
揭开链特异性转录组测序的神秘面纱. 转录组测序(RNA-Seq)是目前应用最为广泛的一种测序方法之一,可以为科研小伙伴们提供整个转录本的信息,可以研究基因的差异表达,确定基因或转录本结构,检测转录本的结构变异,识别可变剪切,发现非编码RNA(non ...
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