在2019年有2400多篇是SCI文章,并且到了2020年更是预计有3300多篇。(截止2020年6月21日有1659篇文章发表,所以我们估算2020年大致为3320篇) 那在这几年里面利用TCGA数据库发表文章前20的杂志有哪些呢?
今天分享一篇TCGA数据挖掘+实验验证的文章,文章发表业内老牌期刊 Oncogene上,影响因子:7.971,中科院最新分区:1区,非OA期刊。参考文章来源:PMID: 33420370 DOI: 10.1038/s41388-020-01635-y。 研究背景:前…
ACE2在TCGA泛癌中的表达。Additional file 3: Table S2. The TPM expression of ACE2 in 30 kinds of tumors from TCGA database. 本研究作用的数据来源。Additional file 4: Table S3. Dataset sources used in the study. 文章复现 Figure 1:ACE2在泛癌中的
大家好,今天我给大家分享一篇单基因在肝癌疾病方面的纯生信文章,该文章是发表于Aging-US杂志上,最新影响因子为5.682分。该篇文章的整体思路较简单,复现难度不大!! 本篇文章的全部分析均依赖于在线数据库,未…
TCGA和GEO套路文章解说 文章,重在研究思路。有好的思路,才能有精彩的故事。很多时候,我们想找一个好点子,比如性状,疾病相关的关键分子,需要设计实验,做大量的分子筛选的工作,对于土豪实验室可以可以大把的花钱做芯片或者高通量 …
下面我们就以肝癌为例,着重介绍 TCGA 数据库及利用 TCGA 数据库现有的数据深入挖掘寻找肝癌发生的关键基因。. 1. 癌症病人自愿捐赠肿瘤组织及正常组织样本,由人类癌症生物标本核心资源库承担癌症组织标本和正常组织标本的采集、处理和分配工作. 2. 组织 ...
在这个分段有超过39个杂志在2017年到现在发表文章超过10篇,对于分析比较简单的小伙伴,可以考虑这些杂志,这里面大部分的杂志对国人都还是比较友好的。分段2:3-5分 我们可以发现,这部分的有49个杂志发表TCGA数据库文章超过10篇。
所以看到生信文章中TCGA里同一个癌种的患者样本数不一致,大家也不要奇怪,有可能就是版本不同导致的。大家做生信分析的时候,尽量选择TCGA数据库中的最新版本的数据进行下载。 〇、期刊简介 一、使用工具 1.仙桃学术工具 3.
猫叔开讲啦!对于生信0基础的小伙伴来说,看每一句代码都是困难重重,至于我们为什么要这样或那样处理数据?很难理解到位,其实只要走通了一条路,再慢慢扩展其中的知识体系,生信慢慢就上道了我的暴 …
基本90%以上纯生信数据挖掘类文章都离不开这两个数据库,第一个就是GEO数据库,第二个就是TCGA数据库,这两个都是免费的公共数据库,用户可以免费进行下载数据分析整理并且发表相关文章。我们下载相关数据选择的物…
在2019年有2400多篇是SCI文章,并且到了2020年更是预计有3300多篇。(截止2020年6月21日有1659篇文章发表,所以我们估算2020年大致为3320篇) 那在这几年里面利用TCGA数据库发表文章前20的杂志有哪些呢?
今天分享一篇TCGA数据挖掘+实验验证的文章,文章发表业内老牌期刊 Oncogene上,影响因子:7.971,中科院最新分区:1区,非OA期刊。参考文章来源:PMID: 33420370 DOI: 10.1038/s41388-020-01635-y。 研究背景:前…
ACE2在TCGA泛癌中的表达。Additional file 3: Table S2. The TPM expression of ACE2 in 30 kinds of tumors from TCGA database. 本研究作用的数据来源。Additional file 4: Table S3. Dataset sources used in the study. 文章复现 Figure 1:ACE2在泛癌中的
大家好,今天我给大家分享一篇单基因在肝癌疾病方面的纯生信文章,该文章是发表于Aging-US杂志上,最新影响因子为5.682分。该篇文章的整体思路较简单,复现难度不大!! 本篇文章的全部分析均依赖于在线数据库,未…
TCGA和GEO套路文章解说 文章,重在研究思路。有好的思路,才能有精彩的故事。很多时候,我们想找一个好点子,比如性状,疾病相关的关键分子,需要设计实验,做大量的分子筛选的工作,对于土豪实验室可以可以大把的花钱做芯片或者高通量 …
下面我们就以肝癌为例,着重介绍 TCGA 数据库及利用 TCGA 数据库现有的数据深入挖掘寻找肝癌发生的关键基因。. 1. 癌症病人自愿捐赠肿瘤组织及正常组织样本,由人类癌症生物标本核心资源库承担癌症组织标本和正常组织标本的采集、处理和分配工作. 2. 组织 ...
在这个分段有超过39个杂志在2017年到现在发表文章超过10篇,对于分析比较简单的小伙伴,可以考虑这些杂志,这里面大部分的杂志对国人都还是比较友好的。分段2:3-5分 我们可以发现,这部分的有49个杂志发表TCGA数据库文章超过10篇。
所以看到生信文章中TCGA里同一个癌种的患者样本数不一致,大家也不要奇怪,有可能就是版本不同导致的。大家做生信分析的时候,尽量选择TCGA数据库中的最新版本的数据进行下载。 〇、期刊简介 一、使用工具 1.仙桃学术工具 3.
猫叔开讲啦!对于生信0基础的小伙伴来说,看每一句代码都是困难重重,至于我们为什么要这样或那样处理数据?很难理解到位,其实只要走通了一条路,再慢慢扩展其中的知识体系,生信慢慢就上道了我的暴 …
基本90%以上纯生信数据挖掘类文章都离不开这两个数据库,第一个就是GEO数据库,第二个就是TCGA数据库,这两个都是免费的公共数据库,用户可以免费进行下载数据分析整理并且发表相关文章。我们下载相关数据选择的物…