学校。论文就是学校的研究成果，会保存起来，不会销毁的。一般会放在学校图书馆存档。毕业论文是专科及以上学历教育为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前撰写的论文。毕业论文一般安排在修业的最后一学年进行，论文题目由教师指定或由学生提出，学生选定课题后进行研究，撰写并提交论文，目的在于培养学生的科学研究能力。
一般会收录在学校自己的论文库里面。本科生的论文一般是不会上传到知网维普等数据库的，所以在网上是查不到的。一般会收录在学校自己的论文库里面。如果是优秀的毕业论文的话，学校这边可能会给知网上传，不过本科论文上传的特别少，所以查不到很正常的。
由学校院系保存。以上海交通大学为例，毕业论文最后由学校院系保存。按照《上海交通大学关于本科生毕业设计(论文)工作的若干规定》的相关规定，学生在答辩与评分以后，毕业论文都需要采用资料保存归档。
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