haematologica杂志

优秀研究生先进事迹材料郭x，男，汉族，1987年2月7日出生。现就读于xx大学物理与电子科学学院凝聚态物理专业，攻读硕士研究生。自入校以来，他没有丝毫放松对自己的要求，在思想、生活、学习和工作上更加严格要求自己。在师长的关怀下，郭x经过不懈的努力以及同学的帮助，取得了一定的成绩。现将其主要事迹材料列举如下：一、科研：以第一作者完成论文三篇；合作完成论文四篇；主持湖南省研究生科研创新项目一项（项目编号: CX201x7）；参与国家自然科学基金项目（项目编号:61071015、61x09）；参与湖南省教育厅重点科技项目（项目编号：0x05）。二、活动：担任物理与电子科学学院研究生部的宣传部长，组织活动如下：组织宣传第二届物电学院研究生“云影讲坛”活动；组织物电学院“未来之星讲课大赛”；组织同学参加“校研究生篮球比赛”；获得2009-2010学年优秀团员称号。郭x同学在导师张x教授的指导下，他的研究生课程学习成绩优秀，在学术课研方面取得了一定的成绩。现已发表和投稿接受论文均为国际国内核心期刊，被SCI收录。他坚信一份耕耘一份收获，时刻提醒自己端正学习态度，努力使自己保持一种积极向上的心态，保持一种谦虚谨慎的作风，保持一种永不服输的精神。他学习上坚持不请假，不早退，不让每一个学习的机会流失。“学问未必全在书本上”学好书本上的东西是远远不够的。在他的思维中，学习与能力并重。所以，他一直对自己要求要“学以致用”、“理论联系实际”。当然，这些成绩绝不是终点，积极进取的他还会努力向更高的目标发展。尽管他在学习方面取得了一定的成绩，但在思想上他也毫不松懈，积极进取，努力提高思想觉悟水平。他通过学习先进的政治理论，关心国内国际大事，坚持用先进的理论武装和提高自己，热爱祖国，拥护中国共产党的领导，坚持四项基本原则；遵纪守法，维护社会稳定，自觉遵守《学生行为准则》和学校规则制度，尊敬师长，热爱同学，关心集体，坚持真理，修正错误，自觉抵制封建迷信等错误倾向；树立集体主义为核心的人生价值观，认真参加学校及院里组织的各项政治活动，在思想和行为上与党中央保持一致，积极主动的向党组织靠拢，时刻督促自己，检查自己，让他在思想行为方面作风优良，待人诚恳，能较好处理人际关系，处事冷静稳健，能合理地统筹按排学习、工作、生活中的事务。并且一直在追求人格的升华，注重自己的品行。2009年9月至2010年9月，他担任物理与电子科学学院研究生部的宣传部长，积极组织和完成学校学院的各项工作。他在工作上严格要求自己，坚持为同学们带头做表率，树立起一个自立、自强、争做合格大学生的典范，同时积极配合老师、同学，认真负责完成各项工作。他默默无闻的工作作风，积极的工作心态和强烈的责任感，赢得了同学老师的一致好评。在平时的学习和工作中郭x还注意积累各种工作经验，积极和其他系部的同学交流思想，取他人之长补己之短。此外，他还利用暑期积极参加各种社会实践和青年志愿者活动以丰富自己的课余生活，为自己进一步了解社会、认识社会积累了宝贵的经验，也为今后进入社会、融入社会打下了良好的理论和实践基础。郭x在生活上积极乐观，以饱满的热情迎接生活中每一天的挑战。他认为完成当代大学生的使命需从身边做起，尽自己最大努力带动身边的人，让每个人都意识到自己的力量，培养大家乐于助人的精神。在班级尊敬师长，团结同学，也努力用自己积极向上的心态去影响周围的同学。他还乐于助人，主动帮助身边有困难的同学。平时的他具有良好的生活、学习习惯，并且坚持体育运动，保持身体健康，能精力充沛的面对新一天的挑战。

ChIP-seq&mRNA-seq在外周淋巴瘤的药物联用实验中的应用332020.8.18头像qi致力于为分析测试行业奉献终身上海交通大学附属瑞金医院血液研究所赵维莅教授团队针对外周淋巴瘤的研究。近期，该课题组应用ChIP-seq联合分析揭示了联用西达本胺和地西他滨对组蛋白修饰基因突变的外周淋巴瘤的作用机制。该研究成果于月发表在血液科权威杂志《Haematologica》（影响因子7.7）上。（ChIP-seq及mRNA-seq均由云序生物提供技术服务）研究背景：由于不同的形态和免疫特征，约50%的外周淋巴瘤（PTCL）无法分类，并且呈现很差的临床表现，因此迫切需要找到可操作性的生物标志物以便临床上找到更好的治疗策略。已知表观遗传改变在肿瘤发展中起到很关键的作用。组蛋白修饰，尤其是甲基化和乙酰化，一般都会参与调控染色体的状态。在本研究中，作者首先通过靶向测序筛选到一系列组蛋白修饰相关基因的突变，接下来通过ChIP-seq和mRNA-seq进一步分析西达本胺和地西他滨联用对组蛋白修饰基因突变的外周T淋巴瘤的作用机制。研究思路：首先，作者筛选到了几个关键基因的突变，比如组蛋白甲基化修饰相关的基因（KMT2D，SETD2，KMT2A和KDM6A）以及组蛋白乙酰化修饰相关的基因（EP300和CREBBP），并在125例患有PTCL患者中发现45例有59个体细胞突变。临床研究发现组蛋白修饰相关基因突变与未经化疗的患者更低的无进展生存期有关，且对组蛋白脱乙酰酶抑制剂西达本胺敏感性增加。作者发现组蛋白脱乙酰酶抑制剂西达本胺联用低甲基化试剂地西他滨能显著抑制EP300突变的T淋巴瘤细胞的生长以及KMT2S突变的T淋巴瘤细胞的生长。作者进一步通过ChIP-seq和mRNA-seq揭示了联用西达本胺和地西他滨对组蛋白修饰基因突变的外周T淋巴瘤的作用机制（ChIP-seq和mRNA-seq均由云序生物提供技术服务）。地西他滨可协同西达本胺增强KMT2D与转录因子PU.1相互作用，调控H3K4me相关的信号通路，并增强PTCL对西达本胺的敏感性。在KMT2D突变的移植T淋巴瘤模型中，联用西达本胺和地西他滨可显著延缓肿瘤生长，并通过KMT2D/H3K4me诱导细胞凋亡。1.外周T淋巴瘤突变情况统计作者招募了239名未经治疗的PTCL患者，并对可获得的125名患者的肿瘤样本进行的靶向测序。作者在125例患者中发现，其中有60例患者一共出现91个表观遗传修饰基因的体细胞突变。大部分突变是错义突变（n=72），还有无义突变（n=10）和移码突变（n=9）。结果表明与其他肿瘤的SNV图谱相似都是更偏向于C>T/G>A突变，这与年龄和性别无关。组蛋白甲基化修饰基因突变发生在KMT2D（编码H3K4甲基化转移酶，25/125，占20%），SETD2（编码H3K36甲基化转移酶，6/125，占4.8%），KMT2A（编码H3K4甲基化转移酶，3/125，占2.4%）和KDM6A（编码H3K27去甲基化转移酶，1/125，占0.8%），并没有EZH2突变。组蛋白乙酰化修饰基因突变发生在EP300（编码H3K18乙酰化转移酶，10/125，占8%）和CREBBP（编码H3K18乙酰化转移酶，5/125，占4%）。还有其他DNA甲基化基因和染色体重构基因突变等。根据突变基因的分类，这四种很少有重叠，尤其是组蛋白甲基化修饰基因突变和组蛋白乙酰化修饰基因突变，这表明组蛋白修饰基因可能在不同的生物学过程中发挥作用。图一：PTCL突变分类2.组蛋白修饰基因突变使T淋巴瘤细胞对西达本胺和或地西他滨更敏感KMT2D和EP300错义突变质粒分别转染至JurKat细胞，发现KMT2D突变会抑制H3K4me3的表达水平，但会被组蛋白脱乙酰酶抑制剂罗米地辛和西达本胺恢复。此外，EP300突变会抑制H3K18ac的表达水平，但会被组蛋白脱乙酰酶抑制剂丙戊酸，亚罗里亚胺酸或罗米地辛和西达本胺恢复。在PTCL肿瘤样本中也发现KMT2D突变显著降低了核内H3K4me3的表达水平（30%），EP300/CREBBP突变也显著降低了核内H3K18ac的表达水平（17%）。有趣的是，给突变患者按每周两次口服30mg的西达本胺，有组蛋白修饰基因突变的复发患者得到完全或部分缓解。这一结果表明这些突变可能使PTCL患者对组蛋白脱乙酰酶抑制剂更敏感。图示：组蛋白乙酰化抑制剂对KMT2D突变和EP300突变的PTCL的作用体外实验也进一步证实了这一结论。流式细胞术证明西达本胺和地西他滨可协同诱导KME2D突变的细胞凋亡作用和G0/G1期阻滞作用。在KMT2D突变的移植T淋巴瘤模型中，联用西达本胺和地西他滨还能显著延缓肿瘤生长。体内外实验一致表明联用西达本胺和地西他滨比单用药物作用更显著。图示：西达本胺和地西他滨对KMT2D突变和EP300突变的PTCL的作用3.ChIP-seq联合mRNA-seq揭示作用机制为了搞清楚KMT2D-H3K4me3 DNA结合的靶基因，作者利用ChIP-seq在单用西达本胺或联用地西他滨的KMT2D突变细胞中检测H3K4me3结合的靶基因。Venn图表明联合用药和单用药物中，H3K4me3结合的启动子区域有显著的非重叠区。有趣的是，只有联用西达本胺和地西他滨才能影响H3K4me3结合的基因启动子表达水平，这一结合域的motif富集在与PU.1结合的区域（激活骨髓或B淋巴细胞的基因表达的转录因子）。mRNA-seq也表明与未处理组和单药处理组相比，联合用药参与多种癌症信号通路的调控，包括凋亡，细胞周期调控，细胞粘附和转录调控，而PU.1也参与癌症信号通路和转录调控。作者进一步对联合用药组mRNA-seq和ChIP-seq中重叠的基因进行GSEA分析，结果发现联合用药使MAPK通路去活化，p-ERK也随之调。图示：ChIP-seq和mRNA-seq揭示西达本胺和地西他滨对KMT2D突变和EP300突变的PTCL作用机制互联网文章推荐