除了在丰富的稿件中精选出优秀论文外, 编辑部还有重点地从清华大学、浙江大学、哈尔滨工业大学、西安交通大学、上海交通大学、重庆大学、天津大学和机械传动国家重点实验室、国家CIMS工程技术研究中心、流体传动及控制国家重点实验室、摩擦学国家重点实验室等国内重点大学和国家重点实验室等核心科研单位组织了一批高水平论文。这些论文大部分属于国家自然科学基金资助项目及国家、省（部）级的攻关课题，使得《机械工程学报》对本专业或学科重大信息的首次报道率大大提高，并成为机械类和力学类双学科核心期刊。据北京大学出版社1992年9月出版的《中文核心期刊要目总览》报道，在机械、仪表工业类191种期刊中确定了42种为核心期刊，而《机械工程学报》在其中排序第一；在力学类核心期刊中《机械工程学报》也有一席之地。1996年《机械工程学报》刊登的论文获得国家自然科学基金资助的项目占50.0%，1997和1998年均为63.3%(根据发表的每篇文章首页的标注统计而得)。《机械工程学报》刊登的论文大部分达到了国际、国内先进水平，并已成为评定博士点、评估国家重点实验室、申请国家自然科学基金、申报科研成果和晋升职称等的重要依据之一。根据论文效果反映表统计表明：《机械工程学报》刊登的论文获得国家及省部级以上单位奖励的占62.2%。
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