两者都不错。不过微生物学更侧重于理论生物及实验室设计，分子植物遗传育种是侧重于理论与实践相结合，可能要去农间地头，因此是两者都不错。《微生物学报》创刊于1953年，是由中国科学院微生物研究所、中国微生物学会主办的以微生物学基础研究和应用基础研究以及高技术创新为主的综合性学术刊物。
《微生物学报》在我国生物类期刊中的地位在“中文核心期刊要目总览”中，排生物类核心期刊第4～6位（1992、1996、2000、2004年的4个版本）2004年最新版中，位居第6位。在“中国科技期刊引文数据库” 2001年中国主要生物学期刊15名排行表中，总被引频次为470，排在第9位；影响因子为0.443，排在第13位；基金论文比为81%排在第9名。入选前100 名。在“中国科学引文数据库”排出的前500名核心期刊中，本刊居第63位。
是核心期刊，1.2+的影响因子，很牛的刊物，不过没有被SCI或EI收录
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