在科研工作上医院又有新突破,牵头十一五、863、国家自然基金项目等多项科研课题,先后获得国家科技进步二等奖和全国职工技术创新二等奖、中华医学科技二等奖、北京科技一、二、三等奖等 7个奖项。承担科研项目 121项,位列市属三甲医院第一名,其中独立承担项目 71项,在研科研经费超过 7000万元,位列市属医院第二名。发表 SCI论文 21篇、核心杂志发表论文 134篇。2010年经相关部门批准医院成为博士后科研工作站、《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》成为核心期刊杂志。每年召开的北京地坛国际感染病会议,提升了医院在国际、国内的学术影响力。北京红丝带之家是民政部门注册的服务于艾滋病患者、感染者的社会团体组织。为艾滋病患者、感染者提供关怀、医疗、护理、心理、法律支持等多元化服务,受到国内外各界的关注支持,已成为向世界展示中国艾滋病防治的窗口。医院接受过党和国家领导人多次视察、慰问,曾先后荣获全国五一劳动奖状、全国先进基层党组织、全国卫生系统先进集体、全国模范职工之家、全国精神文明建设工作先进单位、全国医院文化建设先进单位,连续五年被评为首都文明单位标兵,在传染病专科全国排名中位列第一。