脚注和参考文献是不重合的，参考文献不用解释，就是参考过的或者直接引用的文献，做出标注，一般写于文章末尾，脚注一般写于每一页的最后，脚注主要运用于对数字或者某句话或者某个词语的详细解释，主要是文中无法说清某个词语，或详细解释某个词语影响文章阅读的情况下，要脚注说明。例如，学而时习之，不亦说乎，脚注就是对这句话的解释，学到了知识或本领，并有时间有机会去不断地实践它，不也是件快乐的事，参考文献就是论语学而。
肯定是不行的，脚注一般的符号是圆圈内加符号①，而参考文献是方括号[1]。二者的最后论述解释的格式也不一样的。一般脚注是在句中的，即使是在句末也是标点符号以内，而参考文献往往是一整句或者一段话，是在标点符号外部的。所以他俩之间至少是有一个标点符号的。一般没有在一起用的情况。
看规定用哪种引用格式就用哪种，没明说的话一般用Harvard比较多，夹注和最后reference list，网上一搜就有具体规定，还有一些其他的reference style论文也常用引用部分系统查重会查出来很正常，大家都用同样的source，不会影响你的成绩，老师看的时候会把这部分的重复率无视的
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