我国从2000年起进行了部门预算改革，随之部门决算的编制工作也发生了很大变化。而现行的《行政单位财务规则》和《事业单位财务规则》已不能完全满足财政改革的需要，新的规则和制度尚未出台，为行政、事业单位带来了财务工作的难点，如现行制度的收入、支出科目与财政部门预算、决算不符；不能满足决算报表按照支出功能分类与支出经济分类的要求等等。
要达到部门决算报表的要求，就要科学合理地设计行政事业单位会计科目，以保证编制决算报表的需要。
例如：某报社为财政补助事业单位，2009年部门预算数为1500万元，其中基本支出500万元（人员支出200万元，公用支出300万元），项目支出1000万元（A项目600万元，B项目400万元）。基本支出中,财政拨款支出100万元。项目支出中,B项目的400万元全部由财政拨款支出,“其他支出-住房改革性支出-住房公积金”项目下的100万元全部由财政拨款支出（属于基本支出中的人员支出）。
报社2009年发生下列4笔会计事项：①单位张某因考察B项目发生差旅费2000元。②单位李某因考察干部发生差旅费1000元。③单位王某因考察A项目发生差旅费80元。④单位发放赵某提租补贴90元。
下面用两种方法填制会计凭证。
1．按照现行制度规定设置“事业支出”（科目编码504）一级科目，二级科目按照财政部下发的《2009年政府收支分类科目》中的“支出经济分类科目”设置明细账，“支出功能分类科目”的支出用设置辅助账的方法解决。
①借：事业支出-差旅费2000元（电算化辅助核算：出版发行支出-项目支出-B项目支出2000元）贷：零余额用款额度-出版发行支出额度 2000元②借：事业支出-差旅费1000元（电算化辅助核算：出版发行支出-基本支出-商品和服务支出1000元）贷：零余额用款额度-出版发行支出额度 1000元③借：事业支出-差旅费800元（电算化辅助核算：出版发行支出-项目支出-A项目支出800元）贷：现金 800元④借：事业支出-提租补贴90元（电算化辅助账：住房改革支出-提租补贴支出-基本支出-对个人和家庭的补助90元）贷：零余额现金-提租补贴90元上述4笔业务在填报部门决算报表中的“基本支出决算表”时不能直接填写“事业支出”科目借方累计发生额，而要查看辅助帐中的第2笔和第4笔业务涉及的会计科目的借方累计发生额,按支出功能分行填列。在填报决算报表中的“项目支出决算表”时同样也不能直接填写“事业支出”借方累计发生额，同样要查看辅助帐。
这样做法的特点是：“事业支出”科目下只设一套支出经济分类科目，报表所需数据大部分由辅助账提供,填制凭证复杂，易错，生成的会计科目余额表无法直接用于填报决算。
2．“事业支出”仍为一级科目，二级科目反映的是支出功能分类科目，三级反应的是基本支出和项目支出，四级及以下反映的是支出经济分类科目。在做上述4笔分录时找到对应的支出科目即可。
同时，在“事业支出”下设事业支出、出版发行支出、基本支出等明细科目。
上述4笔会计分录分别为：①借：事业支出-出版发行支出-项目支出-B项目支出-商品和服务支出-差旅费 2000元贷：零余额用款额度-出版发行支出额度 2000元②借：事业支出-出版发行支出-基本支出-商品和服务支出-差旅费1000元贷：零余额用款额度-出版发行支出额度 1000元③借：事业支出-出版发行支出-项目支出-A项目支出-商品和服务支出-差旅费 800元贷：现金 800元④借：住房改革支出-提租补贴支出 90元贷：零余额现金-提租补贴90元这样就可以不用设置辅助核算账就全面反映一个单位的支出情况，满足编制决算报表的需要，而且填制会计凭证速度较快。
缺点是科目级次长，但在会计电算化普及的今天，实现多级科目核算不成为问题。收入类、结余类科目对应支出科目以同样方法设置，可保证收入、支出、结余科目相互对应。
