一、外购商品短缺与毁损增值税进项税额的会计处理方法
对于外购商品的短缺与毁损，在未查明原因之前，一般的会计处理方法是：
先按外购商品的不含税进价记入“待处理财产损溢”，同时把增值税进项税额通过“应交税金——应交增值税（进项税额转出）”也转入“待处理财产损溢”；然后在查明原因以后再从“待处理财产损溢”把不含税进价和进项税额作相应的会计处理。
但笔者认为，上述关于外购商品短缺与毁损的会计处理方法过于笼统。因为外购商品的短缺与毁损是由于不同的原因造成的，其增值税进项税额的会计处理也相应地也就应该有所不同。笔者认为，可以按以下方法进行会计处理。首先，在验收入库发现短缺与毁损时，对其增值税进项税额不予以结转，仅对外购商品的不含税进价进行结转：
借：待处理财产损溢（不含税进价）
贷：商品采购（不含税进价）
然后，在查明原因以后，再根据不同情况分别进行会计处理：
1、外购商品的短缺或毁损属于运输途中的定额内损耗，其进项税额应予以抵扣，增值税进项税额可以不作处理，只需在审批后记为：
借：营业费用（不含税进价）
贷：待处理财产损溢（不含税进价）
2、若外购商品的短缺与毁损属于途中的超定额内损耗，其进项税额应不予以抵扣，对于该部分进项税额应通过“进项税额转出”转入“营业费用”，记为：
借：营业费用（不含税进价+进项税额）
贷：待处理财产损溢（不含税进价）
应交税金——应交增值税（进项税额）
3、若外购商品的短缺与毁损属于供货单位原因，则需要根据实际情况进行处理：（1）如果对方决定近期内予以补货，则短缺商品的进项税额需要视不同情况处理：若已付款，其进项税额可以抵扣；若未付款，则待付款后方可抵扣。（2）如果对方决定退赔货款，则视不同情况比照进货退出进行处理：若购买方未付款且未做账务处理，应退回原发票，待收到重开的发票后作购进处理；若已付款或已做账务处理，必须取得当地主管税务机关开具的“进货退及索取折让证明单” 交给销货方，购买方则应在取得对方开具的红字增值税专用发票后，以红字冲减原已登记的进项税额，记为：
借：应收账款（不含税进价+进项税额）
应交税金——应交增值税（进项税额）（红字）
贷：待处理财产损溢（不含税进价）
4、外购商品的短缺与毁损属于运输单位造成的，应向运输单位索赔，索赔款中的进项税额应通过“进项税额转出”转入“其他应收款”，记为：
借：其他应收款（不含税进价+进项税额转出）
贷：应交税金——应交增值税（进项税额转出）
待处理财产损溢（不含税进价）
5、如果外购商品的短缺与毁损属于非常损失，其进项税额不得抵扣，而应在批准后通过“进项税额转出”转入“营业外支出”，记为：
借：营业外支出（净损失）
材料物资（残料）
其他应收款（保险赔款）
贷：待处理财产损溢（不含税进价）
应交税金——应交增值税（进项税额转出）
二、外购商品短缺与毁损增值税进项税额的会计处理案例分析
现举例说明，某商品流通批发企业采用数量进价金额核算从外地甲公司购进A商品1000公斤，增值税专用发票上注明：价款50000元，税额8500元。接到银行转来的托收承付结算凭证及相关凭证，经审核无误，如数以银行存款支付，商品尚未运到，作会计分录如下：
借：商品采购——甲公司 50000
应交税金——应交增值税（进项税额） 8500
贷：银行存款 58500
商品验收入库时，实收980公斤，原因待查，作会计分录如下：
借：库存商品 49000
待处理财产损溢 1000
贷：商品采购 50000
1、若上例商品短缺20公斤，经查明属于定额内损耗，经批准后，作会计分录如下：
借：库存商品——A商品 1000
贷：待处理财产损溢 1000
2、若上例商品短缺20公斤，经查明10公斤属于定额内损耗，另10公斤属于超定额损耗，经批准后，作会计分录如下：
借：库存商品——A商品 500
营业费用 585
贷：待处理财产损溢 1000
应交税金——应交增值税（进项税额转出） 85
3、若上例商品短缺20公斤，经查明属于对方单位少发，现收到对方单位补发的商品，作会计分录如下：
借：库存商品——A商品 1000
贷：待处理财产损溢 1000
4、若上例商品短缺20公斤，经查明属于对方单位少发，经双方协商作退货处理，到主管税务机关开具“证明单”送交供货方，待收到供货方转来的红字增值税专用发票，作会计分录如下：
