一、 假设前提存在的缺陷
流动比率、速动比率和资产负债率是反映企业偿债能力的主要指标，但这些指标是以企业清算为前提的，主要着眼于企业资产的账面价值而忽视了企业的融资能力及企业因经营而增加的偿债能力，或者说这些指标都是以一种静态的眼光看企业的偿债能力的。另外，在速动比率指标的计算中假设企业的应付账款的偿债能力比存货的偿债能力强，有时实际情况并非如此，因为有些应付账款需要几年的时间才能收回，有些甚至根本不能收回。
二、 指标的定义缺乏统一性
许多财务指标本身并不能说明什么问题，例如，某企业的净资产收益率为10%，或者某企业的主营业务收入1000万元，这些指标并不能说明企业的什么问题，而只有通过与别的企业比较（横向比较）或和自己的历史情况进行比较（纵向比较）才能反映企业目前的财务状况或者经营状况。也就是说财务指标必须具有很强的可比性，而可比性的前提指标的定义必须统一。例如，主营业务利润率是用利润除以主营业务收入净额得到的，而企业的利润至少有主营业务利润、营业利润、利润总额和净利润等形式，到底应该采用哪种利润却并未有统一的界定，这使得主营业务利润率缺乏统一性。
三、 绝对指标与相对指标被割裂
绝对指标和相对指标各有优劣，而在实践在，财务分析往往将绝对指标与相对指标割裂开业，并过分重视相对指标而忽视绝对指标。而实际上，有些绝对指标是非常重要的，例如：主营业务收入净额、净资产、净利润等指标是非常重要的，其中主营业务收入净额可以分析一个企业的销售规模，净资产可以反映该企业的资产规模，净利润可以反映该企业的获利能力。这些问题对分析企业的财务状况是非常重要的，所以在进行财务分析时，最好将绝对指标和相对指标结合起来，更加全面地反映企业的财务状况。如果我们只知道某企业的主营业务利润率为30%，就不能对该企业的盈利能力和经营规模有很深的了解，但如果同时知道了该企业的主营业务收入为10000万元时，就会对该企业的盈利能力和经营规模有了比较具体的了解。
四、 财务指标没有反映其内容结构
财务指标是由各种数字表达的，但这些数字往往只是反映了该企业有关项目的表面现象，对于数字背后的真实情况是很难知道。例如：应收账款这一常指标，在报表中告诉我们的只是一个总数，到底有多少是刚刚发生的，有多少已经逾期，更重要的是有多少是难以收回的，企业外的人是无从知道的，而这些对于分析该企业的应收账款的质量具有重要的影响。
五、 财务指标容易被内部人控制
由于目前会计制度采取权责发生制的基本原则，内部人可以利用这一制度虚构某些交易与事项，从而达到内部人希望达到的财务数据，于是各种操纵财务指标的现象便应运而生了。在我国目前上市公司中严重地存在这种现象，几乎使人们丧失了对股票市场的信心。
从以上可以看到，财务指标在反映企业财务状况时所存在的种种缺陷，要求财务分析者在进行财务分析时应该考虑到如何解决这些问题，从而获得企业真实的财务信息。对于投资者来说，通过企业的有关财务指标获得上市公司真实的财务信息就显得十分重要。因此，应该采取措施，对上市公司的财务信息披露进行规范：
1. 在进行财务分析时，不仅应该从静态的角度看问题，更应该从动态的眼光对企业的发展状况进行分析；
2. 在利用财务指标进行财务分析时，应该将近三年的财务数据结合起来，一方面注意有关数据的勾稽关系，另一方面注意产生不正常变化的指标，重点对这些指标进行分析；
3. 对财务指标进行统一的定义，只有计算口径一致，对比分析才有意义；
4. 对特别重要的财务指标进行重点分析，并尽可能采用多种方法验证其真实性；
5. 注意将绝对指标和相对指标结合起来分析；
6. 注意该企业在无形资产方面的投入情况，分析该企业的发展潜力；
7. 从会计法规的角度，对上市公司的财务信息披露进行严格规定，防止内部人对财务数据的人为操纵，特别是对于关联交易的有关信息应该及时而准确的披露。
