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总有粉丝说自己投纯生信的时候总是被秒拒，秒拒再秒拒！这到底是什么原因呢？除了自己文章质量的本身问题，最大的问题就是没有选择到合适的期刊。有些期刊比较喜欢秒拒纯生信，就是因为它目前收到的稿件非常多，被很多人扎堆投稿过来，没有太多时间处理这些稿件，只能根据一些标题进行过滤秒拒。 有粉丝说在投纯生信的时候，基本都被 Genes、Genomics、The International Journal of Cancer 这些期刊秒拒。这些期刊影响因子本来也不低，难度会高一些，拒稿也很正常的事情。不过，这些期刊都是大众化的期刊，很多人都知道它们。因此，收到稿件往往比较多， 可能未来两年出版的文章都有了，所以拒稿率就特别高，特别是遇上扎堆投稿的时候，秒拒是常有的事情 。 当一本期刊大众化之后，人人都知道这本期刊对纯生信比较友好，都是认为比较好发，都往这本期刊上投稿，结果后面的人想投都投不了，因为人家怕了纯生信。 就好比这些低分的期刊： Med Sci Monit、Peer J、Molecular Omics ，投纯生信基本都是被秒拒的。虽然影响因子比上面的期刊低了很多，但是一样经常被秒拒，主要是因为过于出名，人人都认为它们好投，都想快点接收自己的文章，结果后面的纯生信基本都是被秒拒，除非你补实验验证。 假如你一名审稿人，期刊主编让你审一篇稿子，你可能会很爽快地答应， 但是让你审10篇甚至100篇，估计你就不愿干了 。同样的道理， 如果一本期刊再短期内收到上千篇纯生信，谁知道哪些是有意义的，哪些值得出版的，根本就没有办法送审的，也找不这么多的审稿人 ，人家要处理到猴年马月呀。在没有更好的办法的情况下，只能限制纯生信，让你补实验再做打算。 总来的来说，还是这句话：纯生信要想好发就必须创新，做没有人做过的或者少人做的东西，然后选择少人知道的而且愿意接收纯生信的期刊 。
大家好，最近因为有需要了解甲基化作用，看到这篇文献，拿出来给大家分享一下，这是一篇关于揭示蛋白BANP与基因组的CGCG基序结合，从而激活必需基因表达的文章。
文章题目： BANP opens chromatin and activates CpG-island-regulated genes (BANP打开染色质并激活CpG岛调节基因)
期刊： Nature
影响因子： 2020_IF = ; 中科大类: 综合性期刊 1区; 中科小类: 综合性期刊 1区; JCR分区: Q1
发文单位： 瑞士弗雷德里克-米歇尔生物医学研究所，瑞士生物信息学研究所和瑞士巴塞尔大学等5家单位。
摘要： DNA甲基化是一种化学修饰，可以抑制基因的活性。哺乳动物基因组中RNA聚合酶II产生的大多数基因转录起始于CpG岛（CGI）启动子，然而我们对其调控的理解仍然有限。造成这种原因一方面是由于我们对转录因子、它们的DNA结合基序以及具体基因组结合位点在给定的细胞类型中起何种作用的信息不完整。另一方面，还有一些没有已知结合基序的孤儿基序，如CGCG元件，它与人类组织中的高表达基因相关，并在CGI启动子子集的转录起始点附近富集。在研究中，作者将单分子足迹与互作蛋白质组学相结合，以确定BTG3相关核蛋白（BANP）在小鼠和人体基因组上作为转录因子结合该元件。作者发现BANP是一种强大的CGI激活剂，可以控制多能干细胞和终末分化神经元细胞中的基本代谢基因。BANP结合在体外和体内被其基序的DNA甲基化所排斥，这在表观遗传学上限制了大多数与CGI的结合，并解释了癌细胞中异常甲基化CGI启动子的差异结合。当与非甲基化基序结合时，BANP打开染色质和核小体相。这些发现证实了BANP是一组重要基因的关键激活因子，并提出了一个模型，其中CGI启动子的活性依赖于能够打开染色质的甲基化敏感转录因子。
主要结果： 1. BANP在体内与CGCG元件结合 为了测试单个基序，作者开发了一种简化方法，将单个转录因子基序置于体外衍生序列中，并使用重组酶介导的盒交换（RMCE）将其插入小鼠胚胎干（ES）细胞的特定基因组位点。这些基序的占有率由单分子足迹（SMF）监测，SMF使用甲基转移酶足迹并通过亚硫酸氢盐测序获得（图1a）。在测试CGCG元件时，作者观察到一个显著的足迹（图1b），表明了未知因子的占有。为了鉴定结合蛋白，作者使用含有CGCG元件的寡核苷酸作为诱饵，在小鼠ES细胞核提取物中进行亲和纯化。质谱检测发现BANP是唯一的富集蛋白（图1c）。BANP是哺乳动物BEN结构域蛋白之一，被认为与核基质相关，并在转录抑制中发挥作用。接着，作者通过ChIP–seq确定检测到小鼠ES细胞中1302个可重复的峰（图1d），对前500个峰的独立k-mer富集分析确定CGCG元件为主要序列（图1e），称之为BANP基序。这些基序主要存在于启动子中，尤其是CGI启动子（图1d，f）。同时作者发现几乎90%的启动子与基序是结合的，有12%的基序位于远端（图1g）。这与BANP结合单个基序的能力不一致（图1b）。作者猜测BANP结合可能受到DNA甲基化的抑制。
2. BANP对DNA甲基化敏感 在DNMT三重敲除（TKO）细胞中，BANP在野生型细胞中甲基化的其他基序处结合并打开染色质（图2a，b）。尽管大多数这些基序位于启动子的远端，但一些启动子也表现出结合增强和高表达，表明BANP为依赖性上调。为了在体外检测BANP的DNA结合，作者使用纯化的重组全长蛋白进行电泳迁移率转移和荧光偏振分析，发现BANP可以在体外特异性结合其非甲基化基序，基序甲基化使亲和力降低六倍以上（图2c）。为了确定BANP的结合特异性及其甲基化敏感性在人类细胞中是否保守，作者在两个表现出DNA甲基化异常模式的人类癌症细胞系中测定了其结合情况(图2d)，得出BANP在体外和体内特异性地直接结合到其未甲基化CGCG基序，体内结合解释了癌症特异性基因组结合事件。
3. BANP驱动重要基因表达 作者使用RMCE系统将一个具有三个BANP基序的报告基因插入基因组，并将其与已知CGI结合激活子的三个基序和已建立的强CGI衍生启动子（PGK）进行比较（图3a）。BANP基序导致表达增加近3000倍，比其他测试基序（如NRF1）至少高15倍，仅比PGK启动子低倍，表明BANP基序在染色质中具有强烈的自主激活。在BANP降解后，大多数结合基因快速下调（图3b，c），同时在蛋白质组中也检测到延迟但镜像下调（图3d）。这些结果表明BANP是CGI岛调控基因的一个重要子集的有效激活剂。虽然BANP结合在神经元中大部分是保守的，但一些CGI启动子显示出差异结合（图3e，f）。
4. BANP在CGIs处打开染色质 作者通过ATAC-seq分析转座酶可及染色质来确定BANP对开放染色质的影响。在BANP降解后，一小时后可及性已经降低，后续变化很小（图4a，b），这表明BANP在其CGCG基序中（甚至在CGI中）一直具有较高的可及性。为了了解结合是否影响核小体及其位置，作者进行了MNase-seq，确定了结合的BANP基序周围的高相位核小体（图4a，c，）。最后，作者检测了初生组织中BANP基序是否存在开放染色质。DNaseI足迹被检测到主要在CGI（图4d），这表明BANP结合和染色质开放在所有检测的初生组织中都是保守的。
在该研究中，作者鉴定出一种新的开关，它可以调控小鼠和人类基因组中的必需基因。识别缺失的基因开关及其功能对于全面了解健康和疾病的分子基础至关重要。
文中所有图片均来自BANP opens chromatin and activates CpG-island-regulated genes
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文章链接地址：
参考文献： Grand, ., Burger, L., Gräwe, C. et al. BANP opens chromatin and activates CpG-island-regulated genes. Nature (2021).
挺好的。genes杂志是MDPI的经典OA期刊，genes杂志在影响因子、控制撤稿量上，都要优于genes杂志，且国内的风评也日渐好转。genes杂志是一本有趣的期刊。每5年一个周期。发文量从1000多篇，缓慢缩进到500多篇。
一、期刊的影响因子是什么？期刊的影响因子(Impact factor，IF)，是表征期刊影响大小的一项定量指标。也就是某刊平均每篇论文的被引用数，它实际上是某刊在某年被全部源刊物引证该刊前两年发表论文的次数，与该刊前两年所发表的全部源论文数之比。计算公式：IF(k)= (nk-1+nk-2) / ( Nk-1+Nk-2)。二、如何查询期刊影响因子首先，查询影响因子要知道具体的查询地址，外文期刊和中文期刊的查询地址不同。1.查询外文期刊影响因子，可使用外文数据库Web of Science中的JCR，其中JCR Science Edition 用于查询自然科学类期刊，JCR Social Sciences Edition用于查询人文社会科学类期刊。2.查询中文期刊的影响因子，可使用中国学术期刊（光盘版）电子杂志社和中国科学文献计量评价中心联合推出的《中国学术期刊综合引证报告》（万锦堃主编，科学出版社）。有需要的读者请到图书馆咨询部查询其次，查询影响因子必需知道期刊缩写名，这个有很多规则，具体如下：1.单个词组成的刊名不得缩写部分刊名由一个实词组成，如Biomaterials，nature，science等不得缩写。2.刊名中单音节词一般不缩写英文期刊中有许多单音节词，如FOOD，CHEST，CHILD，这些词不得缩写。如医学期刊hearand lung, 缩写为Heart Lung,仅略去连词and.但少数构成地名的单词，如NEW，SOUTH等，可缩写成相应首字字母。如New England Journal of Medcine,可缩写为N Engl J Med,不应略为New Engl J Med，South African Journal of Surgery可缩写为S Afr J Surg,不可缩写为South Afr J Surg.另外，少于5个字母(含5个字母)的单词一般不缩写，如Acta,Heart,Bone,Joint等均不缩写。3.刊名中的虚词一律省略国外学术期刊刊名中含有许多虚词，如the,of,for,and,on,from,to等，在缩写时均省去。如Journal of chemistry缩写为J chem, Archives of Medical Research缩写为Arch Med .单词缩写应省略在辅音之后，元音之前英文单词缩写一般以辅音结尾，而不以元音结尾。如American省略为Am,而不省略为Ame或Amer，Medicine或Medical缩写为Med,European缩写为Eur等。但Science例外，缩写为Sci,可能是因为元音I之后又是元音E的缘故。缩写刊名每个词首字母必须大写，而不可全部都用大写或小写。
期刊影响因子排名如下：
今年共有近13000本期刊获得影响因子，其中60%以上的期刊IF实现了上涨。
影响因子最高的仍然是Ca-A Cancer Journal for Clinicians，但今年下跌较多，由降至。
国产期刊影响因子最高的是Cell Research，最新IF为，重回国刊榜首。
Nature和Science分别为：和。IF上涨（绝对值）最多的是Lancet，由增长至。
期刊影响因子(Impact factor，IF)，是代表期刊影响大小的一项定量指标。也就是某刊平均每篇论文的被引用数，它实际上是某刊在某年被全部源刊物引证该刊前两年发表论文的次数，与该刊前两年所发表的全部源论文数之比。
k 为某年, Nk-1+Nk-2 为该刊在k-1年与k-2发表的论文数量总数, nk-1 和nk-2 该刊在 k 年的被引用数量。也就是说，某刊在2005年的影响因子是其2004和2003两年刊载的论文在2005年的被引总数除以该刊在2004和2003这两年的载文总数（可引论文）。
问题一：什么是学术期刊的影响因子？ 影响因子是1972年由E1加菲尔德提出的，现已成为国际上通行的一个期刊评价指标。 学术期刊影响因子（Impact Factor）是指期刊近两年的平均被引率，即该期刊前两年发表的论文在评价当年被引用的平均次数。用公式表示为： 影响因子=该刊前2年所发表的论文在第3年被引用的次数/该刊2年内所发表的论文总数. 从其定义可知，影响因子的三个决定因素分别为时间（2年）、论文总数（该刊连续2年内所发表论文总数）、被引用次数（上述论文在第3年被引用的总次数）。 影响因子是一个相对数量指标，一般认为能够较好的反映期刊被使用的真实客观情况，可较公平的评价各类学术期刊，通常影响因子越大，期刊的学术影响力和作用也越大！ 我是润勉论文网的袁老师，以上是我了解到的资料，如果你还有什么问题，可以随时登陆我的网站详细咨询！ 问题二：什么是期刊影响因子？如何查询 影响因子(Impact Factor)是一个国际上通行的期刊评价指标，即某期刊前两年发表的论文在统计当年的被引用总次数除以该期刊在前两年内发表的论文总数。该指标是相对统计值，可克服大小期刊由于载文量不同所带来的偏差。一般来说，影响因子越大，其学术影响力也越大。影响因子的查询：1、查询外文期刊影响因子，可使用外文数据库Web of Science中的JCR（Journal of Reports），其中JCR Science Edition 用于查询自然科学类期刊，JCR Social Sciences Edition用于查询人文社会科学类期刊。2、查询中文期刊的影响因子，可使用中国学术期刊（光盘版）电子杂志社和中国科学文献计量评价中心联合推出的《中国学术期刊综合引证报告》（万锦抑鞅啵科学出版社）。 问题三：什么是影响因子IF 克服了外力的难度系数 问题四：杂志影响因子N/A是什么意思 影响因子是以年为单位进行计算的。以1992年的某一期刊影响因子为例，IF（1992年） = A / B 其中， A = 该期刊1990年至1991年所有文章在1992年中被引用的次数； B = 该期刊1990年至1991年所有文章数。 影响 许多著名学术期刊会在其网站上注明期刊的影响因子，以表明在对应学科的影响力。如，美国化学会志、Oncogene等。 中国大陆各大高校（如清华大学、哈尔滨工业大学、浙江大学）都以学术期刊的影响因子作为评判研究生毕业的主要标准。 问题五：学术期刊的影响因子一般在什么范围比较好 一般越高越好，像SCI就算比较权威的了，影响因子几乎都是一点几的样子，一般期刊能达到一的都很少 问题六：期刊影响因子的简介 计算公式：IF（k）= (nk-1+nk-2) / ( Nk-1+Nk-2)说明：k 为某年, Nk-1+Nk-2 为该刊在前一两年发表的论文数量, nk-1 和nk-2 该刊在 k 年的被引用数量。也就是说，某刊在2005年的影响因子是其2004和2003两年刊载的论文在2005年的被引总数除该刊在2004和2003这两年的载文总数（可引论文）。 问题七：期刊影响因子，复合影响因子，综合影响因子的区别和作用 两者的统计源不同，定义如下： 复合影响因子是以期刊综合统计源文献、博硕士学位论文统计源文献、会议论文统计源文献为复合统计源文献计算，被评价期刊前两年发表的可被引文献在统计年的被引用总次数与该期刊在前两年内发表的可被引文献总量之比。 --------------------------------------------------------------------------------------- 综合影响因子是以基础研究、技术研究、技术开发类科技期刊及引证科技期刊的人文社会科学基础研究、应用研究和工作研究期刊作为期刊综合统计源文献计算，被评价期刊前两年发表的可被引文献在统计年的被引用总次数与该期刊在前两年内发表的可被引文献总量之比。 问题八：核心期刊的综合影响因子什么时候评 期刊的影响因子(Impact factor，IF)，是表征期刊影响大小的一项定量指标。也就是某刊平均每篇论文的被引用数，它实际上是某刊在某年被全部源刊物引证该刊前两年发表论文的次数，与该刊前两年所发表的全部源论文数之比。
某期刊的某年的影响因子是由它前两年发表的文献的引用率来计算的。所以跟某篇文献的影响因子是没有关系的。
具体的某篇论文的是没有影响因子的！只有引用次数的多少！影响因子是对期刊来讲的！
问题一：什么是学术期刊的影响因子？ 影响因子是1972年由E1加菲尔德提出的，现已成为国际上通行的一个期刊评价指标。 学术期刊影响因子（Impact Factor）是指期刊近两年的平均被引率，即该期刊前两年发表的论文在评价当年被引用的平均次数。用公式表示为： 影响因子=该刊前2年所发表的论文在第3年被引用的次数/该刊2年内所发表的论文总数. 从其定义可知，影响因子的三个决定因素分别为时间（2年）、论文总数（该刊连续2年内所发表论文总数）、被引用次数（上述论文在第3年被引用的总次数）。 影响因子是一个相对数量指标，一般认为能够较好的反映期刊被使用的真实客观情况，可较公平的评价各类学术期刊，通常影响因子越大，期刊的学术影响力和作用也越大！ 我是润勉论文网的袁老师，以上是我了解到的资料，如果你还有什么问题，可以随时登陆我的网站详细咨询！ 问题二：什么是期刊影响因子？如何查询 影响因子(Impact Factor)是一个国际上通行的期刊评价指标，即某期刊前两年发表的论文在统计当年的被引用总次数除以该期刊在前两年内发表的论文总数。该指标是相对统计值，可克服大小期刊由于载文量不同所带来的偏差。一般来说，影响因子越大，其学术影响力也越大。影响因子的查询：1、查询外文期刊影响因子，可使用外文数据库Web of Science中的JCR（Journal of Reports），其中JCR Science Edition 用于查询自然科学类期刊，JCR Social Sciences Edition用于查询人文社会科学类期刊。2、查询中文期刊的影响因子，可使用中国学术期刊（光盘版）电子杂志社和中国科学文献计量评价中心联合推出的《中国学术期刊综合引证报告》（万锦抑鞅啵科学出版社）。 问题三：什么是影响因子IF 克服了外力的难度系数 问题四：杂志影响因子N/A是什么意思 影响因子是以年为单位进行计算的。以1992年的某一期刊影响因子为例，IF（1992年） = A / B 其中， A = 该期刊1990年至1991年所有文章在1992年中被引用的次数； B = 该期刊1990年至1991年所有文章数。 影响 许多著名学术期刊会在其网站上注明期刊的影响因子，以表明在对应学科的影响力。如，美国化学会志、Oncogene等。 中国大陆各大高校（如清华大学、哈尔滨工业大学、浙江大学）都以学术期刊的影响因子作为评判研究生毕业的主要标准。 问题五：学术期刊的影响因子一般在什么范围比较好 一般越高越好，像SCI就算比较权威的了，影响因子几乎都是一点几的样子，一般期刊能达到一的都很少 问题六：期刊影响因子的简介 计算公式：IF（k）= (nk-1+nk-2) / ( Nk-1+Nk-2)说明：k 为某年, Nk-1+Nk-2 为该刊在前一两年发表的论文数量, nk-1 和nk-2 该刊在 k 年的被引用数量。也就是说，某刊在2005年的影响因子是其2004和2003两年刊载的论文在2005年的被引总数除该刊在2004和2003这两年的载文总数（可引论文）。 问题七：期刊影响因子，复合影响因子，综合影响因子的区别和作用 两者的统计源不同，定义如下： 复合影响因子是以期刊综合统计源文献、博硕士学位论文统计源文献、会议论文统计源文献为复合统计源文献计算，被评价期刊前两年发表的可被引文献在统计年的被引用总次数与该期刊在前两年内发表的可被引文献总量之比。 --------------------------------------------------------------------------------------- 综合影响因子是以基础研究、技术研究、技术开发类科技期刊及引证科技期刊的人文社会科学基础研究、应用研究和工作研究期刊作为期刊综合统计源文献计算，被评价期刊前两年发表的可被引文献在统计年的被引用总次数与该期刊在前两年内发表的可被引文献总量之比。 问题八：核心期刊的综合影响因子什么时候评 期刊的影响因子(Impact factor，IF)，是表征期刊影响大小的一项定量指标。也就是某刊平均每篇论文的被引用数，它实际上是某刊在某年被全部源刊物引证该刊前两年发表论文的次数，与该刊前两年所发表的全部源论文数之比。
某期刊的某年的影响因子是由它前两年发表的文献的引用率来计算的。所以跟某篇文献的影响因子是没有关系的。
具体的某篇论文的是没有影响因子的！只有引用次数的多少！影响因子是对期刊来讲的！
影响因子是1972年由E1加菲尔德提出的，现已成为国际上通行的一个期刊评价指标。学术期刊影响因子（Impact Factor）是指期刊近两年的平均被引率，即该期刊前两年发表的论文在评价当年被引用的平均次数。用公式表示为：影响因子=该刊前2年所发表的论文在第3年被引用的次数/该刊2年内所发表的论文总数.从其定义可知，影响因子的三个决定因素分别为时间（2年）、论文总数（该刊连续2年内所发表论文总数）、被引用次数（上述论文在第3年被引用的总次数）。影响因子是一个相对数量指标，一般认为能够较好的反映期刊被使用的真实客观情况，可较公平的评价各类学术期刊，通常影响因子越大，期刊的学术影响力和作用也越大！我是润勉论文网的袁老师，以上是我了解到的资料，如果你还有什么问题，可以随时登陆我的网站详细咨询！
影响因子（Impact Factor，IF）是汤森路透（Thomson Reuters）出品的期刊引证报告（Journal Citation Reports，JCR）中的一项数据。
即某期刊前两年发表的论文在该报告年份（JCR year）中被引用总次数除以该期刊在这两年内发表的论文总数。这是一个国际上通行的期刊评价指标。
影响因子现已成为国际上通用的期刊评价指标，它不仅是一种测度期刊有用性和显示度的指标，而且也是测度期刊的学术水平，乃至论文质量的重要指标。影响因子是一个相对统计量。影响因子并非一个最客观的评价期刊影响力的标准。
扩展资料
影响因子虽然可在一定程度上表征其学术质量的优劣，但影响因子与学术质量间并非呈线性正比关系，比如不能说影响因子为的期刊一定优于影响因子为的期刊，影响因子不具有这种对学术质量进行精确定量评价的功能。
国内部分科研机构，在进行科研绩效考评时常以累计影响因子或单篇影响因子达到多少作为量化标准，有的研究人员可能因影响因子差分而不能晋升职称或评定奖金等，这种做法绝对是不可取的。
参考资料来源：百度百科-影响因子
影响因子是对刊物的评价，而不能代表发表于此刊物的每一篇论文的水平。《电子与信息学报》从2001至2005年发表论文1618篇[9]，2006年5年被引593次，100篇被引论文贡献了50%的被引频次。的论文未被引用过。Seglen也通过统计发现，约15%的论文贡献50%刊物总被引频次，50%论文贡献90%被引频次。这表明，好的刊物并不能提高一般水平论文的被引频次。影响因子是有波动的，不是一成不变的。影响因子的计算方法：以计算2004年if 为例 if 2004= （该杂志2003被引次数 + 该杂志2002被引次数）/(该杂志2003文章数量 + 该杂志2002文章数量)
学术期刊影响因子是指期刊近两年的平均被引率，即该期刊前两年发表的论文在评价当年被引用的平均次数。用公式表示为：
影响因子=该刊前2年所发表的论文在第3年被引用的次数/该刊2年内所发表的论文总数.
从其定义可知，影响因子的三个决定因素分别为时间（2年）、论文总数（该刊连续2年内所发表论文总数）、被引用次数（上述论文在第3年被引用的总次数）。
影响因子是一个相对数量指标，能够较好的反映期刊被使用的真实客观情况，可较公平的评价各类学术期刊，通常影响因子越大，期刊的学术影响力和作用也越大！
扩展资料：
影响因子现已成为国际上通用的期刊评价指标，它不仅是一种测度期刊有用性和显示度的指标，而且也是测度期刊的学术水平，乃至论文质量的重要指标。影响因子是一个相对统计量。
影响因子是以年为单位进行计算的。以1992年的某一期刊影响因子为例，IF（1992年） = A / B
其中：
A = 该期刊1990年至1991年所有文章在1992年中被引用的次数；
B = 该期刊1990年至1991年所有文章数。
影响：
许多著名学术期刊会在其网站上注明期刊的影响因子，以表明在对应学科的影响力。如，美国化学会志、Oncogene等。
中国大陆各大高校（如清华大学、武汉大学、中国科学技术大学、南开大学、中国农业大学、吉林大学、哈尔滨工业大学、浙江大学、上海大学、大连理工大学等）都以学术期刊的影响因子作为评判研究生毕业的主要标准。
以1992年为例，计算某期刊在该年的影响因子：
X=以1992年为基点、某期刊于1990和1991年在1992年全部被引用之论文总次数
Y=以1992年为基点、某期刊1990和1991年全部论文发文量的总和
IF1992年 =（X（1990年，1991年） / Y（1990年，1991年））
参考资料来源：百度百科——影响因子
参考资料来源：百度百科——期刊影响因子