因为有可能是参考文献那个段落，并没有给它设置大纲级别。你可以选中那个段落，然后右键〉大纲级别中选择你想让它出现在目录中的层级数，确定后，重新生成或更新目录，就可以看到了。
方法如下（以Word2003为例）：1．光标移到要插入参考文献的地方，菜单中“插入”——“引用”-“脚注和尾注”。2．对话框中选择“尾注”，编号方式选“自动编号”，所在位置可以选“节的结尾”或“文档结尾”。3．如“自动编号”后不是阿拉伯数字，选右下角的“选项”，在编号格式中选中阿拉伯数字。4．确定后在该处就插入了一个上标“1”，而光标自动跳到文章最后，前面就是一个上标“1”，这就是输入第一个参考文献的地方。5．将文章最后的上标“1”的格式改成正常（记住是改格式，而不是将它删掉重新输入，否则参考文献以后就是移动的位置，这个序号也不会变），再在它后面输入所插入的参考文献（格式按杂志要求来慢慢输，好像没有什么办法简化）。6．对着参考文献前面的“1”双击，光标就回到了文章内容中插入参考文献的地方，可以继续写文章了。7．在下一个要插入参考文献的地方再次按以上方法插入尾注，就会出现一个“2”（Word已经自动为你排序了），继续输入所要插入的参考文献。标号上的方括号如何加呢？很简单：8用的尾注，在菜单中的“编辑”——“替换”中“查找内容”填写 ^e，替换为[^&]即可：9用的脚注，在菜单中的“编辑”——“替换”中“查找内容”填写^f，替换为[^&]便可以了（这里建议在一篇文章都写完后再将方括号加上会省去很多意外的麻烦）10．所有文献都引用完后，你会发现在第一篇参考文献前面一条短横线（页面视图里才能看到），如果参考文献跨页了，在跨页的地方还有一条长横线，这些线无法选中，也无法删除。这是尾注的标志，但一般科技论文格式中都不能有这样的线，所以一定要把它们删除。还没完，删除横线的方法11．切换到普通视图，菜单中“视图”——“脚注”，这时最下方出现了尾注的编辑栏。12．在尾注右边的下拉菜单中选择“尾注分隔符”，这时那条短横线出现了，选中它，删除。13．再在下拉菜单中选择“尾注延续分隔符”，这是那条长横线出现了，选中它，删除。14．切换回到页面视图，参考文献插入已经完成了。这时，无论文章如何改动，参考文献都会自动地排好序了。如果删除了，后面的参考文献也会自动消失，绝不出错。 参考文献越多，这种方法的优势就越强大。别看步骤多，操作一遍，就知道很简单了~
1、首先选中word文档，双击打开。
2、其次在该界面中，选中“参考文献和注释致谢”。
3、接着在该界面中，点击上方工具栏的“引用”按钮。
4、其次在该界面中，点击上方工具栏的“目录级别”按钮里的“1级目录”选项。
5、之后在该界面中，点击上方工具栏的“更新目录”按钮。
6、最后在该界面中，显示参考文献和注释致谢的目录内容。
嗯，我最近也在写论文，遇到了这个问题，你可以这样做，挺麻烦的论文格式要求参考文献在正文之后，参考文献后还有发表论文情况说明、附录和致谢，而word的尾注要么在文档的结尾，要么在“节”的结尾，这两种都不符合我们的要求。解决的方法似乎有点笨拙。首先删除尾注文本中所有的编号（我们不需要它，因为它的格式不对），然后选中所有尾注文本（参考文献说明文本），点“插入｜书签”，命名为“参考文献文本”，添加到书签中。这样就把所有的参考文献文本做成了书签。在正文后新建一页，标题为“参考文献”，并设置好格式。光标移到标题下，选“插入｜交叉引用”，“引用类型”为“书签”，点“参考文献文本”后插入，这样就把参考文献文本复制了一份。选中刚刚插入的文本，按格式要求修改字体字号等，并用项目编号进行自动编号。到这里，我们离完美还差一点点。打印文档时，尾注页同样会打印出来，而这几页是我们不需要的。当然，可以通过设置打印页码范围的方法不打印最后几页。这里有另外一种方法，如果你想多学一点东西，请接着往下看。选中所有的尾注文本，点“格式｜字体”，改为“隐藏文字”，切换到普通视图，选择“视图｜脚注”，此时所有的尾注出现在窗口的下端，在“尾注”下拉列表框中选择“尾注分割符”，将默认的横线删除。同样的方法删除“尾注延续分割符”和“尾注延续标记”。删除页眉和页脚（包括分隔线），选择“视图｜页眉和页脚”，首先删除文字，然后点击页眉页脚工具栏的“页面设置”按钮，在弹出的对话框上点“边框”，在“页面边框”选项卡，边框设置为“无”，应用范围为“本节”；“边框”选项卡的边框设置为“无”，应用范围为“段落”。切换到“页脚”，删除页码。选择“工具｜选项”，在“打印”选项卡里确认不打印隐藏文字（word默认）。好了，试着打印一下尾注所在的页，是不是白纸？！或者按我的办法，大同小异，感觉不添加书签会方便些：先将参考文献部分复制粘贴到一个新word中，你会发现，前面的序号全部变成1了，需要按你原来的，手动改为12345.....，然后按原论文中参考文献格式，刷一下。然后把这部分再复制到论文后面就可以了。接下来，把论文中原来的参考文献，全部选中，字体——隐藏。这样在我们新粘贴过来的参考文献后面即可加入致谢-附录部分，就可以生成目录了
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