不做实验发论文, oncomine数据库 使用. 生信论文的套路 ONCOMINE 从全景、亚型两个维度做表达差异分析;临床标本从蛋白水平确认(或HPA 数据库 ),很
儒家绅士 发布于2022-02-18 17:25来自Android 客户端IP福建 学习了 回复 点赞收藏更多
Oncomine是大型的癌基因芯片数据库,自带分析和统计功能,已经收集了近715个Datasets的86733个癌组织和正常组织的样本数据(包括GEO、TCGA和已发表的
不做实验发论文,oncomine数据库使用 任务。差异分析最好的工具就是ONCOMINE和R语言分析GEO或TCGA数据库的数据。ONCOMINE数据库如何使用呢?
在肿瘤研究中,Oncomine是非常重要的样本数据库,它整合了GEO、TCGA和已发表的文献来源的RNA和DNA-seq数据,是目前世界上最大的癌基因芯片数据库和整合数据挖掘平台,且自带分析和统计功
在肿瘤研究中,Oncomine是非常重要的样本数据库,它整合了GEO、TCGA和已发表的文献来源的RNA和DNA-seq数据,是目前世界上最大的癌基因芯片数据库和整合数据挖掘平台,且自带分析和统计
目的 研究SLC16A1基因在口腔癌等头颈癌中的表达并进行相关肿瘤预后分析.方法 挖掘Oncomine数据库中口腔癌等头颈癌中SLC16A1基因相关数据,并进行生存分析.结果
Oncomine 整合了GEO、TCGA和已发表的文献来源的RNA和DNA-seq数据。通过Oncomine,可以进行差异表达分析,共表达分析,查找某种癌症中差异表达的基
我们前面说过,仅仅靠ONCOMINE数据库的数据,还很难发表论文。而且,ONCOMINE数据库的数据,是芯片或测序的结果,是从转录水平进行的检测。而差异表达,最好是在蛋白水平,因此,对于ONCOMI