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2021年12月22日，诺禾致源来自农业农村部沼气科学研究所的客户在 《 Nature 》 发表了题为：Non-syntrophic methanogenic hydrocarbon degradation by an archaeal species 的研究论文，深圳大学李猛教授及马克斯普朗克海洋微生物研究所Gunter Wegener教授作为共同通讯。文章探究了一类新型产甲烷古菌（ Ca . Methanoliparum）的代谢途径并证实了其独立降解长链烷基烃产甲烷的功能，在古菌厌氧降解长链烷烃产甲烷研究方面取得突破性进展。 其中，16S rRNA微生物多样性、宏基因组和宏转录组测序工作均在诺禾致源完成。 下面，我带大家一起学习下这篇高分文章： Non-syntrophic methanogenic hydrocarbon degradation by an archaeal species 一种古菌以非互营方式实现烷基烃降解产甲烷 期刊： Nature IF： 49.962 文章背景 地下油藏和海洋渗油沉积物中，微生物使用碳氢化合物作为能源和碳的来源。微生物优先消耗烷烃、环状和芳香族化合物，留下未分解的复杂混合物作为残留物，从而改变油的质量。 在没有硫酸盐的情况下，微生物会将厌氧烃降解与甲烷的形成结合起来。该反应最初被 Zengler 等人证明为产甲烷的“微生物烷烃裂解”，大量研究表明它可以在细菌和古细菌的共养相互作用中进行。 在这种同养中，细菌将油发酵成醋酸盐、二氧化碳和氢气，而氢营养型和/或乙酸营养型产甲烷古细菌则使用这些产物进行产甲烷。存在多种厌氧烃活化机制，包括经过充分研究的由甘氨酰自由基酶催化的延胡索酸加成途径。 这种机制在以各种链长的烷烃和其他碳氢化合物为生的细菌中很普遍。相比之下， 几个古菌谱系在特定类型的甲基辅酶M还原酶(MCR)的帮助下激活气态烷烃，该酶最初被描述为催化产甲烷菌中的甲基辅酶M (methyl-CoM)。 厌氧甲烷营养古细菌使用经典 MCR 将甲烷活化为甲基-CoM，然后将其氧化为 CO2。短链烷烃氧化古细菌含有这种酶的不同变体，称为烷基 CoM 还原酶 (ACR)。 类似于甲烷激活MCR，ACR激活多碳烷烃以形成CoM结合的烷基单元。 研究结果 培养的烷烃氧化古细菌通过 Wood-Ljungdahl 和/或 β 氧化途径将短链烷烃（如乙烷、丙烷或丁烷）氧化为 CO2 。 这些古细菌需要共养伙伴细菌，它们接收在烷烃氧化过程中释放的还原当量以进行硫酸盐还原 。然而，许多未培养的古菌谱系含有 acr 基因，这表明降解碳氢化合物的古菌远比少数培养的代表所描绘的更加多样化。 最近描述的宏基因组组装基因组 (MAG) ‘ Candidatus Methanoliparia’编码了规范 MCR 和 ACR。这种独特的 MCR-ACR 组合，结合额外的基因组特征，如膜结合甲基钴胺素：CoM 甲基转移酶 (Mtr)，表明这些古细菌结合了烷烃的降解和甲烷的形成，而无需共养伙伴。然而，这些说法缺乏直接的生理证据。 该研究培养了来自地下油藏的 Ca . Methanoliparum。 分子分析表明， Ca . Methanoliparum含有并过度表达编码烷基辅酶 M 还原酶和甲基辅酶 M 还原酶的基因，这些基因是古菌多碳烷烃和甲烷代谢的标记基因。 不同底物的孵育实验和辅酶-M 结合中间体的质谱检测证实。 Ca . Methanoliparum 不仅在各种长链烷烃上茁壮成长，而且在 n -烷基环己烷和具有长 n -烷基 (C≥13) 部分的 n -烷基苯上也能茁壮成长。 相比之下，短链烷烃（如乙烷到辛烷）或具有短烷基链（C≤12）的芳烃没有被消耗。 Ca Methanoliparum 在富油环境中的广泛分布表明这种烷营养型产甲烷菌可能在碳氢化合物转化为甲烷中起关键作用。 总之，该研究发现一种来自油藏的新型的产甲烷古菌，可在厌氧环境下直接氧化原油中的长链烷基烃产生甲烷，突破了产甲烷古菌只能利用简单化合物生长的传统认知，拓展了对产甲烷古菌碳代谢功能的认知。 这一研究完善了碳素循环的生物地球化学过程，并为枯竭油藏残余原油的生物气化开采——“地下沼气工程”奠定了科学基础。 16S扩增子测序通过对特定长度的 PCR 产物进行测序分析，研究环境微生物多样性及群落组成差异，避开了微生物分离培养困难的问题；宏基因组（Metagenome）测序以生态环境中的DNA为研究对象，可以获得的整个环境微生物的基因组，主要侧重于研究基因的结构，预测潜在的代谢功能和基因表达情况，能有效的扩展微生物资源的利用空间；宏转录组（Metatranscriptome）测序以环境中全部RNA为研究对象，获得具有转录活性的基因。如果说16S扩增子是研究样本“存在什么”，宏基因组是研究样本“能做什么”，那么宏转录组则是研究样本“正在做什么”。 以“16S+宏基因组+宏转录组测序”更能清晰的探究微生物的物种变化趋势、精确深入至功能基因层面，解析环境体系变化的分子机制，为全面解析环境微生物群落中的重要物种和基因信息提供了一种有效手段。 参考文献 Zhou, Z., Zhang, Cj., Liu, Pf. et al. Non-syntrophic methanogenic hydrocarbon degradation by an archaeal species. Nature (2021).
沼气综合利用技术是指将沼气、沼液、沼渣运用到生产过程中，以降低生产成本，提高经济效益的一项技术措施，是将农业废弃物转化为多种农业生产资料，综合提高生产能力和回收生物能源的一种可靠手段。是农业走可持续发展道路的重要举措。 一、沼气的综合利用 沼气是一种可再生优质气体燃料，除可用于点灯、煮饭、发电外，还可广泛用于蔬菜大棚、升温育苗、烘干、储粮、保鲜水果等农业生产领域。 1.沼气在日光温室中的应用 在日光温室内燃烧沼气，不仅能增加光照、提高棚温，而且产生的二氧化碳作为气体肥，能促进蔬菜的生长。因此增加棚内cQ浓度有利于蔬菜的生长。比如大棚内CO：度提高到O.1%以上，番茄的产量可提高近两倍。 2.沼气储粮 沼气储粮是根据“低氧储粮”原理，利用沼气含氧量低的特性，将沼气输入粮仓而置换出空气，形成低氧环境，致使粮中害虫窒息死亡。此方法简单、操作方便、投资少、无污染、防止效果好、经济效益显著等诸多优点，可为农户和中、小型粮仓采用。 3.保鲜水果、蔬菜 用沼气储藏水果、蔬菜，可降低其呼吸强度，减弱其新陈代谢，推迟后熟期，达到较跃时间的保鲜和储藏目的。 二、沼液的综合利用 沼液中除含有氮、磷、钾外，还含有一定量的微量元素和对动、植物生长有调控作用及对某些病虫有杀灭作用的物质，这些物质可渗透到生物细胞内，刺激动物、植物的生长和发育。因此，在“三沼”综合利用中沼液是最具效果，晟具活力和最有发展前途的。 1.沼液浸种 沼液浸种就是将农作物种子放在沼液中浸泡后再播种的一项种子处理技术。由于沼液中宙有多种活性、抗性、营养性物质，浸泡过程中，不同程度地被种子吸收利用，加速养分运转和新陈代谢过程，具有明显的幼苗“胎里壮”，抗病、抗虫、抗逆性能力强，为高产奠定基础。 2.叶面施肥 沼液经过充分腐熟发酵、富含氮、磷、钾等营养元素和铜、铁、锌、锰、钼等微量元素以及多种生物活性物质，极宜作根外施肥，其效果比化肥好，作物生长季节都能进行，特别是当植物进入花期、孕穗期、灌浆期、果实膨大期，喷施效果明显，对麦类、玉米、水稻、棉花、花生、蔬菜、瓜类、果树都有增产作用，尤其是施用于果树，有利于花芽分化，保花保果，果实增重快，光泽度好，成熟一致，提高品质和商品果率。 3.沼液防治病虫害 沼液中含有多种生物活性物质，其中有机酸中的丁酸和植物激素中的赤霉素、维生素B12对病菌有明显的抑制作用。沼液中氨和铵盐及某些抗生素对作物的害虫有着直接杀伤作用。经实践和实验所证实，沼液防治病害的途径是沼液浸种，沼液防治虫害的途径是使用沼肥和直接喷施。 主要防治：①小麦赤霹病、全蚀病、根腐病、牙虫。②大麦叶锈病、黄花叶病。⑧玉米大斑病、小斑病、螟虫。④棉花枯萎病、炭疽病、棉铃虫。⑤红薯软腐病、黑斑病。⑥大豆蚜虫。⑦西瓜枯萎病。 4.沼液作饲料添加剂喂猪 据测定：沼液中含有牲猪生长的8种必须氨基酸和8种非必须氨基酸及铜、铁、锌等微量元素。因此将沼液拌入猪饲料中喂猪，起到促进牲猪生长，缩短育肥期，提高饲料报酬，降低料肉比，提高了养猪的经济效益。 三、沼渣的综合利用 沼渣中营养物质高而全。沼渣质地疏松、富含有机质、腐植酸、粗蛋白、氮、磷、钾以及多种微量元素和矿物质，在农业生产中应用广泛。 1.改良土壤结构 沼碴中含有10%，--20%的腐殖酸和大量有机质，能产 生持续的效果，是一种速、缓兼备又增加土壤团粒数量的优质肥料，对改良土壤功效明显。 2.农作物增产 沼渣作为一种优质有机肥，施入农田、使土地肥沃，能保墒、固肥、通气性好，有利于作物生长，对粮、棉、油、瓜、果、菜都有显著的增产作用。 随着生产力的发展和人们在实践中对沼气认识的不加深，沼气、沼液、沼渣在农业生产上的作用越来越广。
个人档案 姓名：袁隆平 出生日期：1930年9月7日（农历七月初九） 籍贯地：江西德安 出生地：北京 家人：父亲袁兴烈，母亲华静，妻子邓哲，有3个儿子，袁定安、袁定江、袁定阳，三儿媳段美娟 身份：杂交水稻之父 个人简介：袁隆平，汉族。1953年毕业于西南农学院，分配到湖南安江农校任教。1964年开始杂交水稻研究，1971年调入湖南省农业科学院，1978年晋升为研究员，被评为全国劳动模范。1995年当选为中国工程院院士，现任国家杂交水稻工程技术研究中心主任。袁隆平的籼型杂交水稻研究获我国迄今唯一特等发明奖；湖南省委、省政府授予袁隆平“功勋科学家”称号；我国发现的国际编号为8117的小行星被命名为“袁隆平”星；他先后荣获联合国教科文组织“科学奖”和联合国粮农组织“粮食安全保障荣誉奖”等8项国际奖励。2001年获得首届国家最高科技奖
南袁”，即：袁隆平 (1930.9.1 -)。籍贯江西省九江市德安县，生于北京。我国杂交水稻研究创始人，被誉为“杂交水稻之父”、“当代神农”、“米神”等。 1953年,袁隆平毕业于西南农学院。1964年开始研究杂交水稻，1973年实现三系配套，1974年育成第一个杂交水稻强优组合南优2号，1975年研制成功杂交水稻制种技术，从而为大面积推广杂交水稻奠定了基础。 1980－1981年,袁隆平赴美任国际水稻研究所技术指导。1982年任全国杂交水稻专家顾问组副组长。1985年提出杂交水稻育种的战略设想，为杂交水稻的进一步发展指明了方向。1987年任863计划两系杂交稻专题的责任专家。1991年受聘联合国粮农组织国际首席顾问。1995年被选为中国工程院院士。1995年研制成功两系杂交水稻，1997年提出超级杂交稻育种技术路线，2000年实现了农业部制定的中国超级稻育种的第一期目标，2004年提前一年实现了超级稻第二期目标。 毕业后，袁隆平一直从事农业教育及杂交水稻研究。1971年至今任湖南农业科学院研究员，并任湖南省政协副主席、全国政协常委、国家杂交水稻工程技术研究中心主任。先后获得“国家特等发明奖”、“首届最高科学技术奖”等多项国内奖项和联合国“科学奖”、“沃尔夫奖”、“世界粮食奖”等11项国际大奖。出版中、英文专著6部，发表论文60余篇。 袁隆平是我国的著名农学家，中国工程院院士，是我国杂交水稻研究领域的开创者和带头人，曾获国家最高科学技术奖和多项国际奖。袁隆平 (1930.9.1 -) 籍贯江西省九江市德安县，生于北京。我国杂交水稻研究创始人，被誉为“杂交水稻之父”、“当代神农”、“米神”等。 1953年毕业于西南农学院（1985年更名为西南农业大学，2005年与西南师范大学 合并组建为西南大学）。1964年开始研究杂交水稻，1973年实现三系配套，1974年育成第一个杂交水稻强优组合南优2号，1975年研制成功杂交水稻制种技术，从而为大面积推广杂交水稻奠定了基础。1985年提出杂交水稻育种的战略设想，为杂交水稻的进一步发展指明了方向。1987年任863计划两系杂交稻专题的责任专家，1995年研制成功两系杂交水稻，1997年提出超级杂交稻育种技术路线，2000年实现了农业部制定的中国超级稻育种的第一期目标，2004年提前一年实现了超级稻第二期目标。先后获得“国家特等发明奖”、“首届最高科学技术奖”等多项国内奖项和联合国“科学奖”、“沃尔夫奖”、“世界粮食奖”等11项国际大奖。出版中、英文专著6部，发表论文60余篇。 毕业后，一直从事农业教育及杂交水稻研究。1980－1981年赴美任国际水稻研究所技术指导。1982年任全国杂交水稻专家顾问组副组长。1991年受聘联合国粮农组织国际首席顾问。1995年被选为中国工程院院士。1971年至今任湖南农业科学院研究员，并任湖南省政协副主席、全国政协常委、国家杂交水稻工程技术研究中心主任。 发现很多人不理解杂交水稻的真正意义，不少人认为自己是北方人，吃的是小麦，不吃水稻，就和袁隆平没关系。 举个简单的例子吧，假设世界上有100个人，而粮食只够90个人吃，粮食紧缺再加上财富的不均衡分配，那么就会出现50个人有充足的粮食，而另外40个人没粮食吃，于是大规模的饥荒和战乱就爆发了，这样这场危机就从10人波及到全部的100人。 如果世界有100人，而粮食够110-120个人吃，那么粮食就不再紧缺，就不会出现大规模囤积现象。全部的100人都可以避免这些危机。 袁隆平是我国的著名农学家，中国工程院院士，是我国杂交水稻研究领域的开创者和带头人，曾获国家最高科学技术奖和多项国际奖。
袁隆平院士,1930年9月出生于北京，汉族，江西德安人。1953年毕业于西南农学院，分配到湖南安江农校任教。1964年开始杂交水稻研究，1971年调入湖南省农业科学院，1978年晋升为研究员，被评为全国劳动模范。1995年当选为中国工程院院士，现任国家杂交水稻工程技术研究中心主任。
对于多细胞生物而言，细胞存在固有的异质性。随着单细胞测序技术的迅速发展，极大地丰富了我们对于细胞异质性和细胞功能的理解。近年来，随着植物原生质体制备等难题的逐步突破，植物单细胞测序愈发火爆，仅2021年上半年就已发文十几篇，其中不乏Cell、Nature Communications等期刊，广泛应用于拟南芥、水稻、玉米、番茄、杨树等物种。因此，植物单细胞测序的应用潜力不言而喻。那植物单细胞测序到底能如何大展身手呢？ 一、构建细胞图谱 植物组织是由不同形态且具有特定功能的细胞构成，不同细胞类型，其基因表达模式也存在差异。通过单细胞转录组测序，构建植物细胞图谱，使我们能深入了解植物组织中细胞类型的组成，获取每个细胞独特的转录本信息，从而鉴别细胞身份和功能。例如，2021年4月，中国科学院分子植物科学卓越创新中心的研究人员在期刊Nature Communications上发表的文章中，以5日龄野生型水稻（ZH11）幼苗胚根（靠近根尖1cm，约90个幼苗）为材料制备原生质体进行单细胞转录组测序。以获得的27,469个高质量单细胞转录组数据构建了水稻胚根细胞图谱，通过细胞聚类及注释分析，利用UMAP可视化，将这些细胞划分为21个不同的细胞类群，涵盖水稻根表皮、外皮层、厚壁组织、皮层、内皮层、中柱鞘、分生组织、维管组织等细胞类群。由此表明，水稻根尖是由高度异质的细胞组成的。 二、鉴定稀有细胞类群 基于液滴法的高通量单细胞测序使得捕获植物发育过程中各个时段的细胞成为可能，因此，通过绘制植物单细胞转录图谱，不仅可以鉴定植物组织中的主要细胞类型，还可以鉴定出植物组织中稀有的细胞类群。通过稀有细胞类群的鉴定，有利于深入挖掘其在植物发育分化过程行使的重要功能。例如，2019年2月，德国图宾根大学的研究人员在国际学术期刊Developmental Cell上发表的文章中，以6日龄拟南芥幼苗根尖（距离根尖1cm）为材料进行了单细胞转录组测序，通过特异性QC（静止中心）Marker基因鉴定出拟南芥根组织中稀有细胞群体QC细胞，并且发现，在亚簇C11.1中36个细胞至少表达了一半的QC基因，这与单细胞测序的采样深度以及大部分QC基因的相对低表达相一致。通过QC细胞和分生组织未分化细胞进行转录组比较，确定了254个优先在QC中表达的基因。QC细胞的鉴定，为深入研究这一罕见细胞类型的生物学功能提供了更多可能。 三、挖掘新Marker基因 在多细胞生物中，细胞类型以及细胞特异性功能的产生在很大程度上源于细胞中不同基因的差异表达。在单细胞转录组数据分析过程中，主要通过差异分析鉴定出某个细胞亚群的特征性基因，再结合Marker基因鉴定细胞类型。因此，新Marker基因的挖掘有助于深入阐明细胞异质性, 并且对于识别植物发育过程中未知细胞类型的细胞群体是非常关键的。例如，2020年6月，河南大学的研究人员在Molecular Plant期刊上发表的文章中，以5日龄拟南芥幼苗子叶为材料进行了单细胞转录组测序，利用几个已知的参与调控气孔谱系细胞发育的Marker基因对鉴定的细胞类型进行验证，发现FAMA、TMM、HIC和SCRM在特定细胞类型中特异性表达，而其他标记基因在特定的细胞类型中没有特异性表达，因此，为了探究气孔谱系细胞发育的潜在调控因子，分析了不同细胞类群中的基因表达谱，在每个细胞群中鉴定了高表达的标记基因即新Marker基因，并且进一步发现，这些Marker基因中部分可能参与调控气孔谱系细胞的发育。 四、研究细胞发育动态 拟时序分析是指根据细胞之间表达模式的相似性对单细胞沿着轨迹进行排序，以此推断出发育过程中细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程。通过绘制植物细胞间的发育分化轨迹来重塑细胞随着时间的变化过程，可以深入挖掘随着细胞状态的变化其细胞类型的改变，并进一步解析植物细胞分化路径，了解植物细胞的动态发育过程。例如，2021年4月，中国科学院分子植物科学卓越创新中心的研究人员在Nature Communications国际学术期刊上发表的文章中，以5日龄水稻胚根（距离根尖1cm，n=90）为材料制备原生质体进行单细胞测序，在该研究中，研究人员不仅揭示了水稻根单细胞异质性，还重建了水稻根表皮细胞（epidermal cell）和地上组织（ground tissue）细胞的连续发育分化轨迹，明确了在根尖干细胞分化过程中基因表达与基因染色质可及性的相关性，同时，结合拟南芥根尖和水稻根尖的转录组图谱和标记基因分析，揭示了单子叶植物水稻和双子叶植物拟南芥在根尖细胞类型上的进化保守性。 五、基因调控网络分析 组织内细胞异质性的基础是细胞转录状态的差异，转录状态的特异性又是由转录因子主导的基因调控网络决定并维持稳定的。对于植物发育的调控机制研究，从不同细胞类型的转录因子调控网络开始分析，有助于深入理解细胞发育的生物学功能。例如，2020年6月，河南大学的研究人员在Molecular Plant期刊上发表文章中，对来自5日龄拟南芥幼苗子叶中的12,844个单细胞进行了RNA测序，成功构建了拟南芥气孔谱系细胞的基因表达谱。在该研究中，研究人员为了发现参与调节气孔谱系细胞早期发育的潜在转录因子，对不同细胞类型中高表达的转录因子进行了研究，通过构建转录调控网络，揭示了从拟分生组织母细胞（MMCs）到保卫母细胞（GMCs）这一特定气孔发育阶段中转录因子的调控网络，研究结果表明TML1、BPC1、BPC6、SCRM、PIF5和WRKY33可能是调控MMCs、EMs、LMs和GMCs靶基因表达的核心转录因子。 六、非生物胁迫响应机制研究 非生物胁迫属于植物生长发育过程中的重要环境影响因素。通过单细胞转录组测序，探索不同处理条件下植物组织中细胞类型的组成变化，从而解析非生物胁迫反应机制，有利于我们了解单细胞水平上植物细胞和发育生物学的机理。例如，2020年9月，比利时根特大学的研究人员在Science国际顶级期刊上发表的文章中，以6日龄拟南芥幼苗根尖为材料制备原生质体进行单细胞转录组测序，探索低磷酸盐条件下拟南芥根应对该非生物胁迫的响应机制。研究表明，TMO5/LHW靶基因响应显著富集在根毛细胞中。在低磷条件下，TMO5/LHW异源二聚体会诱导维管细胞中可移动细胞分裂素的合成，从而通过改变表皮细胞的长度和细胞命运来增加根毛的密度。其次，缺乏磷酸盐所导致的根毛响应依赖于TMO5和细胞分裂素。该研究揭示了细胞分裂素信号转导将表皮上根毛响应与维管细胞对磷酸盐缺乏的感知联系到了一起。 七、保守性及差异性分析 针对植物同一物种不同亚种间或不同物种间外观形态、生物学性状特征等方面作比较，在种质资源研究中具有重要意义。基于单细胞水平，绘制同一物种不同亚种间的单细胞转录组图谱，通过不同亚种之间的比较，不仅可以揭示不同亚种在发育过程中分化轨迹的差异性和保守性，且有助于深入解析不同亚种在应对外部环境刺激的响应机制。例如，2020年12月，中国农业科学院生物技术研究所的研究人员发表在Molecular Plant上的文章中，以两个重要水稻栽培亚种（Nip和93-11）的3日龄幼苗根尖为材料进行了单细胞转录组测序，分别构建了这两个水稻亚种根尖的转录组图谱，通过拟时序分析发现，水稻根尖表皮的分化是以表皮细胞为起点，沿着假时间主干，一端最终发育为成熟的表皮细胞，一端最终分化为根毛细胞，两个水稻亚种的发育轨迹显示高度一致的拟时间顺序，揭示了不同亚种之间发育轨迹的保守性。功能富集分析发现，两个水稻亚种每种细胞类型的差异表达基因中大多数基因与环境响应有关，而且不同水稻亚种在受到外部环境刺激时响应机制存在差异。 八、重要转录因子功能研究 在植物单细胞测序中，不仅可以基于构建的基因网络鉴定在植物发育分化过程中起着关键作用的核心转录因子，还可以针对已知功能的转录因子进行突变体研究，从而解析该转录因子功能的丧失对植物组织成分以及细胞特性和分化的影响，有助于进一步探究重要转录因子是如何参与植物的组织或器官发育的。例如，在根中，SHORTROOT（SHR）和SCARECROW（SCR）这两个转录调控因子在转录调控复合体中发挥重要作用，而且对干细胞龛的维持和组织模式至关重要。在2020年6月，美国杜克大学的研究人员在bioRxiv发表的文章中，就以这两个转录因子的突变体为材料进行了单细胞转录组测序，绘制了拟南芥shr-2和scr-4突变体细胞图谱，以野生型拟南芥（WT）为对照，探究了SHR或SCR功能的缺失对于组织组成以及细胞的身份和分化的影响，结果发现，相比于WT，shr-2突变体中木质部、韧皮部和中柱鞘细胞的丰度显著减少，在scr-4中也检测到类似的变化，与已报道结果一致。 九、总结与展望 多篇植物单细胞转录组测序文章的发表证实了高通量scRNA-seq 方法在植物研究中的可行性和有效性，预示着植物研究已然进入了单细胞时代。在植物中开展单细胞转录组研究有助于深入理解不同细胞类型在发育过程中的作用以及细胞间的调控网络。但植物单细胞测序的应用方向远不止于此，从单一组织到多组织，单细胞多组学联合分析等亦是趋势。我们相信，在未来，植物单细胞测序遍地开花，时日可待。 参考文献： [1] Zhang T Q, Chen Y, Liu Y, et al. Single-Cell Transcriptome Atlas and Chromatin Accessibility Landscape Reveal Differentiation Trajectories in the Rice Root[J]. Nature Communications, 2021. [2] Denyer T, Ma X, K Lesen S, et al. Spatiotemporal Developmental Trajectories in the Arabidopsis Root Revealed Using High-Throughput Single Cell RNA Sequencing[J]. Developmental Cell, 2019. [3] Liu Z, Zhou Y, Guo J, et al. Global Dynamic Molecular Profiles of Stomatal Lineage Cell Development by Single-Cell RNA Sequencing[J]. Molecular Plant, 2020. [4] Wendrich J R, Yang B J, Vandamme N, et al. Vascular Transcription Factors Guide Plant Epidermal Responses to Limiting Phosphate Conditions[J]. Science, 2020, 370(6518). [5] Liu Q, Liang Z, D Feng, et al. Transcriptional Landscape of Rice Roots at the Single Cell Resolution [J]. Molecular Plant, 2020. [6] Shahan R, Hsu C W, Nolan T M, et al. A Single Cell Arabidopsis Root Atlas Reveals Developmental Trajectories in Wild Type and Cell Identity Mutants. bioRxiv, 2020.
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