中科院一区和JCR一区的最显著区别就是分区标准不同。SCI分区的主要标准是期刊的影响因子,两种分区的标准都是主要依据刊物的影响因子来划分的,不同之处在于分区的标准不同,JCR一区为影响因子前25%的期刊,中科院分区则是前5%为一区,从这个标准来看,中科院分区对期刊的划分标准更高一些。除了影响因子标准范围的不同,中科院分区是基于各专业期刊三年平均IF排名,而JCR分区是基于各个专业刊物当年的IF排名,再就是中科院是将刊物按照梯度划分,JCR分区则是平均划分,这是同一分区按照两类划分标准,所划分出的刊物有很大差别的主要原因,假设有100本期刊,按JCR分区法有25本是一区,按中科院分区法只有5本是一区。