查重数据库包括。不是所有的研究生的毕业论文都会上传知网，只有优秀硕士毕业论文才可以被知网收录，也就是可以搜到，但查重数据库会包括没有上知网的。知网查重的数据库包括中国学术期刊网络出版总库；中国博士学位论文全文数据库；中国重要会议论文全文数据库；中国重要报纸全文数据库等。
不仅仅是硕士的毕业论文，包括本科的毕业论文，只要经过学校进行存档之后，所有的都会加密，然后上传到知网上，也就是说所有的论文都可以在知网上查询得到。
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樱桃小胖子O
