不会。但是如果机构名称采取了引用可能会被标红。知网查重有时会把错误格式的引用标红。随着知网1版本的更新，对于引用部分，知网查重的识别率越来越高，引用率也越来越高。通常，知网查重检测报告当中会用绿色字体对引用部分进行标红，但是并非论文，只要用引号标注了引用部分就会被中国知网查重软件识别为引用部分。
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