从保护范围来讲，欧洲专利一定在德国有效，而德国专利只在德国境内有效。德国商标专利局和欧专局的关系是一个从属关系，但是不是同一个机构，欧洲专利可以转为德国专利，反过来也行。从申请成本来看，德国专利比欧洲专利的申请成本更低。但由于德国实际上是欧盟的一部分，现在的技术和产品等进入德国也实际上等同于进入其他加入欧盟的欧洲国家，所以实际上申请欧洲专利会更好。另外，如果产品仅仅只是外观需要保护的话，可以考虑只申请欧盟外观设计，也是一种知识产权的保护机制，更便宜也不需要等很久的时间，几天就下证。
1、审查机关不同： 欧洲专利(EP)由欧洲专利局审查并授权，德国专利(DE)由德国专利局审查并授权。2、专利有效范围不同：欧洲专利(EP)在在欧盟成员国内有效，德国专利(DE)只在德国有效。3、法律效力不同，欧洲专利(EP)需要在欧盟成员国内履行延伸手续后生效，而德国专利(DE)在授权后就在德国有效。
欧洲专利局是一个大多欧洲国家都参加了的专利组织，在欧专局获得授权之后，直接在德国履行登记等手续便可以获得德国专利。但是如果仅仅在德国申请了专利的话，无法在欧专局获得专利授权。
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