只有经过知网检测系统查重的研究生论文会被知网学术论文联合比对库收录，放在知网上，并且知网官网只会在研究论文查重后的第二年统一进行论文收录，所以研究生们不需要担心论文经过知网查重后会被知网收录，影响后期的论文查重。很多研究生在论文上交高校统一进行论文查重前都会提前使用知网检测系统进行论文查重，对论文中出现的各种学术不端行为进行修改，以确保高校统一进行研究生论文查重前能顺利通过论文查重。
一些论文未被知网收录。可能时间距离太近。如果没有签订上网许可，知网就无法收录论文内容。涉密即商业价值。有的部分比较敏感，涉及到了国防和国家安全，如果涉密那么肯定不会发表在网上，另一部分论文内容有商业价值，公开发布在知网上可能会侵犯利益。核心期刊不上知网。有少部分核心期刊没有和知网签订协议，有一部分假刊虚刊也无法在知网上查到。知网上传论文后，系统会自动检测论文的章节信息，若目录是自动生成的根据目录进行分章节检测，如果不是就会自动分段检测。
期刊发表以后会收录
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