安徽农业大学植物保护学院的前身是1960年设于原农学系的植物保护专业，1973年独立建系。学院先后创设农业环境保护专业（环境工程专业）、应用微生物专业（生物技术专业）、环境科学专业、生态学专业、动植物检疫专业。2004年经学校院系、学科调整后更名为植物保护学院。 学院现有植物病理学、农业昆虫与害虫防治2个省级重点学科、安徽省农产品安全重点实验室和安徽省植保技术培训中心，拥有农业昆虫与害虫防治博士学位授权点，植物病理学、农业昆虫与害虫防治学2个二级学科硕士学位授权点、植物保护学1个一级学科硕士授权点、植物保护（国家级特色专业）和动植物检疫2个本科专业和应用微生物与昆虫资源利用2个研究所，在读研究生47人、本科生688人。独立建系以来共为社会培养硕士研究生100余人、本专科生4000余人。学院现有教职工30人，其中教授7人，副教授及其它副高职称7人，博士5人，博士生导师2人，省跨世纪学科带头人2人，省高校中青年学科带头人3 人，教育部和省级骨干教师2 人，省模范教师、省优秀教师、省师德先进个人3人。学院学术气氛浓厚，近年来承担国家和省级科研项目 6 项，获省部级奖励 5 项，出版专著教材20余部，发表学术论文近300篇。先后邀请国外专家18人次、国内著名专家、院士16人次来院开展学术交流活动，并先后派出教师10余人次出国访问、进修、40余人次参加国内外学术会议。
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