地理信息科学是1992年Goodchild提出的，与地理信息系统相比，它更加侧重于将地理信息视作为一门科学，而不仅仅是一个技术实现，主要研究在应用计算机技术对地理信息进行处理、存储、提取以及管理和分析过程中提出的一系列基本问题。地理信息科学不属于计算机科学类，属于地理信息系统计算辅助应用。地理信息科学专业（geographic information science）原名地理信息系统专业（Geographic Information System或Geo－Information system或GIS）。2012在教育部印发的《普通高等学校本科专业目录（2012年）》中，在地理科学类专业中，地理信息系统专业已改为地理信息科学专业。
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