法律分析:专利入股合作支公司签订专利协议书流程如下:1、签订转让合同;2、到专利局办理登记手续,并由专利局公告,合同自登记之日起生效;3、若专利申请人为两个或者两个以上的人,专利申请权的转让必须经全体权利人同意,中国单位或者个人向外国人转让专利申请权或者专利权的,必须经国务院对外经济贸易主管部门会同国务院科学技术行政部门批准。法律依据:《中华人民共和国专利法》第十二条 任何单位或者个人实施他人专利的,应当与专利权人订立实施许可合同,向专利权人支付专利使用费。被许可人无权允许合同规定以外的任何单位或者个人实施该专利。