个人和公司申请的审查过程、申请时限 、申请难易度是没有差别的。个人申请归个人所有,与公司无关,职务发明由个人申请容易产生专利权属纠纷;公司申请权益归公司所有,无权属纠纷,在高新技术企业认定、公司上市做价方面比较易操作。个人申请如果经济困难的话可以享受减免,减缓前三年所交年费,只要交15% ;公司申请的话费用较贵,但在部分地区可以享受政府补贴。个人申请的话不利于品牌宣传,公司申请有利于企业品牌宣传,利于后期融资。个人申请可以享受减免缓、在部分在区有政府资助;公司申请在部分地区可享受政府补贴、利于评优、申报高新技术企业、进行专利质押等等。从费用上看,似乎个人申请更好一些,但如果针对企业,从长远上看还是以公司名义申请更好(福建康源知识产权)。