截至2013年底，学院有1个州级研究机构，2个校级研究机构。 州级 文山州生物资源开发研究中心 校级 文山三七研究院 文山民族研究所 馆藏资源截至2010年，文山学院图书馆藏书12万余册，报刊杂志600多种。 学术期刊《文山学院学报》是国家新闻出版总署批准、云南省教育厅主管、文山学院主办的综合性学术期刊。双月刊。学报是中国核心期刊（遴选数据库）、万方全文数据库、中文科技期刊数据库（CSTJD）、中国期刊全文数据库（CJFD）、中国期刊网全文数据库、中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）、中文电子期刊服务资料库（CEPS）等数据库收录期刊。
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