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pubmed 和SCI 是不同的数据库，所以没有办法合为一谈，pubmed上的文献不一定是SCI； 查看影响因子，可以去pubmed的网页上查，pubmed/。更权威的应该去web of Science 数据库中的 Journal CItation Report字库中去查询。
不一样的：中科院是中国中科院制定的，JCR是英加合资跨国集团Thomson Reuters 公司制定的分区（汤森路透分区）；两个分区制作者都有点弱智，汤森路透它平均切成四块，每块25%；中科院自以为聪明，一区：前5%；二区：6%~20%；三区：21%~50%；四区：51%~100%。其实这俩都不太科学。你们上学评优，有没有遇到过25%得优，或者5%得优；还有中科院居然把一半归为四区差不多下等了，大家想想就知道这两个都不合理对不对？比较正常的，10%优等一区；20%上等二区；30%中等三区；剩余40%四区可归到不太上手的那部分；其实中等在现实中占大多数，所以还可以在30%基础上再加一点而四区的40%可以减少一点都没问题。其他信息网上都有，我就不废话了，大家觉得我的建议合理的话左下角支持一下，谢谢！
中科院SCI分区和JCR分区区别为：依据不同、划分不同、归类不同。一、依据不同1、sci分区：sci分区是按期刊的三年版的平均影响因子来划分的。2、JCR分区：JCR分区是把某一个学科的所有期刊的上一年的影百响因子按降序排列，然后进行等分。二、划分不同1、sci分区：sci分区分为四个区度，每个区所占的比例是不相等的，一区：前5%；二区：6%~20%；三区：21%~50%；四区：51%~100%。2、JCR分区：JCR分区分为四个区度，每个区所占的比例是相等的，前25%(含25%)划分为1区，前25 -50% (含50%)为2区，前50-75% (含75% )为3区，75%~100%为4区。三、归类不同1、sci分区：sci分区基于JCR分区，将176个小类专业合并为了医学、生物学等14个学科。2、JCR分区：JCR分区按照小类的专业将学科归类174个小类。
虽然是两个概念，但是还是有一定联系的，中科院的分区参考了JCR的分区标准(都是基于索引数据)，但是中科院的分区比JCR的分区更严格一些。以下可能对你有所帮助：汤森路透JCR分区法：1、各学科分类中影响因子前25%(含25%)期刊划分为1区2、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前25 -50% (含50%)为2区3、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前50-75% (含75% )为3区4、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的后75%为4区中国科学院SCI分区法：中国科学院文献情报中心根据每年的JCR数据，将学科分为14个大类和174个小类。每个学科分类按照期刊的影响因子高低，分为4四个区：1、各学科分类中影响因子前5%(含5%)期刊划分为1区2、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前5-20% (含20%)为2区3、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前20-50% (含50% )为3区4、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的后50%为4区
虽然是两个概念，但是还是有一定联系的，中科院的分区参考了JCR的分区标准(都是基于索引数据)，但是中科院的分区比JCR的分区更严格一些。
分区的方法：一区刊：各类期刊三年平均影响因子的前5%，二区刊：前6%～20%，三区刊：前21%～50%，四区刊：后51%～100%
JCR文章检索时分区。因为JCR是Q4均分法，也就是按照25%一栏的分区方式。而中科院分区不一样，采用的是大类套小类的分区方式，先分大区然后再看小区突出一个顶端优势。每个大类前5%的期刊设定为一区期刊，同时为了增加TOP期刊的容量，一区期刊都是TOP。而二区期刊不仅仅要看影响因子，还要看引用频次，在小区内的影响力，所以即便影响因子高，也未必是TOP（引用频较高的前10%的期刊，会被列为TOP）。相关知识：一区期刊不论是jcr分区的一区，还是中科院的一区，只要是一区期刊，都是国际上知名的学术期刊，这部分期刊发表难度是非常大的，也不是任何人都可以发表的，对于普通作者来说，是非常困难的，且不说文章难写，对作者身份职务可能都会有一定门槛。一区期刊是不适合不同作者发表的，一般能发表一区的都是一些专家学者、知名大学教授、或者一些在本专业内有一定影响力的科研工作者。以上内容参考：百度百科--JCR
Web of Science中，检索到论文的信息后，其中点击“查看期刊信息 ”，有的会显示对于该期刊的不同“JCR® 类别”，而对应的“JCR分区”显示如Q2， Q3也是不同的。大部分学校都不看JCR的分区，而是参照中科院分区。
Web of Science中，检索到论文的信息后，其中点击“查看期刊信息 ”，有的会显示对于该期刊的不同“JCR® 类别”，而对应的“JCR分区”显示如Q2， Q3也是不同的。大部分学校都不看JCR的分区，而是参照中科院分区。
1、首先打开我们的微信，然后搜索中科院文献情报中心分区表公众号。2、进入该公众号，然后在界面下方中点击查询按钮。3、然后在查询的子菜单中点击期刊分区按钮。4、然后在方框中输入期刊名字或者ISSN，点击查询按钮即可。5、之后在查询结果中点击你搜索的期刊名字，进入相应的查询结果界面。6、在大类和小类中，我们可以看见中科院JCR期刊分区情况。7、这样即可查询期刊在中科院JCR期刊分区情况。
一区二区三区指的是地区，分别如下：一区包括北京、天津、河北、山西、辽宁、吉林、黑龙江、上海、江苏、浙江、安徽、福建、江西、山东、河南、湖北、湖南、广东、重庆、四川、陕西等21省（市）。二区包括内蒙古、广西、海南、贵州、云南、西藏、甘肃、青海、宁夏、新疆等10省（区）。分区是将全国各省、直辖市根据地理位置、交通便利程度等划分的几个区域，一区最便利，资费相应最低；三区最边远，资费相应最高；二区介于中间。sci期刊的分区：一区二区三区四区是sci期刊的分区，sci期刊的分区有两种，一种是jcr的分区，另一个是中科院的分区，这两类分区很类似，都是分为四个区，分区的标准也都是期刊的影响因子，至于不同区的期刊的区别，很显然的区别就是这四个区是按照影响因子由高到低排序的。一区期刊是影响因子最高，学术价值最高，影响力最大的期刊，四区期刊就是四个区中影响因子最低的一类刊物。