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正规毕业论文查重是不包括参考文献的，参考文献并不在毕业论文查重范畴内。可是毕业论文查重并不能够识别全部的参考文献，只有符合格式的参考文献才会被毕业论文查重识别出来，这也就意味着只有参考文献的格式规范且正确的时候，毕业论文查重才会将该部分参考文献排除出查。
以知网为例，知网查重是不包括参考文献的，参考文献并不在知网查重范围内。可是知网查重并不能识别全部的参考文献，只有符合格式的参考文献才会被知网识别出来，这也就意味和只有参考文献的格式规范且正确的时候，知网才会将该部分参考文献排除出查重范畴，所以只要格式正确规范，那么本科毕业论文查重就不会包括参考文献。
论文在查重时，参考文献是不会算在里面的，但是前提是参考文献的格式得正确；引言是肯定要算在里面的。
一般参考文献查重的时候是要删除的，引用部分如果格式正确也是可以识别出来。你最后所有的部分，都不要超过学校的要求
算的
论文查重是会所有会籍网上现有的文献，然后进行查程序对比。超过一定比例的话，你论文可能需要重写。
要看你索引的字数以及你们学校的规定。索引的字数不要太多，最好不要大段大段的引用，而且也得看你们学校的规定，有的学校查重的时候只看抄袭率，有时你引用自己的也算抄袭，的确很无奈。有的学校查重的时候会看你引文的出处，如果有出处，那么就不算了。所以最关键的还是要看学校会“怎么办”。当然，你最后查重用的是知网而不是万方，所以万方就算查重是0%也没有什么权威性，因为二者的差距还是比较大的，所以我建议你用知网CNKI去查重，这样比较保险。更重要的是，知网查重时很少会根据你的参考文献而去排除你抄袭的引文，也就是说，你所引用的文字，在知网上还是算重复率的，所以你要么少引用，要么把引用的加以修改~
被认定为抄袭的本科毕业设计(论文)，包括与他人已有论文、著作重复总字数比例在30%至50%(含50%)之间的，需经本人修改。修改后经过再次检测合格后，方可参加学院答辩。再次检测后仍不合格的，按结业处理。须在3个月后提交改写完成的毕业设计(论文)，检测合格后再参加答辩。这个具体的还是要根据自己的学校来，可以在手机上面的迅捷论文查重上面查重一下，这样的数据比较准确。
论文查重是会所有会籍网上现有的文献，然后进行查程序对比。超过一定比例的话，你论文可能需要重写。
算，不能超出总字数的百分之十。每个查重系统的标准不太一样，学校一般用的是知网查重系统，在万方上的检测结果只能作为一个参考。有些查重系统是直接把论文的引用部分排除在外，不计入论文的重复率。所有，主要还是看你学校用的是什么查重系统，和学校判定文献引用部分重复的规则。如果引用部分是算重复的，那么你在引用时最好自己再改改，只引用重要的数据和观点。
一般情况下，提交查重时，参考文献这部分内容是附带一起提交的，但是大部分查重系统特别是知网查重系统是可以有效识别出参考文献的，识别出来的参考文献里面的内容是不会被标红的。正常识别出参考文献的情况下，参考文献是不会有重复的。如果由于格式错误等原因导致参考文献当做正文被标红了，那此时就有相似比或重复率了。
你是问如何给文档自动降重并查找参考文献吗？操作如下：在文档当中输入论文内容。然后单击工具栏文档助手下的论文助手。弹出论文助手的对话框，可以先选择查重功能，看看文档查重率为多少。弹出论文查重的对话框，WPS软件自带可以免费查询3000字。选择参考文献功能，选中一段可以一键查出参考文献。当重复率很高的时候，可以选择自动将重功能。
学校一般都会规定，不允许使用特殊格式，你看看学校规定吧。我当年为了规避查重，把一部分弄成图片了，都让学校查出来了
参考文献可以在百度学术中找到。 毕业论文参考文献规范格式 一、参考文献的类型 参考文献（即引文出处）的类型以单字母方式标识，具体如下： M——专著 C——论文集 N——报纸文章 J——期刊文章 D——学位论文 R——报告 对于不属于上述的文献类型，采用字母“Z”标识。 对于英文参考文献，还应注意以下两点： ①作者姓名采用“姓在前名在后”原则，具体格式是： 姓，名字的首字母 如： Malcolm Richard Cowley 应为：Cowley, MR，如果有两位作者，第一位作者方式不变，&之后第二位作者名字的首字母放在前面，姓放在后面，如：Frank Norris 与Irving Gordon应为：Norris, F & IG； ②书名、报刊名使用斜体字，如：Mastering English Literature，English Weekly。 二、参考文献的格式及举例 期刊类 [格式][序号]作者篇名[J]刊名，出版年份，卷号（期号）：起止页码 [举例] [1] 王海粟浅议会计信息披露模式[J]财政研究，2004,21(1)：56- [2] 夏鲁惠高等学校毕业论文教学情况调研报告[J]高等理科教育，2004(1):46- [3] Heider, ER& DCO The structure of color space in naming and memory of two languages [J] Foreign Language Teaching and Research, 1999, (3): 62 – 专著类 [格式][序号]作者书名[M]出版地：出版社，出版年份：起止页码 [举例][4] 葛家澍，林志军现代西方财务会计理论[M]厦门：厦门大学出版社，2001： [5] Gill, R Mastering English Literature [M] London: Macmillan, 1985: 42- 报纸类 [格式][序号]作者篇名[N]报纸名，出版日期（版次） [举例] [6] 李大伦经济全球化的重要性[N] 光明日报，1998-12-27(3) [7] French, W Between Silences: A Voice from China[N] Atlantic Weekly, 1987-8-15(33) 论文集 [格式][序号]作者篇名[C]出版地：出版者，出版年份：起始页码 [举例] [8] 伍蠡甫西方文论选[C] 上海：上海译文出版社，1979：12- [9] Spivak,G “Can the Subaltern Speak?”[A] In CNelson & L Grossberg() Victory in Limbo: Imigism [C] Urbana: University of Illinois Press, 1988, 271- [10] Almarza, GG Student foreign language teacher’s knowledge growth [A] In DFreeman and JCRichards () Teacher Learning in Language Teaching [C] New York: Cambridge University P 50- 学位论文 [格式][序号]作者篇名[D]出版地：保存者，出版年份：起始页码 [举例] [11] 张筑生微分半动力系统的不变集[D]北京：北京大学数学系数学研究所, 1983：1- 研究报告 [格式][序号]作者篇名[R]出版地：出版者，出版年份：起始页码 [举例] [12] 冯西桥核反应堆压力管道与压力容器的LBB分析[R]北京：清华大学核能技术设计研究院, 1997：9- 条例 [格式][序号]颁布单位条例名称发布日期 [举例][15] 中华人民共和国科学技术委员会科学技术期刊管理办法[Z]1991—06—05 译著 [格式][序号]原著作者 书名[M]译者，译出版地：出版社，出版年份：起止页码 三、注释 注释是对论文正文中某一特定内容的进一步解释或补充说明。注释前面用圈码①、②、③等标识。 四、参考文献 参考文献与文中注（王小龙，2005）对应。标号在标点符号内。多个都需要标注出来，而不是1-6等等 ，并列写出来。求采纳为满意回答。