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应该是按小区吧
虽然是两个概念，但是还是有一定联系的，中科院的分区参考了JCR的分区标准(都是基于索引数据)，不过中科院的分区比JCR的分区更严格一些。以下可能对你有所帮助(摘自小木虫)：汤森路透JCR分区法：JCR将收录期刊分为176个不同学科类别。每个学科分类按照期刊的影响因子高低，平均分为4个区：各学科分类中影响因子前25%(含25%)期刊划分为1区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前25-50%(含50%)为2区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前50-75%(含75%)为3区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的后75%为4区；中国科学院SCI分区法：中国科学院文献情报中心根据每年的JCR数据，将学科分为14个大类和174个小类。每个学科分类按照期刊的影响因子高低，分为4四个区：各学科分类中影响因子前5%(含5%)期刊划分为1区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前5-20%(含20%)为2区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前20-50%(含50%)为3区；各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的后50%为4区；存在没有进入四个分区的SCI收录期刊。
这个东西，各个单位或学校给的奖励不一样，以我学校为例，一篇SCI奖8000
中科院期刊分区依据也是基于一个期刊的影响因子，具体方法：根据13个大类学科，分别将各大类的SCI期刊由3年平均影响因子划分为1区(最高区)、2区、3区和4区四个等级。中科院分区的1区到4区的期刊数量不等，呈金字塔状分布。前5%为该类1区、6%～20% 为2区、21%～50%为3区，其余为4区。 除大类分区以外，中科院也参照汤森路透JCR 分区一样，把期刊分为176个具体学科，就是指的小类学科。 参照大类同样的算法对小类学科区分 3 4区 于是这就出现了前面讲的问题，一本期刊按中科院分区标准，在大类分区和小类分区不一致的情况。
无论是哪一类分区，sci期刊都是划分为四个区，都是按照影响因子高低进行的划分，影响因子由一区至四区递减，一区最高，四区最低，所以，sci期刊中一区期刊学术价值和影响力是最大的，四区期刊在sci期刊中就是综合实力最弱的期刊。 对于作者来说，期刊分区越高，期刊的发表难度越大，一区期刊必然比四区期刊难以发表，一般普通作者很难发表一区期刊，能发表二区期刊对于国内作者来说就已经实属不易了，三区四区相对容易一些，但也只是相对于一区二区期刊，即便是四区期刊，也比国内核心期刊的发表难度高出不少。
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中科院自己划的。先是按学科，再按影响因子排列划分。反正不怎么好，水分略大。
大类分区。 目前国内高校科研院所使用最多的就是中科院分区,中科院分区有大区和小区。通常说的都是大区,小区分区往往容易导致期刊分区高。
区期刊不论是jcr分区的一区，还是中科院的一区，只要是一区期刊，都是国际上知名的学术期刊，这部分期刊发表难度是非常大的，也不是任何人都可以发表的，对于普通作者来说，是非常困难的，且不说文章难写，对作者身份职务可能都会有一定门槛，一区期刊是不适合不同作者发表的，一般能发表一区的都是一些专家学者、知名大学教授、或者一些在本专业内有一定影响力的科研工作者。 二区期刊仅次于一区期刊，二区sci期刊国内作者发表的就相对多一些了，目前国内一些标准中明确要求发表二区及以上期刊，所以二区是很多国内作者的首选，二区期刊发表难度略小，但也要看具体的学科和具体的期刊，一般的规律是二区期刊较一区期刊容易一些。 三区四区期刊的发表难度就会更低一些，但三区四区期刊在国内有些许争议，就是因为上述我们提到的硬性要求，有些单位和高校是不认可二区以下的刊物的，因此，很多作者会认为三区四区刊物不值得发表，没有发表价值，其实对于大多数普通作者来说，只要能发表sci论文就已经实属不易了，国内也有很多单位只要是sci论文就认可，对分区，没有过多要求，这种情况下三区四区期刊也是可以发表的。
区期刊不论是jcr分区的一区，还是中科院的一区，只要是一区期刊，都是国际上知名的学术期刊，这部分期刊发表难度是非常大的，也不是任何人都可以发表的，对于普通作者来说，是非常困难的，且不说文章难写，对作者身份职务可能都会有一定门槛，一区期刊是不适合不同作者发表的，一般能发表一区的都是一些专家学者、知名大学教授、或者一些在本专业内有一定影响力的科研工作者。 二区期刊仅次于一区期刊，二区sci期刊国内作者发表的就相对多一些了，目前国内一些标准中明确要求发表二区及以上期刊，所以二区是很多国内作者的首选，二区期刊发表难度略小，但也要看具体的学科和具体的期刊，一般的规律是二区期刊较一区期刊容易一些。 三区四区期刊的发表难度就会更低一些，但三区四区期刊在国内有些许争议，就是因为上述我们提到的硬性要求，有些单位和高校是不认可二区以下的刊物的，因此，很多作者会认为三区四区刊物不值得发表，没有发表价值，其实对于大多数普通作者来说，只要能发表sci论文就已经实属不易了，国内也有很多单位只要是sci论文就认可，对分区，没有过多要求，这种情况下三区四区期刊也是可以发表的。
无论是哪一类分区，sci期刊都是划分为四个区，都是按照影响因子高低进行的划分，影响因子由一区至四区递减，一区最高，四区最低，所以，sci期刊中一区期刊学术价值和影响力是最大的，四区期刊在sci期刊中就是综合实力最弱的期刊。 对于作者来说，期刊分区越高，期刊的发表难度越大，一区期刊必然比四区期刊难以发表，一般普通作者很难发表一区期刊，能发表二区期刊对于国内作者来说就已经实属不易了，三区四区相对容易一些，但也只是相对于一区二区期刊，即便是四区期刊，也比国内核心期刊的发表难度高出不少。
将所有SCI期刊按影响因子排序，前5%是一区，前20%是二区一般SCI论文分四个区，一区都是国际顶级期刊，二区次之，