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读下latex或ctex的帮助文档吧。如果你安装了texlive，在命令行里输入texdoclshort或texdocctex就可以了。两份文档都很基础，写中文推荐后者。模板一般存为sty格式，只要在\documentclass{...}和\begin{document}之间输入\usepackage{模板名}就可以使用该模板了。
那个cls的是模板，比如文件名为sample.cls则：\documentclass{sample.cls}后边按照模板要求的环境写，你应该看看那个模板的readme
tex是tex文件，aux是交叉引用辅助文件，log是日志文件，bbl是参考文献，dvi是可以预览的文件。
latex 模板使用具体操作如下：
1、配置编辑器，依次点击Options、Configurate，在新开的对话框中，勾选BibTex Export，确认。
2、下载好的模板解压后打开文件件找到main.tex主文件双击并打开，每次修改之后及时pdfLaTex编译。每当出现一个暂时还比较满意的状态，应该整个文件夹另存为以下，再接着改。
3、打开模板后，点击软件菜单栏的tools菜单，下图左侧是弹出的下拉菜单一定要按照图中文字顺序执行，因为一旦编译报错，撤销操作之后再编译会依然报错（可能是生成了撤销操作无法改动的中间文件)。换句话说无法撤销到上一次报错的编译之前。
4、如果是Texnicenter编译器，则用下图的方法进行执行程序，在BibTex编译之前，pdfLaTex编译出来的所有引文以问号代替，文章后面也没有Reference.但是这个结果一定要备份保留的，因为这时至少pdf还能打开。
5、最后把论文编辑成sample里面的形式，下图所示，为latex公式及输出效果。
通过我自己摸索一个月LaTeX的经验，结合刘老师的答案，楼主可以去找清华大学硕士论文的模版，通过查看源代码、Class、stlye自定义，可以了解文本格式的定义和设置。看过模版的源代码之后，并不是说你能用的好，毕竟LaTeX的核心是数学公式，只有多写代码，多编译、查看PDF，体会不同公式定义的微妙变化。至于字体，文章标题格式，边距，行距，缩进、文武线，页脚页眉页码等，都在模版定义好了，你只需要填充内容。如果只是学会使用模板，调用命令的话，ShareLaTeX, Online LaTeX Editor 是个蛮好用的网站，有很多模板参考，可以在线或者下载源文件看。如果是想自己写.cls和.sty文件，我就不太清楚了，可能具体查模板里每一个class和package的用法会有帮助吧。
sci论文格式模板
每个期刊的guidelines 都各有不同，有些要求非常详尽，但有些却相对简单，在这种情况下，作者也许会产生疑问和困惑，在没有提及要求的部分，论文格式该如何修改呢?以下表格是关于论文格式修改的通用apa模式。这是许多期刊的通用格式，尤其在某些期刊要求不明晰的'情况下，可参考以下格式对论文进行修改，以确保论文在格式上的统一，以便期刊进行审阅。
纸张大小标准的8.5英寸x11英寸纸张大小
页边距上下左右页边距都为1寸英
字体12号字体大小。times roman. 但是图片使用无衬线字体，如arial
行距两倍行距
对齐方式左对齐(右边距不相等)
段落缩进5 - 7个空格
句末句号后一个空格
页码标题页开始，除图片页外每一页的右上角，离顶部0.5英寸处标上页码，右对齐。
标题页标题页通常是第一页。在页码下一行，副标题左对齐，副标题要全部大写。
在副标题下，使用大写和小写表示以下内容，居中对齐。
文章标题你的名字你所属的机构信息段落标题一级标题使用大小写字母，并且居中。
二级标题使用大小写字母，左对齐。
表和插图除非期刊有特别要求，除此之外，表和插图放在文章的最后。一表一页，在页码下方第一行，使用标题如table 1 (等)，左对齐。两倍行距，标题左对齐(使用大写和小写字母的斜体)。
图片说明应该是有文章页码的最后一页。图标签使用figure 1 (等)，斜体，而说明本身不用斜体。标题用正规的句子大小写。图片跟随在后，一图一页段落主要顺序以下每一个部分(如果存在的话)都是从新的一页开始:标题页、摘要(一般在150-250单词之间) 、文章主体、参考文献、图说明、表格、图片。
缩写在摘要和正文第一次提及时均须先写出完整名称。
利益冲突/金融免责声明作者必须说明所有支持文章发表的资金来源。这个要求包括任何公司或机构的资金来源。通过提交中心提交稿件时，应提及资金来源和任何其有关利益冲突(coi)的解释。在文章中也应提及利益冲突，某些期刊要求放在标题页，有些期刊要求放在文章末参考文献前。
伦理声明对人类进行的研究必须遵循国际和国家的法规。当使用实验动物进行研究时，在动物福利上，必须遵循国际公认的准则，以及地方和国家法规。在提交文章时，作者应该有一个声明
资金声明资金组织的名称和相关的授权号码应写全。一般来说，这可以写在致谢中。但不同的期刊也有不同的要求。
直接用elsevier的Latex模板写，我刚写完一个稿子，准备投这个期刊
comments是问你对期刊或编辑有何建议。范围很广，可以表明自己投文章的立场，如本论文是作者花费了足够时间和精力完成的，从未发表过，在申请贵期刊间，不会考虑别的期刊等等。
当然同领域内有作者有利益冲突的研究人员，作者可以在此说明，免得冲突人员做审稿人。发表论文可以咨询。
稿准备。
稿件（Manuscript）：Word / Latex格式，部分期刊使用模板（Template）。
作者（Author）：全体作者姓名、工作单位、地址、邮箱、邮编、ORCID及其他信息。注明第一作者，通讯作者，并列作者，根据要求用不同符号标出（通讯作者常用＊）。
投稿信（Cover Letter）：写明期刊名称，文章类型、文章简介、文章亮点、通讯作者姓名、工作单位、地址、邮箱、邮编等联系方式。
图片（Figures）：Tiff / Eps格式，根据要求调整分辨率（DPI），部分期刊要单独上传。
表格（Tables）：放置在Word文档中。部分期刊要单独上传。
推荐或回避审稿人（Recommended / Opposed Reviewers）：根据要求推荐、回避某位的审稿人。
版权转让协议书（Copyright Transfer Agreement）：根据要求签署（Open Access除外）。
图摘（Table of Contents），可选，根据期刊要求。
附加材料（Supplementary Materials）：非关键性的辅助数据、其他图表、影片、音频等。
IEEE模板指定twoside选项,然后用markboth
ieee的期刊提交分为两个版本的论文
注：既然你问这个问题，是不是从ieee网站上下载了latex压缩包。如果是的话，里面不是有IEEEtranHOWTO.pdf吗，直接看就行了呗。其实那个pdf里面一大堆IEEE自己定义的东西基本上用不到的。只要你会基本的latex排版规则，再加上会一点公式输入规则，熟悉amsmath宏包中多行公式的排版等等，会插入图片，把自己的非ieee模板论文弄好，然后把.tex文件的\documentclass{article}换成\documentclass[journal,oneside]{IEEEtran}之类的就OK了。
下载地址引擎搜索，方法如下。Latex以其版面的整洁和操作的便利性，成为了最通用的论文编辑格式。本文给出了IEEE中论文出版的latex模板，以备不时之需。以conference模板为例进行说明：下载正文的模板文件：LaTeX Template Instructions里面包括4个文件：1、conference_041818.pdf //tex文件编译后的pdf。2、conference_041818.tex //正文tex文件。3、IEEEtran.clsI。 4、EEEtran_HOWTO.pdf //IEEEtran.cls的使用方法。cls文件cls文件是latex2e（latex的标准版本）的格式文件，它决定了latex源文件的排版布局。最一般的cls文件就是我们常用的article.cls,这表现在\documentclass{article}这一句里面。如果出版方提供了cls文件，我们可以下面两个方法使用(假如cls文件名为xxx.cls)：cls文件和你自己的latex文件放到同一个文件夹里面，在源文件里面用。
用他提供的conf.tex 那个文件即可，不用做什么设置。
ieee的期刊提交分为两个版本的论文
注：既然你问这个问题，是不是从ieee网站上下载了latex压缩包。如果是的话，里面不是有IEEEtranHOWTO.pdf吗，直接看就行了呗。其实那个pdf里面一大堆IEEE自己定义的东西基本上用不到的。只要你会基本的latex排版规则，再加上会一点公式输入规则，熟悉amsmath宏包中多行公式的排版等等，会插入图片，把自己的非ieee模板论文弄好，然后把.tex文件的\documentclass{article}换成\documentclass[journal,oneside]{IEEEtran}之类的就OK了。
tex是tex文件，aux是交叉引用辅助文件，log是日志文件，bbl是参考文献，dvi是可以预览的文件。
latex 模板使用具体操作如下：
1、配置编辑器，依次点击Options、Configurate，在新开的对话框中，勾选BibTex Export，确认。
2、下载好的模板解压后打开文件件找到main.tex主文件双击并打开，每次修改之后及时pdfLaTex编译。每当出现一个暂时还比较满意的状态，应该整个文件夹另存为以下，再接着改。
3、打开模板后，点击软件菜单栏的tools菜单，下图左侧是弹出的下拉菜单一定要按照图中文字顺序执行，因为一旦编译报错，撤销操作之后再编译会依然报错（可能是生成了撤销操作无法改动的中间文件)。换句话说无法撤销到上一次报错的编译之前。
4、如果是Texnicenter编译器，则用下图的方法进行执行程序，在BibTex编译之前，pdfLaTex编译出来的所有引文以问号代替，文章后面也没有Reference.但是这个结果一定要备份保留的，因为这时至少pdf还能打开。
5、最后把论文编辑成sample里面的形式，下图所示，为latex公式及输出效果。
用elsarticle模板就行，摘自Applied Mathematics and Computation > Guide for authors关于LaTeX 部分的说明：You are recommended to use the Elsevier article class elsarticle.cls (http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/elsarticle) to prepare your manuscript and BibTeX (http://www.bibtex.org) to generate your bibliography.For detailed submission instructions, templates and other information on LaTeX, see http://www.elsevier.com/latex.
如果杂志社给的模板名为 classname.cls 可以写成\documentclass[options]{classname}如果杂志社给的模板名为 packagename.sty 可以写成\usepackage[options]{packagename}如果在Windows下，建议你用CTeX套装下载一个Basi版(136M)安装后，所需的宏包可以自动连网下载安装。一个很好的LaTeX中文教材有个关于LaTeX的好网站
由于投稿需要用到latex模板，原来听说latex使用很方便，总觉得这玩意是装逼的，一直听说搞cs那帮人用的多，但总是偷懒没去学，结果要投的一个杂志必须要这个。这下总是躲不过去的，就花了几天的时间去弄了下，踩了无数个坑，算是弄了一个模板出来，方便以后投稿用；也希望后续不要再踩这些坑。 首先要说的是这个模板是基于 Applied Mathematics and Mechanics 使用的，里面有个这个杂志的专用包，感觉写出来格式还行，所以就依据这个模板了。 这个随便吧，你用notepad++或者自带的tex都行，反正我都觉得不好用。 这个参考知乎的李老师就行。 网站附上：如何从零开始，入门 LaTeX？ - 孟晨的回答 - 知乎 几点需要注意的是： 有啥再补充
tex是tex文件，aux是交叉引用辅助文件，log是日志文件，bbl是参考文献，dvi是可以预览的文件。
latex 模板使用具体操作如下：
1、配置编辑器，依次点击Options、Configurate，在新开的对话框中，勾选BibTex Export，确认。
2、下载好的模板解压后打开文件件找到main.tex主文件双击并打开，每次修改之后及时pdfLaTex编译。每当出现一个暂时还比较满意的状态，应该整个文件夹另存为以下，再接着改。
3、打开模板后，点击软件菜单栏的tools菜单，下图左侧是弹出的下拉菜单一定要按照图中文字顺序执行，因为一旦编译报错，撤销操作之后再编译会依然报错（可能是生成了撤销操作无法改动的中间文件)。换句话说无法撤销到上一次报错的编译之前。
4、如果是Texnicenter编译器，则用下图的方法进行执行程序，在BibTex编译之前，pdfLaTex编译出来的所有引文以问号代替，文章后面也没有Reference.但是这个结果一定要备份保留的，因为这时至少pdf还能打开。
5、最后把论文编辑成sample里面的形式，下图所示，为latex公式及输出效果。
用他提供的conf.tex 那个文件即可，不用做什么设置。
一般情况下，投ieee的期刊要提交两个版本的论文。一个版本是手稿模式，要求页面四周留出一英寸的空白，正文字号大于等于11号，双倍行距另一个版本是双栏模式，就是正式出版时候的样子。这个版本没什么用的，主要是告诉自己论文有多长，发表的时候要交多少钱而已下面一段 guideline 摘自 signal processing society 某期刊的要求，里面有讲具体设置的方法的Authors using LaTeX: the two PDF versions of the manuscript needed for submission can both be produced by the IEEEtran.cls style file. A double-spaced document is generated by including /documentclass[11pt,draftcls,onecolumn]{IEEEtran}as the first line of the manuscript source file, and a single-spaced double-column document for estimating the publication page charges via \documentclass[10pt,twocolumn,twoside]{IEEEtran}for a regular submission, or \documentclass[9pt,twocolumn,twoside]{IEEEtran}for a Correspondence item.不同期刊有不同的要求，自己要看好相应期刊的 information for authors 再补充点吧 在 ieee 网站上下载到的命名为 IEEEtran 压缩包，解压后有一些文件 如果投的是 computer society 的期刊，则使用 bare_jrnl_comsoc.tex 编辑 否则使用 bare_jrnl.tex 这些 tex 文件里面的注释文字会提供一些很有用的信息