1 科技图书 2 科技期刊 3 科技报告 4 科技会议文献 5 专利文献 6 标准文献 7 政府出版物 8 学位论文 9 产品样本 10 科技档案
在文献著录中,关于信息源的概念有两个:一是主要信息源;二是规定信息源。主要信息源是指文献著录时,优先选用的著录内容的来源。规定信息源是指文献著录时,据以选取各个著录项目的信息来源。各种文献类型的主要信息源:普通图书书名页或版权页标准文献封面(单行本)、题名页(汇编本)科技报告封面或题名页学位论文封面古籍正文首卷卷端和正文各卷卷端金石拓片所载的各项资料地图资料地图本身或图夹、封套等乐谱未规定录音资料标签、盒封或封套影像资料片头、标签、盒封静画资料题名页或封面连续出版物题名页、封面或版权页缩微资料第四、第二画幅、题名画幅等计算机文档题名屏幕希望对你有所帮助。
期刊、专利文献、标准文献、学位论文、会议文献、图书、科技报告、 产品资料、技术档案、政府出版物。
文献信息资源,以文字、图形、符号、声频、视频等方式记录在各种载体上的知识和信息资源。它记录着无数有用的事实、数据、理论、方法、假说、经验和教训,是人类进行跨时空交流,认识和改造世界的基本工具。
这类信息经过加工、整理,较为系统、准确、可靠,便于保存与利用,但也存在信息相对滞后、部分信息尚待证实的情况。从整体上说,这类信息是当前数量最大、利用率最高的信息资源。按照各种标准,可以划分出文献的各种类型。
扩展资料
按信息资源的产生秩序与整理加工深度划分
1、零次信息资源
未以公开形式进入社会使用的实验记录、会议记录、内部档案、论文草稿、设计草稿,以及未经发表的名人手迹、口头言论和无形的思想意识。它内容新颖,但不成熟、不定型。
2、一次文献信息资源
以科学研究、工作实践中的新成果、新知识和经验总结为依据,经加工创作进入社会公用的专著、学术论文、专利说明书、科技报告等,它是最基本的文献信息资源。它提供新观点、新发明、新技术、新成果,具有创造性特点,有直接参考、借鉴和使用价值,是人们检索和利用的主要信息资源。
3、二次文献信息资源
根据实际需要,按照一定的科学方法,将特定范围的分散无序的一次文献按照一定的方法进行加工、整理、提炼、组织,使其成为便于存贮、检索的系统,专供查考一次文献、情报资料线索和核心知识的工具。包括书目、索引、文摘、图书馆目录等。它是检索一次文献的工具性信息资源。
4、三次文献信息资源
通过二次文献提供的线索,选用大量一次文献,将其按某学科、某类问题、某专题、某事物等内容收集起来,进行综合分析、概括评述、系统研究,撰写成学科性的著作。
包括综述研究和参考工具两类,如:专题述评、动态综述、进展报告、百科全书、年鉴、手册等,它综合性高,针对性强,系统性好,知识信息面广,为人们的学习与研究提供参考和借鉴。
参考资料来源:百度百科-文献型信息资源
参考资料来源:百度百科-文献信息资源
文献信息源编辑文献是记录有知识的一切载体(GB/T —1983)。具体地说,文献是将知识、信息用文字、符号、图像、音频等记录在一定的物质载体上的结合体。在查新中,文献是科技文献的简称,是指通过各种手段(文字、图形、公式、代码、声频、视频、电子等)记录下科学技术信息或知识的载体,这个载体也就是信息源。主要文献信息源及其特点一、科技图书一般来讲,图书是指内容比较成熟、资料比较系统、有完整定型的装帧形式的出版物。科技图书是一种重要的科技文献源,它大多是对已发表的科技成果、生产技术知识和经验的概括论述。科技图书的范围较广,主要包括:学术专著、参考工具书(指对某个专业范围作广泛系统研究的手册、年鉴、百科全书、辞典、字典等)、教科书等等。对要较全面、系统地获取某一专题的知识,参阅图书是行之有效的方法。二、科技期刊期刊(Periodicals)也称杂志(Journals 或 Magazine),是指那些定期或不定期出版、汇集了多位著者论文的的连续出版物。科技期刊在科技情报来源方面占有重要地位,约占整个科技信息来源的65%~70%。它与专利文献、科技图书三者被视为科技文献的三大支柱,也是科技查新工作利用率最高的文献源。科技期刊的特点是:每种期刊都有固定的名称和版式,有连续的出版序号,有专门的编辑机构编辑出版,与图书相比,它出版周期短,刊载速度快,数量大,内容较新颖、丰富。三、专利文献专利文献通常是指发明人或专利权人申请专利时向专利局所呈交的一份详细说明发明的目的、构成及效果的书面技术文件,经专利局审查,公开出版或授权后的文献。广义的专利文献还包括专利公报(摘要)及专利的各种检索工具。专利文献的特点是:数量庞大、报道快、学科领域广阔、内容新颖、具有实用性和可靠性。由于专利文献的这些特点,它的科技情报价值越来越大,使用率也日益提高。本书第四部分第十九章将专门介绍专利文献及其检索。四、科技报告科技报告(Scientific and Technical Report),又称研究报告和技术报告,是科学技术工作者围绕某个课题研究所取得的成果的正式报告,或对某个课题研究过程中各阶段进展情况的实际记录。科技报告自20世纪20年代产生以来,发展迅速,已成为继期刊之后的第二大报道科技最新成果的文献类型。从报道的内容看,科技报告大多都涉及高、精、尖科学研究和技术设计及其阶段进展情况,客观地反映科研过程中的经验和教训。科技报告的特点是:单独成册,所报道成果一般必须经过主管部门组织有关单位审定鉴定,其内容专深、可靠、详尽,而且不受篇幅限制,可操作性强,报告迅速。有些报告因涉及尖端技术或国防问题等,所以一般控制发行。目前,世界上各发达国家及部分发展中国家每年都有相当数量科技报告产生,尤以美、英、法、德、日等国的科技报告为多。在科技查新工作中利用较多的是美国国家技术信息服务局NTIS(The National Technical Information Service of the Deportment of Commerce)出版的《美国政府研究报告通报与索引》,有数据库和检索刊物以及缩微平片等多种形式可利用。五、学位论文学位论文是高等院校和科研院所的本科生、研究生为获得学位资格(博士、硕士和学士)而撰写的学术性较强的研究论文,是在学习和研究中参考大量文献、进行科学研究的基础上而完成的。学位论文的特点是:理论性、系统性较强,内容专一,阐述详细,具有一定的独创性,是一种重要的文献信息源。学位论文除在本单位被收藏外,一般还在国家指定单位专门进行收藏。国内收藏硕士、博士学位论文的指定单位是中国科学技术信息研究所和国家图书馆。检索国内学位论文可以利用《中国学位论文数据库》,检索国外学位论文可利用Dialog国际联机系统或国际大学缩微胶卷公司(University Microfilms International)编辑出版的《国际学位论文文摘》、《美国博士学位论文》以及《学位论文综合索引》等检索工具。六、会议文献会议文献是指各种科学技术会议上所发表的论文、报告稿、讲演稿等与会议有关的文献。目前,全世界每年出版的会议论文集已超过4千种,会议论文数十万篇。国内已有《科技会议论文数据库》可供检索。会议文献的主要特点是:传播信息及时、论题集中、内容新颖、专业性强、质量较高,往往代表某一学科或专业领域内最新学术研究成果,基本上反映了该学科或专业的学术水平、研究动态和发展趋势。会议文献是科技查新中重要的信息源之一。七、政府出版物政府出版物是指各国政府部门及其设立的专门机构发表、出版的文件,可分为行政性文件(如法令、方针政策、统计资料等)和科技文献(包括政府所属各部门的科技研究报告、科技成果公布、科普资料及技术政策文件等),其中科技文献约占30%~40%左右。政府出版物的特点是:内容可靠,与其他信息源有一定重复。借助于政府出版物,可以了解某一国家的科技政策、经济政策等,而且对于了解其科技活动、科技成果等,有一定的参考作用。美国政府出版物数量最多,每年有几千篇公开,其他国家如英国、加拿大、法国等也出版一定数量的政府出版物。查找美国政府出版物可检索索引性刊物。
主要有以下几种类型:1.印刷型文献2.微缩型文献3.机读型文献4.视听型文献
按载体类型划分 按出版类型划分 按文献内容的加工深度和内容性质划分 文献信息类型的划分 书写型文献: 手工书写或抄写方式记录在载体上。一般具有一定的保存价值。 例如:古代文献、书法作品、手稿、书信、原始记录。按载体类型 印刷型文献: 以纸张为信息载体,形成纸质出版物,是图书馆收藏文献主要类型。 优点; 信息资源丰富,便于阅读; 符合人们的阅读习惯,利于深阅读。 缺点; 收藏、管理需较大空间和人力; 借阅不便,文献资源共享困难。按载体类型 微缩型; 以感光材料为载体,用微缩照相方法为记录手段把文献缩小形成的复制文件。 例如微缩胶卷、胶片、照片等。 优点 体积小、存储密度高、节省空间, 缺点 单须借助显微阅读器才能阅读 按载体类型 视听型: 又称“声像资料”、“视听资料”,利用声像技术记录声音、图像,通过播放手段给人以听觉、视觉感受的文献。 分为录音、录像、音像资料, 包括;唱片、录像带、电影、电视片、录音带等。 按载体类型 电子型; 把信息和知识记录在计算机存储介质上或通过通讯网络传送到用户终端的出版物。 例如网络数据库、电子期刊、网络全文图书。 按载体类型 1、参考数据库 ⑴数目数据库 记录是对数据信息、知识的再 加工和过滤。 ⑴书目数据库 如图书馆的馆藏机读目录数据库。⑵文摘和索引数据库 如SciFinder. 2.全文数据库 收录有原始文献全文的数据库,以期刊论文、会议论文、政府出版物、研究报告、法律条文和案例、商业信息等为主。⑴电子图书 ⑵电子期例如CD-ROM. ⑶电子报纸 电子型文献按发布形式分类: 3.事实数据库 包含大量数据、事实,直接提供原始资料的数据库。 ⑴数值数据库,如统计数据库 ⑵指南数据库 ⑶术语数据库,如网络词典、电子百科全书
未公开的学位论文属于灰色信息源。学位论文是作者为获得某种学位而撰写的研究报告或科学论文。一般分为学士论文、硕士论文、博士论文三个级别。其中尤以博士论文质量最高,是具有一定独创性的科学研究著作,是收集和利用的重点。学位论文代表不同的学识水平,是重要的文献情报源之一。它一般不在刊物上公开发表,只能通过学位授予单位、指定收藏单位和私人途径获得。
下列信息来源属于文献型信息源是D.图书。
一般来讲,图书是指内容比较成熟、资料比较系统、有完整定型的装帧形式的出版物。科技图书是一种重要的科技文献源,它大多是对已发表的科技成果、生产技术知识和经验的概括论述。
科技图书的范围较广,主要包括:学术专著、参考工具书(指对某个专业范围作广泛系统研究的手册、年鉴、百科全书、辞典、字典等)、教科书等等。对要较全面、系统地获取某一专题的知识,参阅图书是行之有效的方法。
图书特点:
内容比较系统、全面、成熟、可靠,但出版周期较长,报道速度相对较慢。
以下情况会用到:
1)系统地学习知识;
2)了解关于某知识领域的概要;
3)查找某一问题的具体答案。
文献的"十大信息源"是这些:科技图书、科技期刊、科技报告、科技会议文献、专利文献、标准文献、政府出版物、学位论文、产品样本、科技档案。
学位信息采集填报,若导师的课题是学校的课题,论文选题来源选”学校自选项目“;若导师没有申请立项,自己弄的课题论文选题来源选”非立项“;如果你的选题跟导师的课题没有关系,纯粹自己选的,论文选题来源选”其他”。
具体如下:
选题来源就是你这篇论文是否是某个课题的组成部分,譬如你导师申请并立项了一个课题,他分配给你写其中某个部分,那你就要填导师的那个课题来源。
若导师的课题是国家级,你就填国家级课题,若导师的课题是学校的课题,你就填学校自选课题,若导师没有申请立项,自己弄了个课题在琢磨,他让你帮着做一部分,这个叫非立项。
如果你的选题跟导师的课题没有关系,纯粹自己选的,那你就填”其他”。
论文类型中,基础性研究指的是你的论文讲的是本专业一些基本概念,应用型研究指的是你的论文可以转化为某个产品。举个例子,你如果是学化学的,你研究水为什么是h2o,这就是基础研究;你发明一个技术,可以从空气中提取水,这叫应用型研究。
综合性研究则是综合了基础与应用两方面,一般论文还达不到这个档次,如果上面三种都不是,你就填”其他”。你可以根据自己情况,如实填写。
非立项
非立项课题则是根据自身实际,开展的课题,不必进行申请评审的选题来源。
论文选题来源通常为学校自选、非立项、其他等,根据论文的实际情况而定,确是选题来自国家及省级科研立项或横向项目等,如实选择即可。
研究生学位论文选题包括选择方向、开展调查、界定范围、确定题目等几个环节。在选题的方向确定以后,还要经过一定的调查研究,来进一步确定选题的范围,以便最后选定具体题目。
学位论文的选题除掌握选题的来源与方法之外,还应掌握选题的技巧。
1、论文选题来源的填写要根据你的课题的支撑经费来填写。
2、比如是国家的科研项目,或者是省市的科研项目,或者是企业合作的横向科研项目等等。3、论文选题选好后,就要开始课题研究了,课题研究的周期一般起码一年,研究完成后,就可以撰写毕业论文了。
根据导师指导意见与个人兴趣及能力,从导师所给参考题目中选定。通过查阅相关资料并在导师的指导下共同商定此论文题目。在大学各课程的学习中对×××的现状与发展这一问题产生了浓厚的兴趣,有极大的热情对其进行研究与分析,所以就以这个问题作为论文的题目。
通过查阅与专业相关的资料及文献,并根据自己所学的专业知识以及与导师进行讨论确定论文题目。通过自己广泛的阅读资料并与指导老师协商后拟定。
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难,还是自己努力写吧
浅谈新形势下信息科学的发展与社会发展 进入21世纪,我们已经进入信息时代,谈起信息科学,对我们来说已经不再陌生了。 自20世纪40年代中期计算机问世以来,在全世界范围内兴起的第一次信息革命对人类社会产生了空前的影响,信息产业应运而生,人类迈向信息社会。以网络化、多媒体化为特征的“信息高速公路”掀起的第二次信息革命,将使人类进入信息时代。它是信息时代的必然产物,是一门新兴的跨多学科的科学,它以信息为主要研究对象。信息科学的研究内容包括:阐明信息的概念和本质(哲学信息论);探讨信息的度量和变换(基本信息论);研究信息的提取方法(识别信息论);澄清信息的传递规律(通信理论);探明信息的处理机制(智能理论);探究信息的再生理论(决策理论);阐明信息的调节原则(控制理论);完善信息的组织理论(系统理论)。扩展人类的信息器官功能,提高人类对信息的接收和处理的能力,实质上就是扩展和增强人们认识世界和改造世界的能力。这既是信息科学的出发点,也是它的最终归宿。 这里我想先从信息说起,某种意义来讲,信息是指对我们有用的消息,它严格要求一定时间性,被称为即时信息,英文全称:Instant messaging,简称IM。 随着信息的发展,信息技术(IT是Internation Technology的缩写)也就应运而生了。信息技术是关于信息的产生、发送、传输、接收、变换、识别、控制等应用技术的总称,是在信息科学的基本原理和方法的指导下扩展人类信息处理功能的技术。 信息技术包括通信技术、计算机技术、多媒体技术、自动控制技术、视频技术、遥感技术等 。其主要支柱是通讯(Communication)技术、计算机(Computer)技术和控制(Control)技术,即“3C”技术。通信技术是现代信息技术的一个重要组成部分。通信技术的数字化、宽带化、高速化和智能化是现代通信技术的发展趋势。计算机技术是信息技术的另一个重要组成部分。计算机从其延生起就不停地为人们处理着大量的信息,而且随着计算机技术的不断发展,它处理信息的能力也在不断地加强。现在计算机已经渗入到人们的社会生活的每一个方面。计算机将朝着并行处理的方向发展。现代信息技术一刻也离不开计算机技术。多媒体技术是80年代才兴起的一门技术,它把文字、数据、图形、语音等信息通过计算机综合处理,使人们得到更完善、更直观的综合信息。在未来多媒体技术将扮演非常重要的角色。信息技术处理的很大一部分是图象和文字,因而视频技术也是信息技术的一个研究热点。 信息科学与技术的发展不仅促进信息产业的发展,而且大大地提高了生产效率。事实已经证明信息科学与技术的广泛应用已经是经济发展的巨大动力,因此,各国的信息技术的竞争也非常激烈,都在争夺信息技术的制高点。 信息科学、生命科学和材料科学一起构成了当代三种前沿科学,信息技术是当代世界范围内新技术革命的核心。信息科学和技术是现代科学技术的先导,是人类进行高效率、高效益、高速度社会活动的理论、方法与技术,是管理现代化的一个重要标志。 随着社会的发展,信息对我门的作用越来越大,我们在推动社会进步的同时对对科学,对信息的依赖就进一步加深,对技术的要求越来越高,技术的进步就越信息化。越信息化就越带动社会进步。两者相辅相成。由此可的信息技术对我们的贡献功不可没。 当前历史条件下,信息科学正在迅速发展和完善,人们对其研究内容的范围尚无统一的认识。现在主要的研究课题集中在以下六个方面: 1、信源理论和信息的获取,研究自然信息源和社会信息源,以及从信息源提取信息的方法和技术; 2、信息的传输、存储、检索、变换和处理; 3、信号的测量、分析、处理和显示; 4、模式信息处理,研究对文字、图像、声音等信息的处理、分类和识别研制机器视觉系统和语音识别装置; 5、知识信息处理,研究知识的表示、获取和利用,建立具有推理和自动解决问题能力的知识信息处理系统即专家系统; 6、决策和控制,在对信息的采集、分析、处理、识别和理解的基础上作出判断、决策或控制,从而建立各种控制系统、管理信息系统和决策支持系统。 信息过程普遍存在于生物、社会、工业、农业、国防、科学实验、日常生活和人类思维等各种领域,因此信息科学将对工程技术、社会经济和人类生活等方面产生巨大的影响。信息技术并科学技术,不仅仅是一种扩展人类信息器官的手段和工具体系,它还具有丰富的伦理和政治意义,信息技术体现着人类改造与控制自然的权利和体系。信息技术对人类社会发展的影响,并不能简单地一概论之。对社会的发展带来了巨大的影响,从两个方面来讲:一、信息技术的正面影响 信息技术扩展了人类器官功能。因此,信息技术的正面意义是毋庸置疑的。信息技术的正面影响深入到社会发展的各个领域、渗透到个人发展的各个角落。主要体现在以下方面。 (一) 信息技术增加了政治的开放性和透明度 其主要表现在以下几个方面: 1、信息化、网络化使得广大人民更加容易利用信息技术,通过互联网获取广泛的信息,并主动参与国家的政治生活。 2、政府纷纷在互联网上抢滩设点,将自己推向网络。各级政府部门不断深入开发电子政务工程。政务信息的公开增加了行政的透明度,加强了政府与民众的互动;各政府部门之间的资源共享增强了各部门的协调能力,从而提高了工作效率;政府通过其电子政务平台开展的各种信息服务,包括面向个人的各种申请服务以及面向企业的征税等服务,为广大人民提供了极大的方便。 (二)信息技术促进了世界经济的发展 其主要表现在以下几下方面: 1、表现在信息技术的产生和发展给传统行业造成的深远影响, 2、由它推出了一个新兴的行业——互联网行业。互联网直接“催生”的“互联网经济”(又称网络经济)与信息技术的关系是不言而喻的。 3、基于互联网的电子商务模式,一改传统的商务模式,使得企业产品的营销与销售以及售后服务等都可以通过网络进行,企业与上游供货商、零部件生产商以及分销商之间也可以通过电子商务实现各种交互。企业和消费者之间、企业和政府之间也可以通过互联网进行更多的互动。电子商务对企业研发、生产、营销、销售、管理、财务的各个方面都产生了巨大影响。 4、传统行业为了适应互联网发展的要求,也纷纷在网上提供各种服务。(三)信息技术的发展造就了多元文化并存的状态 其主要表现在以下几个方面: 1、信息技术使得文化产业迅猛地发展起来。 2、为信息技术重要组成部分的互联网技术的发展,使得网络媒体开始形成并逐渐成为“第四媒体”。 3、互联网更造就了一种新的文化模式——网络文化(cyberculture)。 (四)信息技术改善了人们的生活 其主要表现在以下几个方面: 1、从宏观角度而言,信息技术为整个社会的发展提供了很多有利因素,而作为社会中微小一分子的每一个普通个人也正享受着信息技术带来的各种便利。 2、信息技术使得远程教育也成了可能,从此异地教学逐渐风靡, 3、虚拟现实(virtual reality)技术,使得人们可以透过互联网尽情游览缤纷的世界。 (五)信息技术推动信息管理进入了崭新的阶段 其主要表现在以下几个方面: 1、信息作为一种资源,其各种功能并不能自然地发挥,而需要利用各种技术对其进行必要的搜集、处理、存储和传播。 2、信息技术作为扩展人类信息功能的技术集合,它对信息管理的作用十分重要,是信息管理的技术基础。现代信息技术的发展使得信息管理的手段发生了质的变化。二、信息技术的负面影响 任何事物都有其两面性。信息技术给人类带来各种利益的同时,也引发了一系列问题。主要体现在以下几个方面。 (一)知识产权侵权 1、信息技术给人类信息传播带来了质的飞跃,_尤其是互联网的出现为作品的发表、传播和使用带来了很大的便利,但是,网络的自由和共享也给知识产权,尤其是著作权的保护带来了极大的挑战。 2、通过网络媒体进行的知识产权侵权,尤其是著作权侵权现象非常严重。 3、互联网的发展和成熟还带来了其他的知识产权问题。 总之,信息技术引发的知识产权问题已经到了非常严峻的程度,各国的知识产权法律、法规都受到了前所未有的挑战。 (二)虚假信息泛滥 1、互联网为人们提供了一个空前自由的交流空间,使得人们的话语权和知情权得到了充分的重视。但是,正是由于互联网的自由和开放性,它也成了制造和传播虚假的重要工具。 2、目前,网络信息的社会公信力低下。究其原因,就是网络信息处理的诸多环节失控造成的。这些环节中,最主要的是信息源复杂,难以管理。 3、网络上的虚假新闻泛滥,尤其是娱乐新闻的捕风捉影,几成顽症。很多网络媒体不负责任地对待自己登载的假新闻的行为,从某种意义上讲,也是网络虚假信息泛滥的一个重要成因。 (三)信息污染成灾 1、随着信息技术日新月异的发展以及各种流通渠道的不断拓宽,人类社会知识信息的总量呈“爆炸式”增长,这其中,数以万计的信息中混入了大量干扰性、欺性、误导性甚至是破坏性的虚假伪劣等各种有害及无用信息,人们将其称之为信息“垃圾”,正是各种形形色色的信息“垃圾”造成了人类精神世界的信息污染。 2、互联网是一块自由的沃土,任何人都可以轻易地通过网络发布信息、传递信息,缺少“把关人”对信息内容的必要甄别,一些组织和个人趁机随心所欲,使得网络媒体上的垃圾信息甚至黄色信息日趋泛滥。 3、信息技术使得冗余信息大量产生,给信息的甄选与鉴别带来困难,使得人们虽然身处“信息的海洋”,却很难找到自己需要的有用信息。网络技术的发展为大量垃圾邮件的产生提供了条件。 (四)信息安全问题凸显 今天,计算机系统无时无刻不在经受着诸多安全问题的侵扰。很多计算机软件、系统本身漏洞百出,加上更新换代、层出不穷的网络病毒肆虐,技术精湛、危害严重的黑客横行,信息安全问题日渐凸显。 1、计算机技术、网络技术为代表的信息技术还处于发展的初级阶段,很多观点和想法都不甚成熟。 2、病毒肆虐是信息安全问题的又一巨大威胁。人们对计算机病毒可谓深恶痛绝,而计算机病毒却恰恰是屡见不鲜。 3、信息技术带来的问题还很多,诸如计算机、计算机偷窃、网络诽谤、网络恐怖主义等纷纷上演。 4、信息技术,尤其是互联网的发展引起的文化侵入问题、数字鸿沟问题、信息霸权主义等问题,也不得不引起人们的思考。 但是,尽管信息技术带来了种种负面效应,其正面价值还是不能否定的。信息技术只有被用于正当的场合,才能发挥最大的作用。而如何使信息技术被合法开发和利用,则有赖于各国政府、广大科学家以及世界上所有人民的共同努力。社会的发展,离不开信息科学技术的引导,只要从分发挥信息科学的优势,尽量避免起带来的不必要的冲击,就能较大限度的推动社会进步!!
我们都知道在科研论文中有两大类:一类是研究型论文;另一类是综述型论文。其中,前者主要是以研究为主的行文思路,根据研究发现的不同发表在不同级别的杂志上;而后者多是本身没有新的研究发现,主要是对前人的研究结果进行评价综述。然而,这两种分类都是针对以实验为主论文分类,那么这两年生信为主的文章发文量逐年增加,是否也有这样的分类呢? Immugent今天就来解读特别的一类生信文章,姑且把它称为“生信综述”吧,因为我人微言轻,并不会我把它叫什么,以后都是这种叫法,就不绞尽脑汁想这个名字了。 这类“生信综述”文章已经有很多年的发展史了,主要都是围绕对各种火爆一时(引领科研)的重大技术来展开,比如近些年火热的单细胞测序技术。那么今天我就来以单细胞测序为主题,来解读一下如何利用此类思路发表高分文章,注意全都是一分钱没花的那种! 我先讲的第一篇是2021年发表在J Am Soc Nephrol(IF:)的篇名为“How to Get Started with Single Cell RNA Sequencing Data Analysis”的文章。好吧,看了一下日历,今年已经2022年了,就不吐槽这个文章时效性的问题了。但全文真的很简单,就是介绍了一下单细胞测序数据分析的基本流程。 来看看它的摘要:在过去的5年里,单细胞方法已经能够在一个实验中监测数千个单个细胞的基因和蛋白质表达、遗传和表观遗传变化。随着测量方法的改进以及反应和测序成本的降低,这些数据集的大小正在迅速增加。关键的瓶颈仍然是对单细胞实验产生的丰富信息的分析。在这篇综述中,我们对分析管道进行了一个简化的概述,因为它们通常在该领域中使用。我们的目标是使研究人员开始单细胞分析,以获得挑战和最常用的分析工具的概述。此外,我们希望能够帮助其他人了解单细胞数据集的典型读数在已发表的文献中是如何呈现的。好吧,确实是一篇综述! 全文虽然有7副图,但大多都是那种最基础的绘图,想必大家都会。但是这里Immugent想说的是这篇文章虽然是综述类,但其实比真正的综述好写多了。类比这篇文章,等到下一次再出现类似于单细胞测序这种现象级技术,是不是有的小伙伴也整一篇类似的呢! 接下来要讲的第二篇是2020年发表在Comput Struct Biotechnol J (IF:)的篇名为“Benchmarking algorithms for pathway activity transformation of single-cell RNA-seq data”的文章。这类文章就比上一类有些技术含量了,起码像综述的感觉了! 就像这篇是总结了对单细胞数据进行通路评分的各种算法,并使用已经发表的数据对各类算法的优缺点进行了比较,并在最后给出了自己的见解。嗯,怎么说呢!还是比一般的综述好写一点,比纯算法开发类文章好开发一些。那么如果这类算法在不久的将来出现了更多,那么是不是就科研考虑写一个更新版的呢? 接下来要讲的第三篇是2021年发表在Genome Biol(IF:)的篇名为“Over 1000 tools reveal trends in the singlecell RNA-seq analysis landscape”的文章。这个文章作为汇总类综述,真的不是吹的了,一篇文章总结了1000+种分析单细胞数据的工具,我对这个作者也是膜拜之至。 并且作者还开发了一个网站: ,并这个网站收录的工具还会一直更新,这真是圈内的劳模啊。 这类文章虽然需要耗费一些时间,但思路还是很简洁的,但是主要是得掌握住时效性,而且最好是自己研究的领域,那样能提出自己的一些思考,就能给文章增色不少。 第四篇是2020年,同样发表在Genome Biol(IF:)的篇名为“A benchmark of batch-effect correction methods for single-cell RNA sequencing data”的文章。作者对当时存在的14种对不同来源的单细胞数据进行去批次处理的算法进行比较,深入揭示它们之间的优缺点和功能表现。 全文的图做的都是很精美的,而且从数据处理的效果来看,这应该是一个大型生信实验室的作品。建议大家有时间都读一下这篇文章,将会有助于以后在处理不同来源的单细胞数据时选择最合适的算法。 放在最后一篇的文章当然是压轴出场了,那就是在2019年发表在Nat Biotechnol(IF:)杂志上,篇名为“A comparison of single-cell trajectory inference methods”的文章。对来自数千个单细胞的全基因组组学数据进行轨迹分析,目前已有很多算法来推断这些细胞沿着发展轨迹的分布。基于这些结果,作者开发了一套指导方针,以帮助用户为他们的数据集选择最佳的方法。 事实上,虽然到目前已经开发了70多种推断单细胞轨迹的工具,但比较它们的性能是具有挑战性的,因为它们需要的输入和产生的输出模型差异很大。在这篇文章中,作者在110个真实数据集和229个合成数据集上对其中的45种方法进行了基准测试,以了解细胞排序、拓扑结构、可伸缩性和可用性。结果表明了现有的一些工具之间的互补性,方法的选择应该主要取决于数据集的维度和轨迹拓扑。 最后,作者还免费提供了多种单细胞数据轨迹分析的评估网站( ),这将有助于开发更多轨迹分析的工具,用于探索日益庞大和复杂的单细胞数据集。对于这篇文章,我不做过多评述,只想着大家有时间都要去读一下,其中无论是对数据的处理还是对结果的讨论上都是前面文章无法媲美的,是难得的优质文章。 如今科技发展日新月异,在21世纪做出有价值的科研成果往往缺的不是技术,而是对热点的灵敏嗅觉以及对时局的掌控。张泽民,汤富酬,郭国骥老师均是凭借单细胞测序技术跻身世界一流领域的科学家,就是因为他们把控住了时局。 同样的,上述几类“生信综述”的着力点均是当时迫切需要解决的单细胞测序技术热点问题,才得以不花费半毛钱发表一系列高分文章。而且,因为是热点科学问题,这些文章截止到目前的引用率都很高,后面肯定还会持续升高。如果说单细胞测序是一个制高点,倒不如说是起点,因为此类技术在未来还会有很多,希望本篇推文能给大家带来一些思考,欢迎有推荐类似生信文章的小伙伴通过后台与我们联系。
生信文章。生信层面分析了TCGA-SKCM数据集中每个患者的生存比例、标准化基因表达数据和临床信息,分析原发组和转移组之间的多基因依赖分数和基因集评分。单基因单肿瘤类属于生信文章。