新技术让古生物DNA重获生命有一天你可能不是在科幻影片《侏罗纪公园》里,而是在现实中,看见活生生的恐龙、猛犸象……今年,科学家利用新技术从化石中成功提取出古生物的DNA,这使追溯生物演化的全过程、克隆古生物等成为可能? 这一发现被《科学》杂志列为“2006年度世界10大科技进展”之一。 ———技术突破———化石DNA研究极其烦琐 保存在化石和考古材料中的古DNA,由于受水解和氧化等降解因子的影响,总是以高度片段化、小分子量的形式存在于古代样品中。 “化石DNA的保存好坏与其所在环境的温度、pH值、湿度、液体的离子浓度及埋藏时间等因素有关,一般来说干燥、低温的环境下可以保存较好的化石DNA。”中国地质大学(武汉)地球科学学院教授赖旭龙说。 对于化石和考古材料中的古DNA研究,同现代动植物的DNA研究一样,一般需经过取样、提取、扩增和测序等步骤,尽管古DNA研究的实验仪器及实验程序和现代DNA基本一致,但是由于古代生物中保存的DNA经受了不同程度的损伤降解、污染等,这就要求有非常严谨的实验条件和经过多方面的验证才可以得出可靠的实验结果。 “古DNA的研究相对现在动植物的DNA研究来说要烦琐很多。”赖旭龙说。 化石DNA研究取决于技术 “化石DNA研究除要选用合适的研究材料外,还与实验技术有很大的关系。”赖旭龙说。 他介绍,化石DNA的研究过程自20世纪90年代以来就没有大的变化:即在提取实验后,进行多次常规PCR反应及分子克隆,经测序后获得一系列古DNA片段,然后拼合成一条完整的序列。 “每次PCR反应就要消耗掉提取出来的数量很少的古DNA模板,当需要作更多的PCR反应时,只好再进行古DNA的提取以获得更多的模板。这种方法既消耗许多样品和试剂,同时也很耗时。”赖旭龙说。 新技术被业界肯定 2006年“从化石中提取DNA”被评为2006年度世界10大科技进展,主要成就在于欧美国家几个实验室利用一些新技术分别从尼安德特人和猛犸象获得了古基因组。其中美国和德国的几个实验室利用宏基因组学和高通量直接测的方法从未经过扩增的古DNA提取物中获得了65万个碱基对和100万个碱基对长度的尼安德特人的古DNA序列。 “这一方法不仅可以避免在PCR扩增中容易造成的核苷错配,还为已灭绝生物的基因组研究提供新的方法。另外,由加拿大、美国及德国科学家组成的一个研究小组,利用美国生命科学公司发明的一种快速简单的测序方法从猛犸象化石中获得了1300万碱基对的古DNA序列。”赖旭龙说。 “所以,尼安德特人DNA能够再次被评为2006年度世界10大科技进展,更多的是对古DNA实验技术创新的肯定。” ———重大意义———研究生物演化须了解古生命 地球上的生命已经有30多亿年的历史,目前我们所能直接观察到的现代生物世界,相对漫长的生命演化史来说只是一个短暂的瞬间。要了解生物演化的全过程,必须了解古代生命的发展。 “对于古代生物的了解,我们主要基于对保存在地层中化石的研究。在人们不能从化石中提取DNA时,这种研究主要是基于化石形态学的研究。”赖旭龙介绍。 古DNA能描绘生物谱系 古DNA作为在化石和考古材料中所能获取的唯一的古代生物遗传信息,目前已成为探索历史时期生物系统分类、演化和谱系发生的重要手段。 赖旭龙介绍,已有研究证明从化石和考古材料中获得的DNA已经在古代和现代生物的谱系关系研究,濒危物种的保护,现代人的起源、迁移和演化,动植物的家养和驯化过程及早期农业的发展,遗传多样性的变化和古病理学研究等方面发挥独特的作用,并且已对生物学、古生物学、地质学、考古学和人类学等学科产生重要影响。 ———前景预测——— “新的古DNA技术的出现,无疑将为该研究领域带来革命性变化,使我们从化石和古代生物中更容易获得更多的古代生物的遗传学信息。预计将来可能的发展将主要体现在以下几个方面。”赖旭龙给记者做了预测。 预测一:用于古生物群体研究 2006年的尼安德特人和猛犸象的研究成果,主要是对单一化石标本的DNA研究,这些成果尽管也探讨了演化谱系的问题,但更偏向于古DNA技术的探索。一旦该技术被证实是可靠的,将来会大量的用在同一物种在不同时间序列上不同个体的研究,从而可以从历史群体遗传学角度探讨居群内基因多样性随时间变化的情况。这类研究对于濒危物种的保护尤其重要。 预测二:从多种途径获取古DNA 将来获取古DNA的材料将不会只是化石和古代生物的残骸,有了新的技术,人们还可以从冻土、湖泊和海洋及洞穴等沉积物、冰芯等载体中获取古DNA,从而扩大古DNA研究对象。 预测三:古DNA保存年限延长 20世纪90年代晚期以来,国际古DNA学界普遍认为古DNA的保存理论年限只有10万年,2003年丹麦学者Willerslev通过对西伯利亚冻土中古DNA的研究,认为在有利古DNA保存的冻土地带古DNA可以保存数十万年。随着新的技术的出现,人们很可能从更古老的材料中获得化石DNA。 预测四:与生物小分子研究相结合 随着从不同地质载体中获取古DNA的增多,有可能可以对同一载体中保存的其他生物小分子进行综合研究。以类脂为例,作为生物小分子的类脂化合物比DNA更容易保存在地质体中,且保存的年限也比DNA长,已有研究证明类脂化合物是很好的环境和气候变化的指标,如两者结合研究就可以较好地反映古代生物随环境和气候的变化所发生的演化趋势。 ———专家观点——— 赖旭龙:中国地质大学(武汉)地球科学学院教授 我国最先从古生物中提取DNA 从某种意义上来说,我国应该是世界上第一个试图从古代生物中获取DNA的国家,1980年当时的湖南医学院的专家从约2000年前的长沙马王堆汉代女尸中取出古核酸,该成果被德国哥廷根大学于1994年主编的第一本有关古代DNA的专著———《古代DNA》所提及,遗憾的是湖南医学院的专家们当时没有对马王堆汉代女尸古DNA进行序列测定。目前国际古DNA学界多认为美国加利福尼亚大学伯克利分校Higuchi等于1984年成功地从博物馆保存的已绝灭100多年前四足动物斑驴的皮肤上提取并克隆的线粒体DNA为世界上第一例古DNA研究。 与国外相比尚有差距 20世纪90年代早期国际上掀起古DNA研究热潮,我国同行开始重新介入该研究领域。1995年中科院南京地质古生物研究所筹建了我国第一家专门的古DNA实验室。迄今为止,以我国学者为主除报道了华北地区猛犸象的古DNA、青藏高原多年冻土中的古代眼子菜以及河南省古代绵羊残骸中的古DNA序列外,其他研究主要集中在我国不同年代和不同地区的古人类研究方面。这些研究成果大部分均有待于得到可重复性实验的证实,在国际上的影响不是很大。坦率地说,目前我国古DNA研究与国际先进水平尚有较大差距。 不过,目前古DNA的研究标准已经确立,加上2006年度用于古DNA研究的一些新技术的诞生,只要立足于我国特有的化石和考古材料,相信在不久的将来我国科学家有望在古DNA研究领域取得举世瞩目的研究成果。 ■新闻缘起 二○○六年年末,美国《科学》杂志公布当年度的十大科学进展。这是对全球科学研究的年终盘点,“共享科学”栏目将从十大科学进展中选取“化石中提取DNA”、“冰原正在不断消失”等作深入报道,让读者与我们一起共同关注科学发展前沿。 ■相关链接 美科学家欲从霸王龙化石里提取DNA 电影《侏罗纪公园》讲述了科学家用DNA复制恐龙的故事,这个令人惊叹的想法也许在未来会成为现实。日前,美国科学家从一具7000万年前的霸王龙化石中发现了软组织,并看见血管和细胞结构。 这具霸王龙化石于2003年在美国蒙大纳州被发现,且保存较好。科学家在对化石的一节腿骨进行研究后,发现在骨腔里存在罕见的化石矿物质沉积体。在经过脱矿物质处理后,剩下的是柔软、透明且富有弹性的赭色软组织,在显微镜下甚至可以看到血管和细胞结构。玛丽·施韦策博士领导的美国北卡罗来纳州大学研究小组称:“这真是一件令人震惊的事,直到我们又重复了17次实验,才相信这是真的。”
期刊名 VACCINE出版周期 Weekly出版ISSN 0264-410X通讯方式 ELSEVIER SCI LTD, THE BOULEVARD, LANGFORD LANE, KIDLINGTON, OXFORD, ENGLAND, OXON, OX5 1GB期刊主页网址 在线投稿网址 其他相关链接 Science Citation IndexScience Citation Index ExpandedCurrent Contents - Life SciencesBIOSIS Previews偏重的研究方向 免疫学(1) 疫苗学(1) 审稿速度 平均 个月的审稿周期
癌症研究中心中心简介 癌症仍是我们面临的巨大挑战,癌症就全球人口与先进各国来说,均居国民死亡原因之第二位。据日内瓦(GENEVA)世界癌症报告(当今全球综合性最强的调查),全球每年大约有1,090万人被诊断出患有癌症,有670万患者死亡。在中国,据国家卫生部信息中心的报道,20世纪90年代中国肿瘤发病率已上升为127例/10万人,近年来每年新增肿瘤患者达160~170万人,总数估计在450万人左右,主要癌症类型依次为胃癌()、肝癌()、肺癌()、食管癌()、结直肠癌(含肛门肿瘤,)、白血病()、子宫颈癌()、鼻咽癌()和乳腺癌()。由于发展中国家和发达国家的人口日益老龄化,当今吸烟的流行和不健康生活方式日益增多造成癌症的发病率还在上升,预计到2020年全球癌症发病率将上升50%,发病人数将达到1500万。癌症极大威胁人类健康,人们一直在寻找有效的治疗方法去征服癌症,抗癌研究是当今生命科学中极富挑战性且意义重大的领域。肿瘤的发生是个极为复杂的过程,过去有人把它分为启动和促进两个阶段,致癌物和促癌物分别作用于这两个阶段,于是形成肿瘤。从基因学分析,致癌的过程中,有许多基因发生了突变,不能履行职责,导致癌症。随着后基因组时代的到来,人们对基因及其功能的认识逐渐深入,肿瘤细胞与正常细胞间在细胞内的信号转导途径的差异正在被认识,恶性肿瘤细胞内的信号转导、细胞周期的调控、细胞凋亡的诱导、血管生成以及细胞与胞外基质的相互作用等各种基本过程正在被逐步阐明,癌症在分子水平上的发病机制研究得越来越清楚。随着肿瘤细胞增殖、凋亡等信号传导通路的阐明,过去那种以统一制式的疗法进行的癌症治疗,由于产生了许多副作用,这些副作用包含身体的不适,有些甚至威胁到生命安全,正在被近来悄然上市的靶向药物产品所替代,靶向治疗方式是以杀死癌细胞为主要目标。靶标抗癌药物直接针对的是分子靶点,就象击靶,将能有效克服目前临床上常用的细胞毒类抗肿瘤药物具有难以避免的选择性差、毒副作用强、易产生耐药等缺点。当前,计算机虚拟筛选、组合化学、高通量筛选加速了靶向治疗新药研究的进程。针对分子靶点研究的抗癌药物目前主要包括肿瘤细胞表面的靶标(抗原或受体)的单克隆抗体(单抗),细胞信号转导分子抑制剂、血管新生抑制剂,靶向端粒酶的抑制剂以及针对肿瘤耐药的逆转剂等。发现选择性作用于特定靶点的高效、低毒、特异性强的新型抗癌药物已成为当今抗肿瘤药物研究开发的重要方向。靶标药物的出现,充分证明了以分子为靶点治疗肿瘤的巨大潜力,标志着癌症治疗的新时代已经到来。这类药物改变了传统化疗药物对所有快速分裂的细胞全面打击的方式,针对肿瘤细胞的基因突变或基因表达异常进行治疗,对正常细胞的影响很小。但由于化学治疗的局限是往往导致抗性细胞的出现,具有固有抗性的癌细胞的产生是由这些细胞的遗传不稳定性所致。这一问题将出现在所有针对癌细胞的治疗中,因而扩大可锁定的细胞通路的数目有可能降低抗药性和不良反应,并增加可供选择的多药物治疗方案的数目。以这种方式治疗癌症的方法使市场产生了若干变化,这种创新疗法在未来十年将扭转癌症医疗市场。依Business Communication公司最近研究指出,2001年全球癌症医药市场规模为亿美元,2005年将达到267亿美元之规模,年平均成长率达。2000年到2005年期间预估治疗癌症之新药,已达134种(包括其创新性药品、新剂型或旧药新使用法等发明),这些新药使全球癌症医药销货收入大幅增加75%。2000年治疗癌症药品的的总市场值为132亿美元,其中既有的药品占有90%的比重,此部份之市场将于2005年达182亿美元规模,年平均成长率为。癌症的治疗于1990年末期,因为创新疗法的发明,有了很大的变化。这种创新疗法包括单克隆抗体疗法,再过几年,这些创新的疗法将会与较早的医疗方法例如:细胞毒性疗法(Cytotoxic agents)与荷尔蒙疗法等结合使用。创新药品诸如:血管生成抑制剂(Angiogenesis inhibitors)、癌症疫苗(Cancer vaccines)、基因治疗药品(Gene therapy)以及新单克隆抗体。加上既有药物的改良品等,均将促使癌症医疗市场戏剧性的爆增,目前其市场价值估计为亿美元,年平均成长率为,估计到2005年其市场价值将达86亿美元。换言之,2005年全球整体癌症医疗市场(即既有药品市场及创新性治疗药品市场)规模将为2000年市场的两倍。在中国,短短的五年间,国内肿瘤医院用药的市场已经从1999年的32亿元,猛增到2005年的78亿元,年均增幅,在2005年抗肿瘤药尤其显示出强劲的增势,销售金额比2004年同比增长21%,显示出强大的市场动力。癌症研究中心的建设将以研究肿瘤细胞信号转导为基础,通过对肿瘤细胞信号转导通路的阐述,发现更多特异性强的分子靶点和途径,为发展新的肿瘤治疗、预防和诊断提供技术支持。科研队伍中心主任:张晓坤教授(博导)中心执行主任:曾锦章教授讲师:王光辉助理教授实验室人员1名学生:博士生2名、硕士生6名。细胞与传染病中心中心简介非典、禽流感等新疫病的暴发流行告示人们:除了战争之外,各种传染病仍是人类生存和发展的大敌,人类同传染病的斗争还远未结束,因此大力加强对传染病的研究与防范,应该成为人类一项十分紧迫而重要的任务。我国是全世界艾滋病病毒(HIV)感染人数上升速度最快的国家之一,不仅上升快,而且传播范围广、途径多、青壮年多、农民多,从高危人群向一般人群扩散,开始进入发病和死亡的高峰期。据专家估计,全国艾滋病实际感染者已超过100万。如不采取坚决有力的措施,将造成难以想象的严重后果。而乙型肝炎,更一直是我国的一大健康问题,全国人口乙肝病毒抗体阳性率高达60%,乙肝病毒携带率约10%,携带人数亿,占世界的1/3;每年新发乙肝病例约80万人,现有乙肝病人1300万人,每年有30万人死于肝癌、肝硬化。对于乙型病毒肝炎的治疗,虽然有各种治疗方法,但目前在市场上仅有为数不多的几种药物都有种种缺陷。所以,增加药物品种以增加治疗方案的选择,特别是研发对耐药性病毒有效的新药已成了攻克乙肝难题当务之急的任务。攻克这些传染性疾病的意义非凡.所有病毒侵入细胞,进行基因组复制以及病毒粒子的组装和释放的过程,都和细胞内各种生理活动机制紧密相关。深入研究细胞内各种生理活动机制,特别是蛋白质跨膜运输(membrane trafficking)的调节机制,对于了解病毒以及其它病原生物引起的传染性疾病发生的细胞分子机理具有重要意义。本中心将在细胞生物学研究的基础上,逐步开展对病原生物如病毒,细菌等引起的传染性疾病的病理研究,并寻求新的治疗方法。研究方向:病原生物入侵与蛋白质跨膜运输相互作用的细胞及分子机理蛋白质运输的分泌路径(secretory pathway)和内吞路径(endocytic pathway) 掌控许多细胞生理过程,如神经传导素和生长因子的分泌,同时调控信号传导,肿瘤发生以及个体发育等。正常的生理功能有赖于特定的蛋白被运输到正确的位置。许多疾病的发生都与蛋白质运输缺陷有关,例如,许多溶酶体贮积病(lysosomal storage disease), 家族性的高胆固醇病(Familial hypercholesterolemia ), Hermansky - Pudlak 综合征, Chediak - Higashi 综合征, Alzheimer和 Parkinson综合症等。另外,许多病原生物,如绝大数病毒,它们入侵细胞,在细胞内成熟以及致病过程,都要借助蛋白质运输路径中各种组成元件。蛋白质运输机制与人类疾病发生的关系是当前细胞生物学研究的热点之一,由洪万进教授领导的研究团队在该领域的研究水平一直居于国际前沿,在包括Nature,Science等顶级刊物上发表相关高质量论文160多篇。中心将继续致力于应用现代分子与细胞生物学技术,探索蛋白质运输机制与人类疾病发生的关系,揭示蛋白质运输调控人类疾病发生的细胞分子机制,从蛋白质运输过程的调控元件中,探索新型的药物靶向分子,开发新型的靶向药物。目前正在开展的研究包括: 蛋白质跨膜运输机制;蛋白质运输与癌症;蛋白质运输与病原生物致病机理;新型靶向药物的筛选等。研究将着重探讨低分子量GTP酶Rab蛋白调控蛋白质跨膜运输的机制,尤其是Rab 蛋白对细胞内吞作用的调节如何影响病原生物的入侵。Rab蛋白可以结合GTP或GDP,实现活化与钝化的转换。GTP结合的Rab蛋白为活化型,它可通过跟下游因子相互作用,调控蛋白质跨膜运输以及多种细胞活动。Rab34是我们鉴定的一个新Rab蛋白,我们的研究显示Rab34和 Rab7拥有共同的相互作用因子RILP,有证据显示:Rab34、Rab7和RILP参与病原生物(如沙门氏菌)介导的吞噬泡的形成。我们将进一步研究Rab7、Rab34和RILP调控传染性病原生物,特别是细菌和病毒入侵的细胞与分子机制。并将研究领域扩展至其它Rab蛋白以及其它内吞途径中的蛋白。另外,中心研究Rab7和Rab34对细胞生长、迁移、存活、信号传导以及肿瘤发育等的影响,并借助动物模型深入探讨Rab蛋白对细胞及动物生理的调控作用。科研队伍中心主任:洪万进教授(博导)中心执行主任:王团老教授实验室技术人员:云叶 伍小春博士生:张明硕士生:陈理 许晓鸥王世聪马泽旭本科生:梁银文 胡菁捷汤少勇刘琛科学研究研究方向1.动物细胞蛋白质跨膜运输机制2.蛋白质运输与癌症发生的调控机制3.蛋白质运输与病原生物入侵及致病机理4.新型靶标及靶向药物的筛选代谢性病中心中心简介近几十年来糖尿病和肥胖等代谢性疾病已成为世界关注的健康问题。糖尿病已成为不发达国家中发病率增加速度最快的慢性病,全球至少5%的死者死因与糖尿病有关,各国用于糖尿病的治疗费用占了全年医疗预算的至15%。目前中国的糖尿病至少有2380万。一些发达国家中,肥胖的患病率较高,而在发展中国家,肥胖人数也急剧上升。肥胖导致死亡率的上升,同时也增加高血压、冠心病等慢性病的风险。最近的一项调查还表明,中国的肥胖症患者也在不断增加,近8年来学龄前儿童的肥胖症发病率猛增,患病者已占儿童总数的10%,随着年龄增长,肥胖儿童还有患糖尿病的危险。因此本研究中心针对这个趋势,着重探讨糖尿病与肥胖症的分子机理及新型药物的开发。研究中心具有多年的糖尿病与肥胖症分子机理的研究,发现了SHP2、GRB2、GAB1和GAB2等多个关键调控基因,在细胞层面和转基因动物模型上证明了它们对糖尿病与肥胖症的关键调控作用。我们中心的进一步研究方向是:1)与临床相结合,明确这些基因糖尿病与肥胖症的作用;2)将上述基因作为治疗的靶基因,筛选可能的临床治疗药物。我们中心已建立良好的研究技术平台,具有成熟的分子生物学、细胞生物学及转基因动物疾病模型的实验技术体系,能为研究疾病的分子机理,验证新药的作用疗效,揭示成药的作用机制和途径等提供技术合作。科研队伍中心主任:冯根生教授(博导)中心执行主任:吕忠显教授。实验室技术人员一名学生:硕士生2名神经及衰老中心中心简介随着人口老年化及世界人口平均寿命的逐年增加,威胁老年人生活三大疾病之一的老年性痴呆症发病率也迅速上升。老年性痴呆及神经退行性疾病包括阿尔茨海默氏病(俗称老年痴呆症, Alzheimer’s Disease or AD) ,中风及心脑血管性痴呆,帕金森氏症,精神分裂症,忧抑症等, 其中AD占50%-70%。据报道,AD的发病率在65-80岁人群约为10%,80岁以上者可达50%。约有600万的美国人患有老年痴呆症。美国社会每年运用于老年痴呆症(AD)的费用高达1000亿美元。我国已经进入老龄社会,60岁以上的人口已超过亿,60岁以上高龄的老人中有5%--10%的人患有老年痴呆症,也就是说我国老年痴呆症患者已可能有1000万人。AD即将成为医学和社会面临的严峻问题。对AD病因的深入研究以开发出有效的防治药物,不但有重要的社会意义同时也具有广大的市场潜力和经济效益。中心研究方向:老年痴呆症的细胞与分子病理机制遗传学、细胞/分子化学和生物化学的证据强有力地证明,β-淀粉样蛋白在老年痴呆症的发病过程中起重要的作用。因此,抑制β-淀粉样蛋白的形成与累积是进行老年痴呆症治疗研究的重要目标。本实验室的主要兴趣是致力于探讨β-淀粉样蛋白的细胞与分子机制。目前实验室已经取得的进展和正在进行的课题介绍如下:1.主要致力于探讨两种负责Aβ产生的分泌酶, 即β-分泌酶和γ-分泌酶的作用原理和调节机制。γ-分泌酶是一种多分子复合物,由早老素-1(PS1), PEN-2, APH-1和 nicastrin组成。我们首次证明人PEN-2基因的表达受转录因子CREB的调控。我们的发现有利于更好地理解转录因子是如何调节细胞内β-及γ-分泌酶活性的,也有利于开发潜在的治疗AD的药物靶。2. Aβ是由β-类淀粉蛋白前体蛋白水解生成。同时,该水解过程中也产生一种胞内肽,即APP胞内结构域 (AICD)。已有证据表明,AICD和NICD一样作为转录因子调节几种基因的表达。我们发现并鉴定了AICD与几种蛋白的相互作用。现在,我们正在进行阐明这些蛋白在信号转导途径中对APP加工及细胞雕亡的影响。3. β-分泌酶和 γ-分泌酶的剪切具有选择性,因此必然有其他的蛋白与它们相互作用,调节它们的功能。我们正在筛选与PS1, nicastrin, PEN-2 和 BACE1相互作用的蛋白。4. 中国鲎肽已经被鉴定为一种具有多种生物活性功能的多肽,具有抗菌,抗病毒,抗肿瘤的作用。我们正在开展中国鲎肽对神经细胞的存活/死亡及对APP/Aβ加工的影响等方面的研究。注: 最近以本实验室博士生王瑞山为第一作者的有关PEN-2和APH-1基因表达的调控的两篇论文分别发表于Mol Cell Biol(影响因子)和FASEB J(影响因子)杂志。以04级硕士生张含为第一作者的有关Presenlin蛋白调控肿瘤抑制因子PTEN水平的论文已被Neurobiology of Aging(影响因子)杂志接收发表。以06级博士生张弦为第一作者的有关脑缺血及缺血诱导因子HIF-1能结合BACE1启动子并调控β-分泌酶活性进而影响Aβ的产生的论文发表在J Biol Chem (影响因子)杂志。最新的研究工作发现与AD密切相关的PS/ -分泌酶切割APP所产生的细胞内片段AICD能与EGFR基因的启动子结合并且负调控EGFR的表达,由于EGFR的过度表达会引起癌症或造成肿瘤对药物的抗性,这一结果揭示了AD与癌症发生之间的内在联系。这一论文发表在Proc Natl Acad Sci USA (影响因子),在国内外引起很大的反响,先后被各大新闻媒体(如Newswise、ScienceDaily、Scienceblog、United Press International、新华网、人民网、科学网等网站,光明日报、厦门日报等报刊,以及中央人民广播电台、厦门电视台等)采访报道。实验室主要经费来源:厦门大学211人才引进启动经费:300万元厦门大学生物医学研究院启动经费厦门市鲎特别保护区可行性研究。 2004年 12月- 2005年 12月。 经费: 18万 经费来源:厦门市海洋渔业局鲎人工育苗,放流技术及保护措施。经费: 18万 经费来源:厦门市海洋渔业局早老素(PS1)在囊泡合成及运转中的调节功能研究。 经费:25万 经费来源:国家自然科学基金课题β-分泌酶和g-分泌酶各组分的选择性转录调控。经费:31万 经费来源:国家自然科学基金课题科研队伍中心主任:许华曦教授(博导)中心执行主任:张云武教授 、洪水根教授。学生:神经退行性疾病及衰老研究中心所有学生。转化医学中心中心简介二十一世纪是生命科学的世纪。随着人类基因组计划的完成,生命科学的研究热点已经从生物学基础研究转移到以人类健康研究为重心的生物医学。 生物医学是基础理论研究与临床应用相互依存的学科。生物医学研究人类疾病的遗传基础、致病的分子机理、疾病的防治,实现药物对病人个体化治疗,从而保证人民健康、促进社会发展。长期以来, 由于传统观念和学科体系的限制, 生物学研究与医学研究泾渭分明, 实验室研究人员与临床医务人员之间各自为政,交流不畅, 以致基础理论研究与临床应用严重脱钩, 科研方向和研究项目与临床需要、社会需求严重分离。这种状况不仅造成社会资源的极大浪费,而且也远远不能适应基础理论研究与临床应用相互依存的生物医学的发展。转化医学是现代生物医学研究的重要组成部分。 转化医学致力于实验室研究成果的医学应用,使实验室的发现、发明迅速转化为临床上急需的诊疗技术和产品,架起实验室通往临床的桥梁,填补基础理论研究和实践应用之间的鸿沟。 本中心将以服务人类健康为宗旨, 利用我们在药物研究与开发的经验和分子诊断研究的雄厚基础,综合生物信息学、分子遗传学、现代医药化学等研究领域的最新进展, 瞄准临床、社会需求,努力实现下列目标:1) 建立生化测试、细胞测试和动物模型为轴心的药物筛选评估平台, 以及临床前药效、药理、代谢、分布、毒性和病理评估平台。以分子机理为基础, 研发新一代靶位治疗药物, 以满足临床和市场的需要。2)研发敏感度高、重复性强、时间性短、使用简单、成本低的新一代分子诊断技术。结合疾病的标志分子,实现对常见遗传病、急性传染性疾病、恶性肿瘤等疾病的早期诊断、及时预防、早期介入、准确用药, 以及对治疗效果的鉴定和预后, 从而实现药物对病人的个体化治疗。3)利用这一研发平台, 培养出一批既能从事科学研究, 又通晓临床应用, 并谙熟市场、企业运作的,社会急需的创新、创业、企业管理和制药法规的复合性人才,促进地方经济的持续发展。科研队伍中心主任:郑立谋教授(博导)兼职教授:蔡宗武教授(生物统计)实验室技术人员1名学生:硕士生4名。天然产物中心中心简介生物医药产业的发展取决于具有自主知识产权的创新药物的研发。全球医药产业的发展实践证明,天然药物历来是创新药物研究的重要源泉。在中国,从拥有千百年临床实践经验的传统中医药中寻找活性先导化合物,更是结合国情、开展自主创新药物研究的一条捷径。运用现代科学技术方法和制药手段,充分开发我国得天独厚的丰富中药及天然药物资源,利用新近发展起来的天然产物快速、高效制备技术组建中药及天然药物分离馏分资源库,结合高通量活性筛选体系,寻找具有开发前景和潜在市场价值的活性天然物质,再进行深入、广泛、系统的研究,可能会成为加快中药现代化进程、推进自主创新药物研究的最有效的途径。传统中医药在千百年临床实践中积累的丰富经验,将为针对性地选择活性筛选体系,减小筛选的盲目性和工作量,提高药物筛选的效率和成功率提供重要的启示。而建设一个中草药快速、高效、有序分离的平台,是解决这一关键问题的基本要求。本中心将结合现代生物技术、医学理论和药物研发技术,寻找有效的天然药物成分,阐明其构效关系,并对其化学结构进行修饰与优化。重点利用我国丰富的中草药资源,以及厦门得天独厚的海洋天然药物资源,研究对重大疾病具有活性的天然产物,构建天然药物有效组分资源库,结合其他中心基础研究的成果,发掘有针对性疗效的有效成分,通过药化研究和临床试验,形成具有自主知识产权的药物产品。负责人:张晓坤教授、博导(代)该中心已经与暨南大学中药及天然药物研究所签订合作协议,两院将联合共建,共同致力于中草药资源研究与发展。暨南大学中药及天然药物研究所拥有一支以姚新生院士为首、包括叶文才教授、栗原博教授、李药兰教授等长期从事中药化学及药理学研究的专家学者的卓越团队,不仅具有多年药理研究的经验,并且在建立中药及天然药物分离馏分样品库方面作了大量卓有成效的工作,孜孜探索于中药标准化、规范化研究。中心与暨南大学中药及天然药物研究所合作,将在药化研究上形成强势互补,共同推动中药现代化与自主知识产权新药的研发。科研队伍中心主任:张晓坤教授、博导(代)副主任:姚新生院士(兼职)教师:叶文才教授(兼职)陈海峰副教授实验室技术人员2名硕士生2名
先看过还不错的片头动画后进入开始菜单主要有 operation genesis:公园模式(以建成一个5星级的公园为目标自由建设) exercises:教学模式(刚来进来上上手不错) missions:任务模式(无聊到家的任务,全篇由操作直升机和观览车组成) site B:自然模式(很酷的模式,在该模式下可自由创建恐龙岛而不计资金等所有人为因素,可惜需要任务模式全部完成才开放) 进入公园模式后就是地型设定,里面包阔 shape:陆地大小 trees:树木数量 rivers:内河数量 mountains:山丘数量 next island:新地图生成 然后start就进入你的侏罗纪公园咯~ 进入游戏后下面有一些图标面板 build:建筑面板(各种建筑,下面还有分支面板) paths:道路面板 path:道路(基本的路,没路游客们会迷路的) fountain:喷泉(唯一的美化建筑.....) trash can:垃圾桶(很重要的,最好隔一段就弄一个,不然道路很易脏) bench:长凳(会被休息区取代,无大作用) cleaner station:清洁工部门(不雇清洁工的话道路很快就变脏,游客也会不高兴) attractions:观察设施面板(各种用来看恐龙的看台,大多可以为其换名来增加吸引力) viewing vent:看台(基本看台,注意把入口转到笼子外面) viewing dome:地下看台(很不错的看台,近距离观赏很刺激的) viewing platform:了望台(视野广是大优点,需配合高倍望远镜) balloon tour:热气球(需设定行进路线,接客量低是缺点) safari adventure:游览车(需设定行进路线,开车进入展区内,若是看不到恐龙自然没人坐,看得到的话又怕多到挡路,若还有大型肉食恐龙出没的话......) environment:环境面板 paleo trees:远古植物(即蕨类植物,白垩纪以前地球上大量覆盖,任何模式下岛上初始植物都是这个) modern trees:现代植物(即被子植物,会开花的值物,恐龙无法食用,需人工种植) flatten:整平地面 lake:淡水(恐龙生存离不开水,不要忘记在展区内给恐龙留个有水的地) mountain:山丘(纯属浪费土地,任何物体都不上去...) amenities:公园设施面板 park entrance:公园入口(最好建在靠海岸处,具体后面会说) souvenir stand:记念品店(能设置商品和赠物,不要把价格定在本钱以下哦) kiosk:食品店(同上) rest area:休息区(能一次容纳8人,建1,2个就无需建长凳了) rest room:公厕(不知为啥,游客们总是很急.....多建几个吧) demolish:拆除 dinosaurs:恐龙设施面板 hatchery:孵化所(所有恐龙在里面喂养成成龙后才放出) herbivore feeder:草食投喂器(给草食恐龙投食用的,但不是必须,因为它们也会吃野外植物) bale:普通包 paleo bale:特大包 auto:自动投喂 off:关闭 dispense now:马上投喂 carnivore feeder:肉食投喂器(给肉食恐龙投食用的,一般喂羊即可) goat:羊 cow:牛 auto lure:吸引诱饵(可以放出吸引恐龙的香味,展区很大的话在看台前建一个是不错的办法) low security fence:矮电网墙(公园内不论大小总共只许建600道电网墙,怎么规划就看你的了.暴雨后要常常检修一下坏掉的地方,特别是肉食龙展区) medium security fence:中电网墙(同上) high security fence:高电网墙(同上) security:安全设施面板 panger station:直升机平台(执行种种任务的工具,有电力限定,电耗光会自动返回,按鼠标左键和右键选择不同的模式.另外恐龙们对它的噪音都会觉得不安) fly:起飞(在平台上方有提示时按f可降落,或者按esc2次也可让它自动返回) 左键5:麻醉弹(中弹后会昏睡一阵) 6:疫苗 7:射杀 8:强心针(可恢复恐龙的hp,或治疗除疫苗外的伤病) 右键1:救援(救出遇到麻烦的游客) 2:声波(驱赶恐龙) 3:草食诱饵 4:肉食诱饵 security camera:监视器(无用物之一) avoidance beacon:声波塔(无用物之二,能驱赶周围的恐龙,包阔笼子里的...) sentry turret:机枪平台(无用物之三) visitor shelter:避难所(难得有用的安全设施,警报发布后若你有足够的避难所,游客们就不是逃离公园而是进入避难所) reports:总结面板 perfor mance report:公园等级(无用,重要的是星级) visitor summary:游客总结(还是无用,游客们太好打发了) security summary:安全总结(基本不看) dinosaur summary:恐龙总结(重要!了解目前掌握的dna和恐龙和数量) finance summary:财政总结(好简单的报表) structure summary:设施总结(查看建筑的赢利情况) entertainment summary:观察设施总结(查看看台建筑的赢利情况) dinosaurs:恐龙面板 fossil hunt:化石挖掘面板(快捷键F3,随着星级提高能开放更多挖掘点,每个点都有三种恐龙化石,最多开放5处,选择时需要考虑一下) buy team:雇用挖掘者(挖掘者越多越贵挖得越快,公园大门开放后才能雇人,最多5队) fossil market:化石购买面板(快捷键F5,老挖不到的话花钱来买也不错) genetics lab:DNA提取面板(快捷键F4,化石DNA完成度越高恐龙寿命越长,50%以上才能制造恐龙,若某DNA已达100%的话挖到的同类化石会自动出售,还可以卖掉挖到的财宝) info:查看 extract:提取 sell:卖 dinopedia:恐龙百科(E文的,你看得懂吗?) dinosaur summary:恐龙总结(和前面的一样) actions:操控面板 go to park entrance:去公园入口(最少要有一只恐龙才能开放,公园不高级门票又太贵的话会没人上门的哦) research:研究面板(快捷键F2,研发各种科技) declare emergency:发布警报(请赶在暴雨和龙卷风前发布....) go to chooper:去直升机(如果你有的话....) go to land cruiser:去游览车(同上) options:设置面板(常见的游戏设定,bobo就不多说了吧) 以上就是主画面下的各种面板,另外按TAB键能进入地图,点右上的weather能查看天气预报. 在点选恐龙后会出现orders(命令面板),这需要你拥有一个直升机平台 move:搬运(要等它们睡着才可以...) sedate:麻醉(为前者服务) retire:射杀(这种事自几来做比较过瘾~) immunize:种疫苗(2种,一种是单体种,一种是该种恐龙全部种) revive:治疗(博士mm用红字警告你时就得派上用场了) activate lethal gene:自动死亡(安乐死?) info:查看 species:星级(越高越能取悦游客) period:年代(生活在哪个时期) age:年龄 lifespan:寿命(这取决于DNA完成度) DNA:dna kills:杀死生物数 activity:目前行为(不同恐龙都不大一样,有兴趣观察观察?) health:状态 下面是可研究的科技列表 amenities:环境类 cash machine:现金兑换机(这对增加游客有好处) weather guard:雨伞(雨天里也照常开放,优先研究) fountain:喷泉(能少许改善游客心情) souvenir stand:记念品店(赚得不是很多) rest area:休息区(尽早研究就不用建长凳了) attractions:看台类 binoculars:高倍望远镜(给了望台增效,推荐研究) balloon tour:热气球(不实用!) viewing dome:地下看台(很适合肉食龙的展区) safari adventure:游览车(完全不实用!) dinosaurs:恐龙类 super extractor:加速提取(挖化石本来就比提取DNA慢多了,有必要吗?) growth booster:放大DNA(加速恐龙的孵化时间) activate lethal gene:自动死亡(上面的出现后才会有,从远程遥控破坏恐龙的DNA就能轻易地杀死它了,而且还是无痛的) hatchery immunization:蛋免疫(新出生的恐龙自动种下研究过的疫苗,省了好多事,和疫苗类优先研究!) auto lure:吸引诱饵(用处不很大,最后研究不迟) security:安全类 medium security fence:中电网墙(其时你只要能让肉食龙满足的话小电墙也够用了) high security fence:高电网墙 visitor shelter:避难所(公园必备!) security camera:监视器 sentry turret:机枪平台 avoidance beacon:声波塔 rangers:直升机类 gyro stabilizer:改进螺旋浆(使之能在恶劣天气下出动) double battery:双倍电力(加长直升机的飞行时限) retire:射杀(无语.......) vaccines:疫苗类(都是各种病的疫苗,因恐龙都可能患病或传染,需尽早研究,比如恐龙流感,恐龙肠胃炎,寄生虫等等,有兴趣自几看看吧~) 再是操作 基本是靠鼠标完成全部动作,但键盘也很好使,方向键能移动画面,R,F或滚轴能放大缩小,按鼠标右键或Q,E能左右转动,F1是任务目标,F2,F3,F4,F5则对应不同的面板,TAB是地图,M是查看消息,退格键是删除消息,回车是确定,空格是查看恐龙,esc是退出. 攻略心得 正规玩法就是公园模式,bobo习惯一上来先造个入口处(建在岛边缘)和孵化所,=孵化所刚造好一只恐龙后就开门,把钱雇了4队挖化石的开始大挖特挖,这时可以关上门(容我再准备准备,那只恐龙也让它自生自灭吧),同时开始研究科技,优先是蛋免疫和各种疫苗,还有雨伞和休息区等,因为化石队同时也能挖到财宝和琥珀,所以赚的钱不会比马上开放公园来得少. 顺便要说说琥珀,它能提供任意恐龙的DNA,虽然完成度加得多但是种类随机,很可能是已经100%的种类,所以卖掉它可能更合算些.化石品质为高(15%)中(9%)低(4%),很可能挖了n久还有些种类无法100%,所以在富裕时买现成化石也是不错的,100%DNA的恐龙寿命可是很长的. 等必要科技研究差不多了,化石也早挖光了吧?(这过程是很无聊的,但可以使用变速齿轮!)这就可以开始开放公园了,资金很可能比初期时还多(化石队?挖宝队?!)建设起来得心应手,先是一个低电网墙,范围要大(也不要太大,比如半个岛..),这样不会浪费墙数,还可以多装几种恐龙,大部分草食恐龙可以和平共处,而且不同的种类共处还能提高它们的快乐度.不要忘记墙内要留有大片水域,草食恐龙几乎总是不停地要喝水,它们生活也总在水边上.恐龙最多只能有60只,这可别忘了. 在展区内放养几种恐龙后把入口的路修过来,靠展区边建1个看台和了望台(初期是够了)给看台们改改名字,使之符合展示内容可以增加人气,沿路修一个食品店和几个厕所还有一个休息区,也别忘了派清洁工和造避难所(如果你能造的话),不造垃圾桶的话清洁工也会忙不过来的. 游客们是很好满足的,提高服务品质的同时也要提高各处门票物价(好快快消灭他们身上多余的钞票!haha)把路修得太长的话游客会不认路,所以还是在岛另一边再建一个公园入口和建设好些.如果入口在内陆的话往来的直升机会让恐龙们终日不得安宁. 好了,咱们也该歇歇了,去看看恐龙吧,因为是草食龙,所以无需特别喂食,满地是草呢~按空格键会显出恐龙的想法: 笑:开心中 奸笑:非常开心中.....(寒) 肉:进食 水:饮水 盾:恐惧 红脸:斗殴 恐龙:肉食类特有,表示狂野,需要让它狩猎来缓和一下 z号:睡眠 +号:患病中,需要特定疫苗 感叹号:绿色是生病,红色是暴走 2个小人:wc中...... 查看恐龙的话有时能看到皇冠,那是一种群居类恐龙的首领,一旦族群分散的话它们会尝试追寻首领或选出新首领.如果是大型肉食恐龙多半不能群居,更不能异种群居,它们总是要为地盘争个你死我活. 喂养肉食龙要注意的是要是它们压力太大的话就会暴走,不停地杀戮和破坏,麻醉和治疗可以安定它们,但是情况危急的话要毫不迟疑地杀掉它们.让它们活得开心才是治本. 在任务模式中需要用直升机杀掉肉食龙和用声波驱赶走散的草食龙,但游戏操作感太烂,跟本无法在时间内完成,最好能使用变速齿轮减速后慢慢瞄,(瞧bobo的爆头狙!haha)还有用观览车给恐龙照相,要照足足够的分数的密决是尽量把可能多的恐龙装在同一相片内,而且不要老拍同一种恐龙.被肉食龙追赶的话应该把它引到同样强的肉食龙面前,不然它是不会放弃的,成功的话它们会互相残杀,不过也可能一起追你...... 任务模式全部完成后就可进入自然模式,在没有人类的骚扰下恐龙们自由自在地在岛上生活,不需要什么电网,恐龙们自有它们的生存之道.玩完这个模式后差不多也是该del游戏的时侯了,关上pc,bobo慢慢睡着了,只见一只暴龙刚刚费尽心机猎杀了一只三角龙,当它刚要享用得来不易的美食时,前方传来一阵巨吼,元来是一只更大的暴龙出现了,两只暴龙为了食物大打出手,终于原主不敌访客伧惶而逃...醒来才觉是一梦,渐渐清晰的脑海还回荡着刚才的景象...而硬盘中早已没有了它的名字,让我们期待它的下一作吧~
IF只针对期刊来说的,与EI和SCI没什么关系,一般只是借助SCI来进行统计的,计算出IF。所以EI收入的期刊是有影响因子的,但没有借助EI来统计的。
EI没有影响因子,而且会议收录不是JA类型。
总有粉丝说自己投纯生信的时候总是被秒拒,秒拒再秒拒!这到底是什么原因呢?除了自己文章质量的本身问题,最大的问题就是没有选择到合适的期刊。有些期刊比较喜欢秒拒纯生信,就是因为它目前收到的稿件非常多,被很多人扎堆投稿过来,没有太多时间处理这些稿件,只能根据一些标题进行过滤秒拒。 有粉丝说在投纯生信的时候,基本都被 Genes、Genomics、The International Journal of Cancer 这些期刊秒拒。这些期刊影响因子本来也不低,难度会高一些,拒稿也很正常的事情。不过,这些期刊都是大众化的期刊,很多人都知道它们。因此,收到稿件往往比较多, 可能未来两年出版的文章都有了,所以拒稿率就特别高,特别是遇上扎堆投稿的时候,秒拒是常有的事情 。 当一本期刊大众化之后,人人都知道这本期刊对纯生信比较友好,都是认为比较好发,都往这本期刊上投稿,结果后面的人想投都投不了,因为人家怕了纯生信。 就好比这些低分的期刊: Med Sci Monit、Peer J、Molecular Omics ,投纯生信基本都是被秒拒的。虽然影响因子比上面的期刊低了很多,但是一样经常被秒拒,主要是因为过于出名,人人都认为它们好投,都想快点接收自己的文章,结果后面的纯生信基本都是被秒拒,除非你补实验验证。 假如你一名审稿人,期刊主编让你审一篇稿子,你可能会很爽快地答应, 但是让你审10篇甚至100篇,估计你就不愿干了 。同样的道理, 如果一本期刊再短期内收到上千篇纯生信,谁知道哪些是有意义的,哪些值得出版的,根本就没有办法送审的,也找不这么多的审稿人 ,人家要处理到猴年马月呀。在没有更好的办法的情况下,只能限制纯生信,让你补实验再做打算。 总来的来说,还是这句话:纯生信要想好发就必须创新,做没有人做过的或者少人做的东西,然后选择少人知道的而且愿意接收纯生信的期刊 。
挺好的。genes杂志是MDPI的经典OA期刊,genes杂志在影响因子、控制撤稿量上,都要优于genes杂志,且国内的风评也日渐好转。genes杂志是一本有趣的期刊。每5年一个周期。发文量从1000多篇,缓慢缩进到500多篇。
大家好,最近因为有需要了解甲基化作用,看到这篇文献,拿出来给大家分享一下,这是一篇关于揭示蛋白BANP与基因组的CGCG基序结合,从而激活必需基因表达的文章。
文章题目: BANP opens chromatin and activates CpG-island-regulated genes (BANP打开染色质并激活CpG岛调节基因)
期刊: Nature
影响因子: 2020_IF = ; 中科大类: 综合性期刊 1区; 中科小类: 综合性期刊 1区; JCR分区: Q1
发文单位: 瑞士弗雷德里克-米歇尔生物医学研究所,瑞士生物信息学研究所和瑞士巴塞尔大学等5家单位。
摘要: DNA甲基化是一种化学修饰,可以抑制基因的活性。哺乳动物基因组中RNA聚合酶II产生的大多数基因转录起始于CpG岛(CGI)启动子,然而我们对其调控的理解仍然有限。造成这种原因一方面是由于我们对转录因子、它们的DNA结合基序以及具体基因组结合位点在给定的细胞类型中起何种作用的信息不完整。另一方面,还有一些没有已知结合基序的孤儿基序,如CGCG元件,它与人类组织中的高表达基因相关,并在CGI启动子子集的转录起始点附近富集。在研究中,作者将单分子足迹与互作蛋白质组学相结合,以确定BTG3相关核蛋白(BANP)在小鼠和人体基因组上作为转录因子结合该元件。作者发现BANP是一种强大的CGI激活剂,可以控制多能干细胞和终末分化神经元细胞中的基本代谢基因。BANP结合在体外和体内被其基序的DNA甲基化所排斥,这在表观遗传学上限制了大多数与CGI的结合,并解释了癌细胞中异常甲基化CGI启动子的差异结合。当与非甲基化基序结合时,BANP打开染色质和核小体相。这些发现证实了BANP是一组重要基因的关键激活因子,并提出了一个模型,其中CGI启动子的活性依赖于能够打开染色质的甲基化敏感转录因子。
主要结果: 1. BANP在体内与CGCG元件结合 为了测试单个基序,作者开发了一种简化方法,将单个转录因子基序置于体外衍生序列中,并使用重组酶介导的盒交换(RMCE)将其插入小鼠胚胎干(ES)细胞的特定基因组位点。这些基序的占有率由单分子足迹(SMF)监测,SMF使用甲基转移酶足迹并通过亚硫酸氢盐测序获得(图1a)。在测试CGCG元件时,作者观察到一个显著的足迹(图1b),表明了未知因子的占有。为了鉴定结合蛋白,作者使用含有CGCG元件的寡核苷酸作为诱饵,在小鼠ES细胞核提取物中进行亲和纯化。质谱检测发现BANP是唯一的富集蛋白(图1c)。BANP是哺乳动物BEN结构域蛋白之一,被认为与核基质相关,并在转录抑制中发挥作用。接着,作者通过ChIP–seq确定检测到小鼠ES细胞中1302个可重复的峰(图1d),对前500个峰的独立k-mer富集分析确定CGCG元件为主要序列(图1e),称之为BANP基序。这些基序主要存在于启动子中,尤其是CGI启动子(图1d,f)。同时作者发现几乎90%的启动子与基序是结合的,有12%的基序位于远端(图1g)。这与BANP结合单个基序的能力不一致(图1b)。作者猜测BANP结合可能受到DNA甲基化的抑制。
2. BANP对DNA甲基化敏感 在DNMT三重敲除(TKO)细胞中,BANP在野生型细胞中甲基化的其他基序处结合并打开染色质(图2a,b)。尽管大多数这些基序位于启动子的远端,但一些启动子也表现出结合增强和高表达,表明BANP为依赖性上调。为了在体外检测BANP的DNA结合,作者使用纯化的重组全长蛋白进行电泳迁移率转移和荧光偏振分析,发现BANP可以在体外特异性结合其非甲基化基序,基序甲基化使亲和力降低六倍以上(图2c)。为了确定BANP的结合特异性及其甲基化敏感性在人类细胞中是否保守,作者在两个表现出DNA甲基化异常模式的人类癌症细胞系中测定了其结合情况(图2d),得出BANP在体外和体内特异性地直接结合到其未甲基化CGCG基序,体内结合解释了癌症特异性基因组结合事件。
3. BANP驱动重要基因表达 作者使用RMCE系统将一个具有三个BANP基序的报告基因插入基因组,并将其与已知CGI结合激活子的三个基序和已建立的强CGI衍生启动子(PGK)进行比较(图3a)。BANP基序导致表达增加近3000倍,比其他测试基序(如NRF1)至少高15倍,仅比PGK启动子低倍,表明BANP基序在染色质中具有强烈的自主激活。在BANP降解后,大多数结合基因快速下调(图3b,c),同时在蛋白质组中也检测到延迟但镜像下调(图3d)。这些结果表明BANP是CGI岛调控基因的一个重要子集的有效激活剂。虽然BANP结合在神经元中大部分是保守的,但一些CGI启动子显示出差异结合(图3e,f)。
4. BANP在CGIs处打开染色质 作者通过ATAC-seq分析转座酶可及染色质来确定BANP对开放染色质的影响。在BANP降解后,一小时后可及性已经降低,后续变化很小(图4a,b),这表明BANP在其CGCG基序中(甚至在CGI中)一直具有较高的可及性。为了了解结合是否影响核小体及其位置,作者进行了MNase-seq,确定了结合的BANP基序周围的高相位核小体(图4a,c,)。最后,作者检测了初生组织中BANP基序是否存在开放染色质。DNaseI足迹被检测到主要在CGI(图4d),这表明BANP结合和染色质开放在所有检测的初生组织中都是保守的。
在该研究中,作者鉴定出一种新的开关,它可以调控小鼠和人类基因组中的必需基因。识别缺失的基因开关及其功能对于全面了解健康和疾病的分子基础至关重要。
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参考文献: Grand, ., Burger, L., Gräwe, C. et al. BANP opens chromatin and activates CpG-island-regulated genes. Nature (2021).
一、专注于肿瘤研究的杂志很多,国外的杂志可以从影响影子参考其权威程度,2018年肿瘤专业期刊的影响因子排名前10的杂志如下(影响因子越高,权威性越高):1 CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS 影响因子是 NATURE REVIEWS CANCER 影响因子是 LANCET ONCOLOGY 影响因子是 JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY 影响因子是 Nature Reviews Clinical Oncology 影响因子是 Cancer Discovery 影响因子是 CANCER CELL 影响因子是 JAMA Oncology 影响因子是 ANNALS OF ONCOLOGY 影响因子是 JNCI-Journal of the National Cancer Institute 影响因子是二、综合性杂志,例如《自然》、《科学》,还有医学四大顶级期刊《新英格兰医学杂志》、《柳叶刀》、《JAMA》、《BMJ》也会发表肿瘤相关研究,其研究结果肯定也是很权威的。三、中文肿瘤研究杂志也有很好的,例如中华医学会系列的《中华肿瘤杂志》等。其它中华系列杂志也会发表肿瘤相关研究,例如《中华妇产科杂志》也会发表妇科肿瘤相关文章,也是比较专业的。
因为当前欧美等国的医学科技还是更先进一些的,所以一些重要的研究成果都发表在这些国家的杂志上面,所以这些杂志确实是更权威一些的,大部分都是英文杂志。专注于肿瘤研究的杂志很多,我们可以从影响影子参考其权威程度,2018年肿瘤专业期刊的影响因子排名前10的杂志如下(影响因子越高,权威性越高):1 CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS 影响因子是 NATURE REVIEWS CANCER 影响因子是 LANCET ONCOLOGY 影响因子是 JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY 影响因子是 Nature Reviews Clinical Oncology 影响因子是 Cancer Discovery 影响因子是 CANCER CELL 影响因子是 JAMA Oncology 影响因子是 ANNALS OF ONCOLOGY 影响因子是 JNCI-Journal of the National Cancer Institute 影响因子是另外,国外一些综合性杂志,例如《自然》、《科学》这样的多学科权威杂志,还有医学四大顶级期刊《新英格兰医学杂志》、《柳叶刀》、《JAMA》、《BMJ》也会发表肿瘤相关研究,其研究结果肯定也是很权威的。
尖端治疗杂志是做的很好的肿瘤研究期刊杂志,是国外的一个肿瘤研究期刊杂志,他们上面有无创治疗、靶向药物输送、细胞和基因疗法、个性化药物和药理学等方面的权威文章。
一区sci期刊有哪些如下:
一区sci期刊有Nature和Science,一区sci期刊还有Cell Metabolism 、Cancer Cell、Science Advances、Cell Reports、Nature Microbiology、Nature Biotechnology、Autophagy、Journal of Hepatology、Hepatology、Circulation等刊物,这些刊物在本专业中都是顶尖刊物,发表难度也是可想而知的。
国内也有很多优秀刊物被检索收录,这部分刊物也是国内作者发表sci论文选择刊物时首先会关注并选择的,包括Cell Research、Mol Cell、Cell Discovery、Fungal Diversity、Molecular Plant、Protein & Cell、Cellular & Molecular Immunology、Bone Research等等。
一区二区是sci期刊特有的期刊分类标准,sci将其检索的期刊按照影响因子高低分为四个区,也就是一区二区三区四区,四个区中对应不同的刊物,四个区中一区影响因子最高,四区最低,所以一区二区论文对应的就是发表在一区期刊和二区期刊的论文。
moleculars客座编辑的版面费免费吗收钱的,不免费那各个杂志的版面费究竟多少钱呢?小编已经为你准备好,一睹为快吧(开放存取的价格)。1带头大哥 CA神刊 CA 你们就别想了吧,一年就发表 50 篇文章,国人在上面的发稿量屈指可数,版面费为 3000 美金。2医学四杰 : NEJM, Lancet, JAMA, BMJ医学四杰发稿量相对 CA 多点儿,每年 1000 篇左右,但是国人的发稿数量也是寥寥无几,版面费稍微了解一下。期刊 费用(OA,美元)NEJM 2000Lancet 5000JAMA 3000BMJ 25003三大主刊 CNS期刊 费用(OA,美元)Nature 基本免费Science 基本免费Cell 5200最近几年,随着科研经费的持续增加,国人在三大主刊上的发文量逐渐增加,虽然是星星之火,但是有燎原的趋势。4国人热衷的 OA 期刊期刊 费用(OA,美元)Nature Communications 5200Oncotarget 3400Scientific Reports 1760Plos one 2095Medicine 1950Nature Communications 也是一个奇迹,短短几年,刊文量接近 4000 篇,版面费为 5200 美金。Oncotarget 的版面费为 3400 美金,每年出版量稳稳的 7000 篇,国人发稿超过一半。Scientific Reports 的版面费为 1760 美金,不算贵,但是它走的是薄利多销路线,每年 20000 篇的刊文量让其他杂志望尘莫及。Plos one 和 Scientific Reports 一样,走的是薄利多销路线,虽然单篇版面费 2000 美金,但是刊文量同样超过 20000,但是它的命运可不乐观,随着影响因子在 3 分生死线上徘徊,无数国人不敢在把文章砸在 Plos one 上,所以近一两年,Plos one 刊文量逐年下降。Medicine 现在算是毁了,2015 年影响因子从 暴跌至 后就再也没有上来,因此发文量不多,只有 3000 多篇,版面费也不贵,但是达不到毕业要求,因此投稿的国人越来越少了。5国产期刊期刊 费用(OA,美元)bone research 3975Cell research 3300Cellular & Molecular Immunology 3300Science Bulletin 2500bone research:自从搭上 npj 后,立马进入快车道,影响因子青云直上,有做国内龙头老大的趋势,虽然它的版面费比较贵,达 3975 美金,但是每年刊文量 30 篇不到,可见它是冲着影响力去的。Cell research:和 bone research 一样,Cell research 注重稿件的质量,虽然版面费收取 3300 美金,但是能看到国产期刊蒸蒸日上,国人还是很乐意支付的。Cellular & Molecular Immunology:要想期刊办得好,必须加入 npj 快车道,由中国免疫学会和中国科技大学共办的 Cellular &Molecular Immunology 杂志这些年也是顺风顺水,影响力逐渐增大,如果 3300 美金的版面费能换一个强大的国产期刊,我们将毫不犹豫。Science Bulletin:它加盟的是世界上最大的出版商 Elsevier,目前还处在发展阶段,每年的刊文量仅有 10 来篇,2500 美金的版面费真心不贵。下面列举一下版面费超过 5000 美金的杂志(都按开放存取来算)。期刊 费用(OA,美元)Cell 5200Nature Communications 5200Cell Reports 5000Advanced Energy Materials5000Journal of cell biology5000Cell Chemical Biology5200Cell Host & Microbe5200Cell Metabolism5200Cell Stem Cell5200Cell Systems5200Progress in Planning
英文文献的影响因子的看法如下:查询外文期刊影响因子我们可以用Web of Science数据库查找,该库是是获取全球学术信息的重要数据库。
一、期刊的影响因子是什么?
期刊的影响因子(Impact factor,IF),是表征期刊影响大小的一项定量指标。也就是某刊平均每篇论文的被引用数,它实际上是某刊在某年被全部源刊物引证该刊前两年发表论文的次数,与该刊前两年所发表的全部源论文数之比。
计算公式:IF(k)= (nk-1+nk-2) / ( Nk-1+Nk-2)。
二、如何查询期刊影响因子
首先,查询影响因子要知道具体的查询地址,外文期刊和中文期刊的查询地址不同。
1、查询外文期刊影响因子,可使用外文数据库Web of Science中的JCR,其中JCR Science Edition 用于查询自然科学类期刊,JCR Social Sciences Edition用于查询人文社会科学类期刊。
2、查询中文期刊的影响因子,可使用中国学术期刊(光盘版)电子杂志社和中国科学文献计量评价中心联合推出的《中国学术期刊综合引证报告》(万锦堃主编,科学出版社)。有需要的读者请到图书馆咨询部查询。
其次,查询影响因子必需知道期刊缩写名,这个有很多规则,具体如下:
1、单个词组成的刊名不得缩写
部分刊名由一个实词组成,如Biomaterials,nature,science等不得缩写。
2、刊名中单音节词一般不缩写
英文期刊中有许多单音节词,如FOOD,CHEST,CHILD,这些词不得缩写。如医学期刊hearand lung, 缩写为Heart Lung,仅略去连词and.但少数构成地名的单词,如NEW,SOUTH等,可缩写成相应首字字母。
如New England Journal of Medcine,可缩写为N Engl J Med,不应略为New Engl J Med,South African Journal of Surgery可缩写为S Afr J Surg,不可缩写为South Afr J Surg.另外,少于5个字母(含5个字母)的单词一般不缩写,如Acta,Heart,Bone,Joint等均不缩写。