核酸适配体毕业论文

关于促进核酸适配体领域合作的提议及投票结果 罗昭锋 【题记】在2018年11月10-11日，举办的第四届中国核酸适配体学术研讨会上，在10日下午最后的讨论环节，预设的讨论主题是“如何推动核酸适配体领域的相互合作”。主办方提出将核酸适配体产业链不同环节的工作量（权重）进行投票，以便为不同的研究单位之间相互合作提供一个可以参考的合作标准。 由于筛选是整个产业链的第一环节，所以投票的初始假设是：如果假定筛选一个靶标的核酸适配体其工作量（权重）定义为10，那么其它环节的工作量大约占多少。投票利用微信完成，每个微信号只能投一票，共有165人参与投票。投票结果如下：     如果将筛选一个靶标适配体的工作量定义为  10；     对适配体进行改造与修饰的工作量大约为  ；     完成检测方法开发，工作量大约为  ；     做成检测与诊断试剂盒，并具备申报资格，工作量应高于 。以下是投票的具体结果。 问题1：你是否认同将产业链上不同环节设置一定权重的方法？ 该项提议得到 的支持率，其中表示非常认可；仅有表示不认可；的人弃权。 具体投票数据为： （34+111）/（34+111+16+6）=145/167= 表示认可；表示非常认可；表示不认可；的人弃权。问题2：如果筛选适配体的工作量按照10来计算，你认为改造与修饰的工作量大约占多少比例比较合适？ 分值票数分值x票数 该项的加权平均分值为：1110/165= 问题3：如果筛选工作量按10计算，你认为检测方法开发的工作量应该占多少比例？分值得票数 该项的投票结果为：问题4：完成诊断试剂盒开发，并具备药监局申报条件， 分值得票数由于这一项最高值只设置了100，从投票情况来看，上限设置过低，导致实际的得分可能远低于大家预期的值。但是，如果一个项目能做到临床，也值得深入探讨一下具体的合作方式。后记 这个投票并不是指望制定一个统一的标准，只是为不同的团队之间合作时提供参照。对于成熟产业链上的合作来说，只要对不同的产品定价即可，但是对于科研合作来说，很难对某一部分研究进行定价，这导致不同团队之间的科研合作缺乏可参照的标准，往往就会导致无法合作。 这个投票结果，主要价值就是给大家一个参考。其实我们都知道，即便同样是筛选，不同靶标的筛选难度也大不相同。但如果我们过于纠结利益问题，可能就无法进行有效的合作。 我们相信，这个参考标准的推出，一定会有利于不同团队之间的合作，减少沟通的成本。目前的科研合作，往往只能在关系亲密的团队之间进行，有了一个相对客观的参考标准，也许可以有利于在更广的范围内进行合作。我们也希望所有适配体产业相关的人士，能积极给我们提供反馈，推动建立不同团队之间的合作规范，促进这个领域的发展。如果大家有什么意见，欢迎邮件反馈给我们。广告： 小分子的核酸适配体筛选试剂盒 （包括小分子筛选的全套试剂，如磁珠，文库，引物，PCR mix等等），以及部分筛选相关试剂，购买后可以立即开展筛选工作。大大降低摸索实验条件的成本，减少试错，缩短筛选周期。同时筛选过程中，还可以获得全程的技术支持，大大提升筛选成功率。

20190106 搞实验研究的，你的实验记录本早该撕掉了200min 【目标读者】 教授，科技工作者，创新型企业，实验室负责人，希望提升科技创新效率的人士。我相信这篇文章可以解决长期困扰很多科研工作者的问题，特别是实验室的PI。 【内容摘要】 纸质的实验记录，只能记录文字信息，无法记录图像，无法保存电子文件，导致数据分散在不同地方，不便查阅，不便实现团队内的共享，无法随身携带，也不便检索，也不便追踪，这种工业时代的产物早该淘汰了。现在信息社会，我们应该有更好的方式去管理我们的实验记录，提升科研效率。这篇文章主要想分享我在实验记录管理方面的经验。 【撰稿背景】 实验记录是一个实验室最宝贵的资产。由于管理方式的低下，这笔重要资产没有办法充分利用，无法实现知识经验的传承与共享，极大影响了中国科研工作者的创新效率。如何去充分利用这笔资产，如何通过实验经验的共享传承，促进一个团队的成长，提升科研团队的产出，其实早已有了更好的方式。人类社会早已由工业社会进入了信息社会，并在开始向智能社会迈进。但是工业社会的很多工作方式一直保留到现在。譬如像手写实验记录本就是其中的典型。这种工作方式是不能够适应社会快速发展趋势的。 既然是做科研的，做创新的，我们就应该有质疑精神，少一些想当然，少一点固执。对于实验学科来说，我们撰写实验记录，当然是非常重要，但是我们可以去思考一下，有没有更好的方式，现在的方式有没有什么缺点？有时候，我和一些教授们分享电子实验记录，经常会引来质疑：电子记录，记录着篡改了怎么办？抄袭怎么办？（通常我不喜欢和人争辩，电子记录可以记录所有的修改痕迹，连修改的时间都有记录。这是纸质记录无法比拟的。） 时光回转到2008年，我自己记了数10本的实验记录本。但是记完之后，自己几乎从来不愿意去再翻动它。原因很简单： 第一，我不能随身携带，只能在实验室去翻阅它。 第二，记录不全面，经常发现自己想要的信息，没有记录下来； 第三，只能记录文字信息，而不能够保存图片颜色甚至过程。 对于实验中的现象，也只能用文字去描述，而不同时间、不同人对文字理解是完全不同的； 第四，实验过程中会有很多原始数据，这些电子版的数据，我很难放到实验记录本里面来，只能放在电脑里面，所以我的记录会分散在纸质记录本和电脑上； 第五，经常还会出现一个尴尬的事情，自己写的实验记录，自己看不明白，甚至说有时候写得比较潦草，字都不认识了。更别说给别人看，或者参考别人的实验记录了。     上面简单的分析你可以看到，尽管实验记录是一个团队最重要的资产，但是手写的实验记录极大地浪费了这笔无价的资产，因为它很难去利用，很难实现团队内的共享。 【时间成本】 有人可能说，传统的实验记录怎么不能共享了。是的，可以共享。我们现在来设想几个场景，看看完成一次资料共享，效率如何。 场景：实验室新来的小弟，师兄的毕业论文没有写摸索实验条件的过程，要参考已毕业师兄的原始实验记录。  我们知道毕业论文或发表论文所记录的信息，很多是不全面的，特别是很多失败的记录，摸索条件的过程，都没记那么清楚，所以很多时候还是需要去参考最初的原始记录。如果在一个管理比较完善的实验室，要查询实验记录怎么办呢？ 首先要征得老师同意，然后找到实验室的管理员找到存档的实验记录本。由于无法去直接搜索，所以只能一本一本的去翻阅。如果幸运的话，也许能够找到原始的记录。假设原始的记录人写字比较工整的话，应该也可以看清楚他写的是什么。 就算是所有想找的信息，他都记录清楚了。如果还有一些仪器数据，肯定也只能放在电脑中。所以还得查找电子的实验文件。这样才有可能把原始记录和它的结果对应起来。 所以，传统实验室要想查询原始实验记录，这是非常麻烦的事情，我们可以看到上面简单的一个过程，没有一个小时是无法去完成的。但是，如果说是完全电子化实验记录的话，这个过程只需要一分钟不到就可以去完成。而且不光可以找到原始记录，原始的实验数据文件，以及对数据的分析处理，也都可以找到。 一分钟和一小时带来的差异是什么？人们根本不愿意去查找哪些纸质的记录，不愿意参考之前的记录。那些花费大量经费沉淀下来的经验，只能无人问津地躺在那里。后人只能再去探索，做无谓的重复。当一个实验室，某方面的工作出现中断的时候，这种反复摸索的事就会经常发生。 在我们学院某实验室，实验室负责人告诉我，他们实验室的学生毕业的时候，需要花1到2个月的时间进行各种资料的交接。在我的介绍下他们现在全部改用为知笔记，毕业时的交接不再是个事儿了。节约的每一分钟的时间，其实都是节约了社会的资源，节约了宝贵的创新资源。 【共享意识】 社会怎么进步的，就是因为有了人们的知识的共享。一个实验室怎么才能够更高效的运转，更快的发展，就是要充分发挥实验室成员的集体智慧，相互传帮带。我还听说过有些实验室学生之间，相互不知道对方在做什么，而且实验室内部不鼓励大家相互交流，我很难理解这是什么样的一种文化，好在这是罕见的例子。 【数据安全】 有人担心实验记录存在云端，安全吗？关于这个问题，我说三个例子： 第一，现在越来越多人把钱存在网上，用支付宝，用微信钱包，有没有担心过我钱被偷掉呢？我相信绝大多数人发现钱变得更安全了，不怕小偷了。数据存在云端，我认为会比本地更安全。担心安全是有必要的。怀疑不安全而不去使用，其实只是意识问题。 第二，我自己亲身的例子。2014年的9月，我的笔记本被偷过，我的台式机的电脑硬盘坏过，而且找人恢复也没有恢复不过来，丢失了大量的数据。 第三，我们学院神经口的一个实验室，几年前向他推荐为知笔记的时候，他也特别说到云端不安全。所以我也给他推荐了本地的解决方案。最近问他主要用云端还是用本地的电子笔记时，他说主要是用云端的。原因很简单，他不管出差到哪个国家，在什么地方，随时可以了解实验室的进展情况。所有人的实验记录，详细数据，实验步骤，他都可以看得一清二楚，不用再去打电话或者微信，一一沟通。节省了他大量的沟通时间。 其实，提供这种笔记服务的公司，有专门的团队去做数据安全备份，而且都是容灾备份。所谓容灾备份是一般在本地有一个备份，在其它城市还会有一个备份，即便一个城市的机房发生了火灾或者地震，依然有机会挽回你的数据。我现在越来越相信云端，我的工作模式主要都是在云上。我用的主力同步工具是两个，一个是为知笔记，一个是坚果云。我自己常用的工作电脑有三台，一台移动的笔记本，两台台式的，还有若干pad，手机。有了上面这这个工具，我可以随时在任何一台电脑上开始工作，而且可以保证工作的连续性。其实，有时候还会在移动端手机上开展工作，有了为知笔记+坚果云，工作可以随时随地。 【电子记录的必要性】 为什么很多人觉得电子实验记录不是个事儿？真的有必要吗？ 对于短平快的课题，三个月写篇文章，实验记录记得再烂，随便怎么记都不是问题，当事人应该能记得很清楚怎么做的。 但是，如果说是一个从事基础研究的团队，这个研究可能要跨越五年甚至十年。如果是依然使用纸质记录的话，我们很难去查询之前的实验结果，就可能会反复要去重复同样的实验。这样就会大大影响研究的进展。所以我觉得要想做一些重要的成果，特别是要啃那些硬骨头的话，我觉得电子记录就非常重要。 我自己一直在从事核酸适配体筛选机理和方法方面的研究，这个课题已经成持续了超过十年。由于我们都有电子实验记录，所以我们经常会把几年前的实验记录翻出来再看一看，或者有新的同学进到实验室，还会让他们去参考多年前的实验结果。这样可以让整个研究更具延续性，让所有的工作都是站在前面基础之上，而不是从头开始。如果是纸质的记录，这是很难实现的。 【解决方案】 我个人并不推荐专门的电子实验记录系统。成本昂贵，不便使用，也不便数据共享。除非是像大的制药企业，对流程有严格的控制，对数据格式有特定的要求。对一般十几人到几十人或者百人这样一个探索性的研究团队来说，我认为用电子版的笔记软件更合适、更自由，也更具性价比。 另外还有一个原因是这样的工具更具通用性，并不仅仅适用于实验记录，同时可以用于平时的学习和工作上的一些记录，所以这样就减轻了使用者学习新工具的负担，他们学习的是一个通用工具，即便今后离开实验室，这个工具依然非常有用。 类似的工具有： 为知笔记 有道云笔记 印象笔记和微软的onenote（分别对应于下图从左至右）。从用户群来说，目前国内用户最多的应该依次是有道云笔记、印象笔记、为知笔记和onenote。 对于实验记录来说，我个人推荐为知笔记。有道云笔记、印象笔记对于大众用户来说，这两个在使用体验上来说，可能略比为知笔记更好。onenote是微软出品的工具，特点是功能强大，使用不那么方便，同步有时候也会有问题。对于实验室团队使用来说，基本可以不予考虑，下面也不再展开讨论。如果说你是surface电脑的用户，onenote还是有些不错的体验。 1、印象笔记：来源于美国的evernote,也是我寻找电子实验记录工具所使用的第二个软件。更早的时候，我是用google的google wave，很多人都不会听说过的一个产品，只存活了2年左右就被关闭了。放弃使用evernote的原因也很简单，后来国内访问体验越来越差。再到后来，国内推出了印象笔记，我也很快成了印象笔记的用户。不过遗憾的是，早期的印象笔记并不提供团队协作的功能，所以实验记录这一块，自从放弃了evernote，也从没再回到过evernote或者印象笔记。 2、为知笔记：在2011年左右，正在苦苦寻找电子实验记录的我，发现了为知笔记，也看过博主 善用佳软（张玉新）的介绍，我们因此逐渐成了好友。后来开始使用为知笔记作为团队的唯一电子实验记录工具，一直使用至今。有一次，碰到问题在线上咨询，恰好碰到为知笔记的创始人帮我解答问题，后来也成了好友。 3、有道云笔记：网易出品，功能有很多可圈可点的地方，体验也不错。其实，我也是有道云笔记的用户，语音笔记，实时转文字并保留语音录音，这个功能我就很喜欢。还有pdf OCR识别，翻译功能都很赞。 凭心而论，如果只是个人使用，三个都可以，体验也不相上下，各有所长，有道云笔记和印象笔记都比较轻快。但是如果你的笔记数量很多，每年上千条，还希望团队成员也来使用，这时候对功能的要求将变得更加重要。此时，我推荐为知笔记。也就是说，重度知识工作者，我一律推荐为知笔记。 为知笔记想对性价比也是最高的。年费60元，每月10G上传流量，空间无上限。其它的自行比较一下。 推荐为知笔记还有一个原因，为知笔记是唯一提供本地解决方案的公司。对于数据保密有极致追求的团队来说，这是一个大大的福音。如果专门架设电子实验记录系统，费用高昂。而为知笔记盒子就是一台服务器电脑的费用，不到2万元，这个价格还是可以接受的。下图就是我购买的为知盒子，方方正正的小黑盒，比传统机箱一半略高一点。 【心经】 如果你不是对保密有极致追求，我推荐你不要购买这个（不是黑为知笔记，也不是黑这个产品）。我自己使用下来后，我还是愿意用云端产品，随时随地都可以访问，极大提升了工作效率。本地虽然安全性提升，但是只能在本地访问，会损失云端的便利。所谓有得必有失。我自己购买的这个目前主要就是起个备份的作用，主力还是使用云端服务。我给身边的人推荐过为知笔记，发现科研实验室都倾向用云端，而一些小型企业，科技创新型企业，愿意选择本地的解决方案。 【电子实验记录的其它解决方案】 有的人自建wiki，不太推荐，手机端访问不便。数据安全性并不见得更好。 有人用坚果云来管理，也不推荐。虽然坚果云是我用来同步文件资料的主力工具，但它不是笔记类工具，不能创建文件，同步资料可以，用来做记录就不是它擅长的了。 【结论】 对于科研团队来说，实验记录是最宝贵的资源。一要长久保存，二要便于分享，便于检索，这样才便于利用。前人积累的经验才能更好地传承。 这里提到的为知笔记、有道云笔记、印象笔记和onenote四个工具，对于个人使用，几个都可以，就看个人习惯了。 对于团队使用，我推荐为知笔记。 参考资料： 1、为知笔记  不会使用为知笔记，可以参考我的课程 2、有道云笔记  3、印象笔记  4、onenote 

适配体，顾名思义，就是比较适合配合配对配种---的东西，而我们通常所说的适配体是核酸适配体的简称，但是核酸只是一个限定性词语，核有两种含义，一种是核心，一种是微观，核酸是核糖核酸的简称，也就是DNA和RNA，这两种东西就是螺旋链，我们肉眼可看到的螺旋链和我们肉眼看不到的螺旋链其实都是一样的，不同之处在于，肉眼看到的可以用肉眼看到的范围的链子来匹配，肉眼看不到的就需要用肉眼看不到的链子来匹配，于是就有了适配体这种高精尖的微观螺旋链，而且专门用来和其他成型的螺旋链进行配对。 学术话语： 核酸适配体是一小段经体外筛选得到的寡核苷酸序列,能与相应的配体进行高亲和力和强特异性的结合,它的出现为化学生物学界和生物医学界提供了一种新的高效快速识别的研究平台,并在许多方面展示了良好的应用前景。 中文名称：适配体英文名称：aptamer 定义：能与蛋白质或代谢物等配体特异和高效结合的RNA或DNA片段。通常用体外筛选方法制备得到。